262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1648 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
535 aa  969    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.94 
 
 
556 aa  489  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3336  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.59 
 
 
521 aa  255  1.0000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.45187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1824  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  37.8 
 
 
518 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
523 aa  229  7e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1689  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.41 
 
 
523 aa  229  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.365245 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0485  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.65 
 
 
576 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0456  ABC phosphonate transporter, fused inner membrane subunits  38.74 
 
 
576 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0490  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.5 
 
 
576 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3020  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.13 
 
 
570 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14291  putative phosphonate ABC transporter  32.8 
 
 
521 aa  163  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0671  putative phosphonate ABC transporter  25.81 
 
 
500 aa  163  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0103  ABC-type phosphate/phosphonate transport system permease component  27.1 
 
 
516 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
539 aa  144  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.687292  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.42 
 
 
511 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115761  normal  0.0544773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
275 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141056  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07241  putative phosphonate ABC transporter  24.44 
 
 
376 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3199  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.95 
 
 
275 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0131264 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07841  putative phosphonate ABC transporter  27.61 
 
 
510 aa  133  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1322  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.59 
 
 
533 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497345  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07261  putative phosphonate ABC transporter  23.87 
 
 
376 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.06 
 
 
509 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.28 
 
 
506 aa  130  8.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.539581  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19770  phosphonate ABC transporter, permease component  41 
 
 
276 aa  127  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0593864  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07441  putative phosphonate ABC transporter  23.91 
 
 
500 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.314852  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
279 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0800707  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.13 
 
 
275 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
282 aa  122  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000186214 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1804  ABC transporter permease  41.39 
 
 
277 aa  118  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0852  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.58 
 
 
431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.98 
 
 
272 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0826  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  43.12 
 
 
275 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107681  normal  0.0222039 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0693  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  47.37 
 
 
275 aa  114  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0773426  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2432  phosphonate ABC transporter permease  40.08 
 
 
275 aa  114  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236507  normal  0.0603094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0789  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  45.73 
 
 
275 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1617  phosphonate ABC transporter permease  38.93 
 
 
284 aa  113  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.36633  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21150  ABC transporter permease  40.98 
 
 
277 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454841  normal  0.839555 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0127  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.8 
 
 
266 aa  110  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1292  putative phosphonate ABC transporter  39.01 
 
 
510 aa  110  6e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.871722  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0132  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.8 
 
 
266 aa  110  6e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3945  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
294 aa  108  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.351226  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.74 
 
 
277 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0423  ABC type permease  35.5 
 
 
261 aa  108  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436548  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0459  ABC type permease  35.5 
 
 
261 aa  108  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
504 aa  106  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  31.27 
 
 
275 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2431  phosphonate ABC transporter permease  47.92 
 
 
255 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0629355  normal  0.0565288 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4151  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
274 aa  103  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2238  phosphonate ABC transporter permease  36.75 
 
 
281 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2287  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
274 aa  102  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0692  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.37 
 
 
255 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.056532  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0853  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.66 
 
 
255 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4577  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.98 
 
 
271 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3236  phosphonate ABC transporter permease  30.45 
 
 
276 aa  101  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0868  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.56 
 
 
255 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17510  Phosphonate transport systems inner membrane component  33.89 
 
 
269 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0827  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  38.29 
 
 
255 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0220667 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07281  putative phosphonate ABC transporter  28.89 
 
 
516 aa  100  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.058351  hitchhiker  0.00530258 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0788  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  45.83 
 
 
255 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.12 
 
 
543 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.11 
 
 
341 aa  99  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.11 
 
 
341 aa  99  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2675  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.23 
 
 
297 aa  98.2  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0563966 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 
510 aa  97.1  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2284  phosphonate ABC transporter, permease protein  28.81 
 
 
266 aa  96.7  9e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0852833  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  39.47 
 
 
271 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  39.47 
 
 
271 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.47 
 
 
271 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  39.47 
 
 
271 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  39.47 
 
 
271 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  39.47 
 
 
271 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.47 
 
 
271 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2185  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.9 
 
 
290 aa  95.1  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1720  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.43 
 
 
278 aa  95.1  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000362895 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.82 
 
 
276 aa  95.1  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3390  phosphonate ABC transporter, permease  29.55 
 
 
264 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0936447  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3326  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  30.92 
 
 
365 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1185  putative phosphonate ABC transporter  35.27 
 
 
509 aa  94.4  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.234014  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2012  putative ABC transporter inner membrane component  32.49 
 
 
271 aa  94.4  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100736  decreased coverage  0.00339933 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3702  phosphonate ABC transporter, permease protein  29.55 
 
 
264 aa  94  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000191718 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3473  phosphonate ABC transporter permease  29.55 
 
 
264 aa  94  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3748  phosphonate ABC transporter permease  29.55 
 
 
264 aa  94  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.81 
 
 
271 aa  93.6  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21140  ABC transporter permease  37.6 
 
 
256 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0807284  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0250  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  30.2 
 
 
277 aa  93.6  8e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.31 
 
 
276 aa  93.6  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.31 
 
 
276 aa  93.6  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1803  phosphonate ABC transporter permease PhnE  37.76 
 
 
256 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6365  phosphonate ABC transporter, permease component  39.27 
 
 
289 aa  93.6  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0563067  normal  0.924702 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  30.11 
 
 
259 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.84 
 
 
501 aa  92.8  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.213097  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  27.54 
 
 
277 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3965  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.09 
 
 
272 aa  93.2  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.692533 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  27.54 
 
 
277 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3380  putative phosphonate transport system permease protein htxC phnE  33.33 
 
 
273 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0131  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component  32.84 
 
 
289 aa  93.2  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0113761  hitchhiker  0.00000772966 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.69 
 
 
259 aa  92.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
496 aa  92  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1522  phosphonate ABC transporter, permease protein  28.64 
 
 
264 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.0146163 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0336  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component  31.96 
 
 
270 aa  91.7  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>