255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1448 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
488 aa  966    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0381583  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.74 
 
 
539 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.687292  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.64 
 
 
543 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.35 
 
 
506 aa  395  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.539581  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.26 
 
 
504 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3311  putative phosphonate ABC transporter, permease protein  44.18 
 
 
503 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.251777  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.89 
 
 
510 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44 
 
 
509 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.09 
 
 
499 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.440289  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 
501 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.213097  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.91 
 
 
505 aa  346  6e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1768  ABC transporter complex for phosphonate inner membrane binding subunit  44.47 
 
 
496 aa  344  2e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0117243  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.92 
 
 
496 aa  329  9e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1824  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  29.48 
 
 
518 aa  140  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3336  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  27.68 
 
 
521 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.45187 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.95 
 
 
279 aa  113  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0800707  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.72 
 
 
275 aa  113  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.71 
 
 
275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141056  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19770  phosphonate ABC transporter, permease component  45.83 
 
 
276 aa  110  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0593864  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0826  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  45.45 
 
 
275 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107681  normal  0.0222039 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0852  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.1 
 
 
431 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.42 
 
 
282 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000186214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2432  phosphonate ABC transporter permease  44.54 
 
 
275 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236507  normal  0.0603094 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1617  phosphonate ABC transporter permease  39.86 
 
 
284 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.36633  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3199  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  44.17 
 
 
275 aa  107  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0131264 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2238  phosphonate ABC transporter permease  40.58 
 
 
281 aa  106  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0789  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  43.33 
 
 
275 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0693  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.5 
 
 
275 aa  104  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0773426  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21150  ABC transporter permease  45 
 
 
277 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454841  normal  0.839555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1804  ABC transporter permease  45 
 
 
277 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1689  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.25 
 
 
523 aa  95.9  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.365245 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
523 aa  95.9  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1322  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.05 
 
 
533 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497345  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4086  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  31.67 
 
 
293 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0261465  normal  0.0836049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0827  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  34.32 
 
 
255 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0220667 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0868  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.32 
 
 
255 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0853  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.32 
 
 
255 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0766  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.77 
 
 
293 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3473  phosphonate ABC transporter permease  29.63 
 
 
264 aa  86.7  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3390  phosphonate ABC transporter, permease  29.63 
 
 
264 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0936447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3748  phosphonate ABC transporter permease  29.63 
 
 
264 aa  86.7  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3702  phosphonate ABC transporter, permease protein  29.63 
 
 
264 aa  86.7  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000191718 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3439  phosphonate ABC transporter, permease  29.63 
 
 
264 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.44 
 
 
277 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.44 
 
 
277 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  25.21 
 
 
511 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115761  normal  0.0544773 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3371  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.16 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0022523  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14291  putative phosphonate ABC transporter  28.45 
 
 
521 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1522  phosphonate ABC transporter, permease protein  30.21 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.0146163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5856  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  31.19 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234805  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3744  phosphonate ABC transporter, permease protein  29.63 
 
 
264 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000212765  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3793  phosphonate ABC transporter, permease protein  29.63 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3721  phosphonate ABC transporter, permease protein  29.1 
 
 
264 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254444  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2011  putative ABC transporter inner membrane component  31.25 
 
 
270 aa  82.8  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.050434  normal  0.0106691 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07241  putative phosphonate ABC transporter  26.33 
 
 
376 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0788  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  36.64 
 
 
255 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3707  phosphonate ABC transporter permease  34.07 
 
 
292 aa  82  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.324444 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1320  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.92 
 
 
294 aa  82.4  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0485  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.85 
 
 
576 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3945  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.351226  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0456  ABC phosphonate transporter, fused inner membrane subunits  33.55 
 
 
576 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0490  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.77 
 
 
576 aa  81.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2185  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  27.85 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.53 
 
 
266 aa  80.9  0.00000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07441  putative phosphonate ABC transporter  26.52 
 
 
500 aa  80.5  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.314852  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0692  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.88 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.056532  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2338  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.5 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000033517  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4430  phosphonate ABC transporter permease  30.33 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  27.72 
 
 
269 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3200  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.59 
 
 
253 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0198653 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.89 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.89 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3822  phosphonate ABC transporter permease  31.79 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571251  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1803  phosphonate ABC transporter permease PhnE  32.17 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  26.32 
 
 
270 aa  77.8  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07261  putative phosphonate ABC transporter  25.74 
 
 
376 aa  77.4  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  25 
 
 
271 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  25 
 
 
271 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  25 
 
 
271 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3326  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  34.29 
 
 
365 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21140  ABC transporter permease  32.17 
 
 
256 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0807284  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  25 
 
 
271 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1319  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.73 
 
 
287 aa  75.5  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758207  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  25 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2993  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  29.45 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2674  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.45 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2431  phosphonate ABC transporter permease  32.12 
 
 
255 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0629355  normal  0.0565288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2918  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.14 
 
 
294 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  25 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  25 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4996  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  26.61 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0396446  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19760  phosphonate ABC transporter, permease component  35.43 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.092761  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6356  phosphonate ABC transporter, permease protein  29.47 
 
 
298 aa  73.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.690717  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.76 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  26.46 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3236  phosphonate ABC transporter permease  29.8 
 
 
276 aa  73.6  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4621  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  27.37 
 
 
280 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438003 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0182  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.12 
 
 
542 aa  73.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.85 
 
 
277 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2675  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.41 
 
 
297 aa  72.8  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0563966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>