288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3200 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_3200  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
253 aa  480  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0198653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0868  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  74.9 
 
 
255 aa  341  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0853  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  74.1 
 
 
255 aa  334  9e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19760  phosphonate ABC transporter, permease component  84.81 
 
 
252 aa  332  3e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.092761  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0788  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  76.1 
 
 
255 aa  331  8e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0827  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  73.71 
 
 
255 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0220667 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0692  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  78.49 
 
 
255 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.056532  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2431  phosphonate ABC transporter permease  76.59 
 
 
255 aa  324  9e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0629355  normal  0.0565288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21140  ABC transporter permease  78.51 
 
 
256 aa  316  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0807284  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1803  phosphonate ABC transporter permease PhnE  79.5 
 
 
256 aa  316  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4359  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  74.9 
 
 
255 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  0.555216 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1824  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  57.61 
 
 
518 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.7 
 
 
523 aa  224  7e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3336  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  58.51 
 
 
521 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.45187 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1689  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  60.96 
 
 
523 aa  223  3e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.365245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1720  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  56.02 
 
 
278 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000362895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2239  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  56.39 
 
 
279 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2058  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  55.42 
 
 
279 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149072  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0456  ABC phosphonate transporter, fused inner membrane subunits  47.93 
 
 
576 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19770  phosphonate ABC transporter, permease component  43.75 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0593864  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0485  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  46.69 
 
 
576 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0490  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  45.87 
 
 
576 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.13 
 
 
277 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.13 
 
 
277 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3020  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  49.14 
 
 
570 aa  155  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.83 
 
 
275 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141056  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3199  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.33 
 
 
275 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0131264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6356  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.25 
 
 
298 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.690717  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.72 
 
 
279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0800707  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2432  phosphonate ABC transporter permease  43.75 
 
 
275 aa  151  8e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236507  normal  0.0603094 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3945  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.04 
 
 
294 aa  151  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.351226  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4996  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.1 
 
 
264 aa  149  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0396446  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0459  ABC type permease  42 
 
 
261 aa  148  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0423  ABC type permease  42 
 
 
261 aa  148  6e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436548  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  39.91 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  39.91 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  39.91 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  39.91 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  39.91 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.91 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.91 
 
 
271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.42 
 
 
269 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1618  phosphonate ABC transporter permease  54.76 
 
 
274 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.177587  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.83 
 
 
266 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.36 
 
 
341 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.36 
 
 
341 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6365  phosphonate ABC transporter, permease component  42.86 
 
 
289 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0563067  normal  0.924702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1804  ABC transporter permease  42.01 
 
 
277 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4522  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.39 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.14 
 
 
259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4621  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.41 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438003 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.15 
 
 
272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0837  ABC phosphonate transporter, inner membrane subunit PhnE  36.96 
 
 
280 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.47 
 
 
276 aa  139  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  40.93 
 
 
275 aa  139  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0826  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  40.64 
 
 
275 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107681  normal  0.0222039 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
270 aa  138  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.43 
 
 
259 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.72 
 
 
275 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.04 
 
 
271 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21150  ABC transporter permease  42.01 
 
 
277 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454841  normal  0.839555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.14 
 
 
259 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
282 aa  136  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000186214 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  37.96 
 
 
259 aa  135  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.96 
 
 
259 aa  135  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  37.96 
 
 
259 aa  135  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2297  ABC phosphonate permease  40.09 
 
 
268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  36.21 
 
 
272 aa  135  9e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.82 
 
 
263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3473  phosphonate ABC transporter permease  36.73 
 
 
264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3390  phosphonate ABC transporter, permease  36.73 
 
 
264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0936447  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3702  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.73 
 
 
264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000191718 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3748  phosphonate ABC transporter permease  36.73 
 
 
264 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2238  phosphonate ABC transporter permease  35.71 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0127  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.51 
 
 
266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0367  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0132  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.51 
 
 
266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3439  phosphonate ABC transporter, permease  36.73 
 
 
264 aa  133  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1522  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 
264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.0146163 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3720  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.92 
 
 
267 aa  132  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0181873  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17510  Phosphonate transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
269 aa  132  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0766  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.15 
 
 
293 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3792  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.92 
 
 
267 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3793  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.24 
 
 
264 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3744  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.28 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000212765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3472  phosphonate ABC transporter permease  36.92 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.153404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3438  phosphonate ABC transporter, permease  36.92 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.573649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1523  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.92 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137606  normal  0.0137345 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3389  phosphonate ABC transporter, permease  36.92 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00227176  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3747  phosphonate ABC transporter permease  36.92 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.375049  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4086  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  38.62 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0261465  normal  0.0836049 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3701  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.92 
 
 
267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177586 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3743  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.92 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000033324  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0852  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.91 
 
 
431 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3822  phosphonate ABC transporter permease  41.56 
 
 
300 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571251  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3370  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.79 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2338  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.25 
 
 
265 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000033517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>