264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2783 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
556 aa  1025    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.21 
 
 
535 aa  528  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3336  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.86 
 
 
521 aa  206  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.45187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1824  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  32.02 
 
 
518 aa  199  7e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147268 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0485  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.53 
 
 
576 aa  187  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0456  ABC phosphonate transporter, fused inner membrane subunits  40.35 
 
 
576 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0490  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.07 
 
 
576 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0103  ABC-type phosphate/phosphonate transport system permease component  25.43 
 
 
516 aa  150  8e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.45 
 
 
510 aa  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3020  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.39 
 
 
570 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 
539 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.687292  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.29 
 
 
511 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115761  normal  0.0544773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1322  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.03 
 
 
533 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497345  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
275 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141056  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14291  putative phosphonate ABC transporter  35.35 
 
 
521 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3199  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.93 
 
 
275 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0131264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.39 
 
 
275 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0693  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.74 
 
 
275 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0773426  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0852  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.53 
 
 
431 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
504 aa  111  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19770  phosphonate ABC transporter, permease component  36.82 
 
 
276 aa  111  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0593864  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0826  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  39.07 
 
 
275 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107681  normal  0.0222039 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
282 aa  109  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000186214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0789  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  42.76 
 
 
275 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3945  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.8 
 
 
294 aa  108  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.351226  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3236  phosphonate ABC transporter permease  35.1 
 
 
276 aa  107  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0250  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  30.32 
 
 
277 aa  106  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
279 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0800707  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1804  ABC transporter permease  36.55 
 
 
277 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21150  ABC transporter permease  38.1 
 
 
277 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454841  normal  0.839555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.21 
 
 
277 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2675  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.36 
 
 
297 aa  103  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0563966 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0692  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.66 
 
 
255 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.056532  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2432  phosphonate ABC transporter permease  40.79 
 
 
275 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236507  normal  0.0603094 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0671  putative phosphonate ABC transporter  28.77 
 
 
500 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1689  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.06 
 
 
523 aa  101  4e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.365245 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0127  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  25.26 
 
 
266 aa  101  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3965  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.78 
 
 
272 aa  101  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.692533 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 
523 aa  101  4e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0132  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  25.26 
 
 
266 aa  101  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.02 
 
 
272 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0788  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  41.96 
 
 
255 aa  100  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1617  phosphonate ABC transporter permease  36.61 
 
 
284 aa  99.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.36633  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2012  putative ABC transporter inner membrane component  30.14 
 
 
271 aa  99  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100736  decreased coverage  0.00339933 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2238  phosphonate ABC transporter permease  39.87 
 
 
281 aa  99.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
509 aa  97.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.02 
 
 
276 aa  97.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0868  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.05 
 
 
255 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  32.81 
 
 
275 aa  97.1  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2185  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.03 
 
 
290 aa  97.1  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0595  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.57 
 
 
264 aa  97.1  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808391 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07281  putative phosphonate ABC transporter  28.93 
 
 
516 aa  96.7  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.058351  hitchhiker  0.00530258 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0131  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component  30.63 
 
 
289 aa  96.7  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0113761  hitchhiker  0.00000772966 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2284  phosphonate ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 
266 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0852833  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1803  phosphonate ABC transporter permease PhnE  35.16 
 
 
256 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17510  Phosphonate transport systems inner membrane component  32.59 
 
 
269 aa  95.9  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.56 
 
 
276 aa  95.9  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.56 
 
 
276 aa  95.9  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.54 
 
 
501 aa  95.1  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.213097  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
488 aa  95.1  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0381583  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3311  putative phosphonate ABC transporter, permease protein  31.09 
 
 
503 aa  94.4  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.251777  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1720  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.57 
 
 
278 aa  94.4  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000362895 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1292  putative phosphonate ABC transporter  35.75 
 
 
510 aa  94  6e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.871722  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0998  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.1 
 
 
265 aa  94  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2431  phosphonate ABC transporter permease  43.06 
 
 
255 aa  94  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0629355  normal  0.0565288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0827  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  35.56 
 
 
255 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0220667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0853  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.56 
 
 
255 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4577  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.34 
 
 
271 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1925  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  30.6 
 
 
272 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.77597  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4522  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
280 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1320  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.44 
 
 
294 aa  92.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34 
 
 
277 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34 
 
 
277 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.81 
 
 
499 aa  91.3  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.440289  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3860  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.88 
 
 
293 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.206995  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3326  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  27.13 
 
 
365 aa  90.9  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.95 
 
 
271 aa  90.5  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  35.95 
 
 
271 aa  90.5  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.32 
 
 
270 aa  90.5  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.95 
 
 
271 aa  90.5  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 
271 aa  90.1  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 
271 aa  90.1  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 
271 aa  90.1  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  35.29 
 
 
271 aa  90.1  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.08 
 
 
506 aa  90.1  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.539581  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.44 
 
 
269 aa  89.7  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6356  phosphonate ABC transporter, permease protein  34.67 
 
 
298 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.690717  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1768  ABC transporter complex for phosphonate inner membrane binding subunit  34.04 
 
 
496 aa  89.4  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0117243  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.44 
 
 
263 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3472  phosphonate ABC transporter permease  33.1 
 
 
267 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.153404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3438  phosphonate ABC transporter, permease  33.1 
 
 
267 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.573649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3389  phosphonate ABC transporter, permease  33.1 
 
 
267 aa  89  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00227176  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3747  phosphonate ABC transporter permease  33.1 
 
 
267 aa  89  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.375049  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0837  ABC phosphonate transporter, inner membrane subunit PhnE  36.11 
 
 
280 aa  89  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3701  phosphonate ABC transporter, permease protein  33.1 
 
 
267 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21140  ABC transporter permease  34.38 
 
 
256 aa  89  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0807284  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
496 aa  88.6  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3370  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.1 
 
 
267 aa  88.6  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 
341 aa  88.6  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 
341 aa  88.6  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>