216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1185 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1185  putative phosphonate ABC transporter  100 
 
 
509 aa  985    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.234014  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1292  putative phosphonate ABC transporter  61.89 
 
 
510 aa  475  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.871722  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14291  putative phosphonate ABC transporter  47.73 
 
 
521 aa  357  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0103  ABC-type phosphate/phosphonate transport system permease component  38.66 
 
 
516 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07281  putative phosphonate ABC transporter  38.93 
 
 
516 aa  326  6e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.058351  hitchhiker  0.00530258 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07841  putative phosphonate ABC transporter  40.64 
 
 
510 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360834 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0671  putative phosphonate ABC transporter  33.06 
 
 
500 aa  259  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07441  putative phosphonate ABC transporter  30.8 
 
 
500 aa  224  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.314852  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07241  putative phosphonate ABC transporter  31.75 
 
 
376 aa  206  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07261  putative phosphonate ABC transporter  32.63 
 
 
376 aa  200  7e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.97 
 
 
535 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.42 
 
 
539 aa  108  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.687292  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.99 
 
 
488 aa  106  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0381583  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1824  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  25.74 
 
 
518 aa  105  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147268 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.26 
 
 
510 aa  99.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.95 
 
 
501 aa  89.7  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.213097  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25 
 
 
505 aa  89  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3311  putative phosphonate ABC transporter, permease protein  25.76 
 
 
503 aa  82.8  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.251777  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.07 
 
 
543 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1768  ABC transporter complex for phosphonate inner membrane binding subunit  24.62 
 
 
496 aa  81.3  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0117243  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0490  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  26.91 
 
 
576 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 
506 aa  80.1  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.539581  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0456  ABC phosphonate transporter, fused inner membrane subunits  27.55 
 
 
576 aa  80.1  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  27.43 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0485  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  26.39 
 
 
576 aa  77  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  24.79 
 
 
272 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  24.79 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  24.79 
 
 
259 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.79 
 
 
259 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  24.79 
 
 
259 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  24.79 
 
 
259 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  24.38 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19770  phosphonate ABC transporter, permease component  31.2 
 
 
276 aa  72.8  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0593864  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2298  ABC phosphonate permease  28.45 
 
 
271 aa  72.4  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.23 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.21 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0800707  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4086  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  25.25 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0261465  normal  0.0836049 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2185  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  25.64 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  22.43 
 
 
511 aa  70.5  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115761  normal  0.0544773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2432  phosphonate ABC transporter permease  34.29 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236507  normal  0.0603094 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.62 
 
 
509 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 
275 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4621  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.87 
 
 
280 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438003 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.78 
 
 
504 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3199  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.43 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0131264 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3236  phosphonate ABC transporter permease  28.12 
 
 
276 aa  69.3  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.49 
 
 
275 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141056  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3743  phosphonate ABC transporter, permease protein  24.9 
 
 
267 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000033324  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0826  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  31.65 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107681  normal  0.0222039 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  23.5 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  23.5 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0766  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.18 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0998  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.66 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3472  phosphonate ABC transporter permease  27.51 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.153404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3438  phosphonate ABC transporter, permease  27.51 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.573649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3389  phosphonate ABC transporter, permease  27.51 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00227176  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0693  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.75 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0773426  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3701  phosphonate ABC transporter, permease protein  27.51 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177586 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3792  phosphonate ABC transporter, permease protein  27.51 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3747  phosphonate ABC transporter permease  27.51 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.375049  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  23.79 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1523  phosphonate ABC transporter, permease protein  27.51 
 
 
267 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137606  normal  0.0137345 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0423  ABC type permease  31.48 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436548  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0459  ABC type permease  31.48 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3370  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  27.51 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0789  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  31.75 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.25 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.25 
 
 
341 aa  67.4  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21150  ABC transporter permease  31.2 
 
 
277 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454841  normal  0.839555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1804  ABC transporter permease  31.2 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1617  phosphonate ABC transporter permease  30.83 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.36633  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3336  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.97 
 
 
521 aa  66.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.45187 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3945  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  26.24 
 
 
294 aa  66.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.351226  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2238  phosphonate ABC transporter permease  30.58 
 
 
281 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
523 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1319  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.89 
 
 
287 aa  65.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758207  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0852  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.71 
 
 
431 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1689  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.77 
 
 
523 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.365245 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  26.05 
 
 
275 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3720  phosphonate ABC transporter, permease protein  24.12 
 
 
267 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0181873  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1451  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.08 
 
 
269 aa  64.7  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  23.79 
 
 
271 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  23.79 
 
 
271 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  23.79 
 
 
271 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  23.79 
 
 
271 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  23.79 
 
 
271 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2081  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  27.67 
 
 
335 aa  63.9  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  23.79 
 
 
271 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  23.79 
 
 
271 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3693  ABC phosphonate transporter inner membrane protein  25.57 
 
 
335 aa  63.9  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  27.33 
 
 
277 aa  63.9  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1233  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  25.69 
 
 
266 aa  63.9  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.702272  normal  0.203861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  23.33 
 
 
266 aa  63.5  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1803  phosphonate ABC transporter permease PhnE  31.55 
 
 
256 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2297  ABC phosphonate permease  26.18 
 
 
268 aa  62.8  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3860  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  25 
 
 
293 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.206995  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.6 
 
 
282 aa  62.4  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000186214 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1418  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.14 
 
 
266 aa  62.4  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2337  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.62 
 
 
268 aa  62  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000326587  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0367  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.31 
 
 
272 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>