More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2888 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
263 aa  526  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1747  phosphonate ABC transporter permease PhnE  87.5 
 
 
264 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20330  phosphonate ABC tranporter permease protein  90.8 
 
 
264 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.293398  normal  0.582568 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  72.62 
 
 
259 aa  406  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  73 
 
 
259 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  73 
 
 
272 aa  395  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  73 
 
 
259 aa  395  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  75.3 
 
 
259 aa  395  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  73 
 
 
259 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  73 
 
 
259 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  72.24 
 
 
259 aa  390  1e-107  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  70.4 
 
 
270 aa  377  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0827  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  71.37 
 
 
267 aa  376  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.152622  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2249  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  84.28 
 
 
262 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.859646  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2557  phosphonates ABC transporter, permease protein  83.41 
 
 
262 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108995  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  66.15 
 
 
269 aa  370  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  71.37 
 
 
266 aa  362  3e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4179  phosphonate ABC transporter permease  67.78 
 
 
288 aa  355  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0183  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  73.59 
 
 
267 aa  349  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685184  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4522  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  66.54 
 
 
280 aa  348  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0773  phosphonate ABC transporter permease  67.95 
 
 
292 aa  347  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.741951  normal  0.989098 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0837  ABC phosphonate transporter, inner membrane subunit PhnE  66.54 
 
 
280 aa  345  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4621  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  67.6 
 
 
280 aa  344  1e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438003 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  66.67 
 
 
271 aa  324  9e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  66.67 
 
 
271 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  66.67 
 
 
271 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  66.23 
 
 
271 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  66.23 
 
 
271 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  66.23 
 
 
271 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  66.23 
 
 
271 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  59.75 
 
 
277 aa  301  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  59.75 
 
 
277 aa  301  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03936  hypothetical protein  69.27 
 
 
205 aa  278  6e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  55.82 
 
 
271 aa  266  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0394  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  55.87 
 
 
679 aa  231  6e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.417915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  46.09 
 
 
272 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03935  hypothetical protein  77.87 
 
 
122 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3326  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  43.24 
 
 
365 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.8 
 
 
276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.8 
 
 
276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.4 
 
 
276 aa  178  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4996  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.25 
 
 
264 aa  176  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0396446  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1319  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.56 
 
 
287 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758207  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1320  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.57 
 
 
294 aa  170  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  36.82 
 
 
275 aa  168  8e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3702  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.88 
 
 
264 aa  168  9e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000191718 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3473  phosphonate ABC transporter permease  35.88 
 
 
264 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3748  phosphonate ABC transporter permease  35.88 
 
 
264 aa  168  9e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3380  putative phosphonate transport system permease protein htxC phnE  43.3 
 
 
273 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3390  phosphonate ABC transporter, permease  35.88 
 
 
264 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0936447  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0177  phosphonate ABC transporter permease  37.99 
 
 
264 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000132377  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3744  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.11 
 
 
264 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000212765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3721  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.15 
 
 
264 aa  165  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254444  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1522  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.99 
 
 
264 aa  166  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.0146163 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2338  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.66 
 
 
265 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000033517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3793  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.15 
 
 
264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3371  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.81 
 
 
264 aa  165  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0022523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0127  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.2 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0132  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.2 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3439  phosphonate ABC transporter, permease  35.5 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2297  ABC phosphonate permease  41.98 
 
 
268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5856  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  42.06 
 
 
294 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234805  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2284  phosphonate ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0852833  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4576  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.13 
 
 
269 aa  162  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2298  ABC phosphonate permease  39.91 
 
 
271 aa  162  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.74 
 
 
277 aa  161  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2185  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  46.7 
 
 
290 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2918  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.35 
 
 
294 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1322  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.77 
 
 
533 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497345  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3822  phosphonate ABC transporter permease  43.15 
 
 
300 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571251  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0766  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.26 
 
 
293 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6356  phosphonate ABC transporter, permease protein  37.98 
 
 
298 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.690717  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6365  phosphonate ABC transporter, permease component  45.85 
 
 
289 aa  158  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0563067  normal  0.924702 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1418  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.33 
 
 
266 aa  158  9e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.07 
 
 
511 aa  158  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115761  normal  0.0544773 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17510  Phosphonate transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
269 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4203  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.88 
 
 
294 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.852389  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4151  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.68 
 
 
274 aa  156  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0423  ABC type permease  43.39 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436548  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4086  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  44.93 
 
 
293 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0261465  normal  0.0836049 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4429  phosphonate ABC transporter permease  48.51 
 
 
282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0459  ABC type permease  43.39 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3860  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.67 
 
 
293 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.206995  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2680  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.42 
 
 
298 aa  155  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2287  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.27 
 
 
274 aa  155  9e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3823  phosphonate ABC transporter permease  47.52 
 
 
282 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.378202  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5855  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  43.75 
 
 
282 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0463216  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2796  phosphonate ABC transporter, permease protein  33.45 
 
 
293 aa  154  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4995  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.22 
 
 
245 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250762  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1342  phosphonate ABC transporter permease  33.45 
 
 
293 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.09 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0367  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.32 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1413  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.46 
 
 
299 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0873  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  34.75 
 
 
265 aa  150  3e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.122179 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3725  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  36.8 
 
 
262 aa  149  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4430  phosphonate ABC transporter permease  45.05 
 
 
293 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.45 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.45 
 
 
341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2184  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.11 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.122688  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3693  ABC phosphonate transporter inner membrane protein  40.61 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>