More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6365 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6365  phosphonate ABC transporter, permease component  100 
 
 
289 aa  559  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0563067  normal  0.924702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3380  putative phosphonate transport system permease protein htxC phnE  56.39 
 
 
273 aa  241  7.999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6356  phosphonate ABC transporter, permease protein  44.24 
 
 
298 aa  218  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.690717  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.55 
 
 
277 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.55 
 
 
277 aa  195  8.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.43 
 
 
259 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  40.69 
 
 
259 aa  179  7e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  42.72 
 
 
272 aa  177  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.72 
 
 
259 aa  177  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  42.72 
 
 
259 aa  177  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  42.72 
 
 
259 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.23 
 
 
259 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.04 
 
 
272 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.48 
 
 
266 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  42.23 
 
 
259 aa  175  7e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.62 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.62 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  46.53 
 
 
263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.62 
 
 
276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2202  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  38.76 
 
 
542 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.28 
 
 
269 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.44 
 
 
270 aa  168  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.42 
 
 
271 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0182  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.89 
 
 
542 aa  166  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  40.29 
 
 
271 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  40.29 
 
 
271 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  40.29 
 
 
271 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  40.29 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  40.29 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  40.29 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  40.29 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4621  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.6 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438003 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0827  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.152622  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1319  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.94 
 
 
287 aa  163  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758207  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0367  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35 
 
 
272 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4995  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.52 
 
 
245 aa  163  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250762  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17510  Phosphonate transport systems inner membrane component  40.33 
 
 
269 aa  162  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4522  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.75 
 
 
280 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0837  ABC phosphonate transporter, inner membrane subunit PhnE  37.4 
 
 
280 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  40.18 
 
 
275 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3439  phosphonate ABC transporter, permease  37.72 
 
 
264 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0423  ABC type permease  43.5 
 
 
261 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436548  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0459  ABC type permease  43.5 
 
 
261 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.43 
 
 
511 aa  158  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115761  normal  0.0544773 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20330  phosphonate ABC tranporter permease protein  47.19 
 
 
264 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.293398  normal  0.582568 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1322  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.44 
 
 
533 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497345  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1747  phosphonate ABC transporter permease PhnE  47.19 
 
 
264 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3473  phosphonate ABC transporter permease  37.28 
 
 
264 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3390  phosphonate ABC transporter, permease  37.28 
 
 
264 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0936447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3748  phosphonate ABC transporter permease  37.28 
 
 
264 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3702  phosphonate ABC transporter, permease protein  37.28 
 
 
264 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000191718 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0773  phosphonate ABC transporter permease  40.82 
 
 
292 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.741951  normal  0.989098 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3693  ABC phosphonate transporter inner membrane protein  40.61 
 
 
335 aa  156  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0183  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  47.88 
 
 
267 aa  155  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685184  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2298  ABC phosphonate permease  38.79 
 
 
271 aa  154  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.08 
 
 
277 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2338  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.1 
 
 
265 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000033517  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4996  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.56 
 
 
264 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0396446  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3744  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 
264 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000212765  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2249  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.72 
 
 
262 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.859646  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4179  phosphonate ABC transporter permease  40 
 
 
288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3793  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.4 
 
 
264 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3721  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.96 
 
 
264 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254444  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2557  phosphonates ABC transporter, permease protein  46.67 
 
 
262 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3371  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.4 
 
 
264 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0022523  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4151  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.44 
 
 
274 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0177  phosphonate ABC transporter permease  38.5 
 
 
264 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000132377  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.53 
 
 
341 aa  149  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.53 
 
 
341 aa  149  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1418  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
266 aa  148  8e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2287  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37 
 
 
274 aa  148  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2184  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.73 
 
 
290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.122688  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0127  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.59 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2081  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  41.49 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0132  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.59 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1522  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.4 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.0146163 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3823  phosphonate ABC transporter permease  39.91 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.378202  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2876  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.98 
 
 
286 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2797  phosphonate ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
286 aa  145  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1343  phosphonate ABC transporter permease  34.98 
 
 
286 aa  145  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0495626 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2297  ABC phosphonate permease  39.63 
 
 
268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3822  phosphonate ABC transporter permease  36.78 
 
 
300 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571251  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3326  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  35.75 
 
 
365 aa  145  9e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5855  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  37.5 
 
 
282 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0463216  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0873  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  36.24 
 
 
265 aa  144  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.122179 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2284  phosphonate ABC transporter, permease protein  33.93 
 
 
266 aa  143  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0852833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5856  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  37.91 
 
 
294 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234805  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2993  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  36.29 
 
 
266 aa  142  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2674  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.29 
 
 
266 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2011  putative ABC transporter inner membrane component  32.65 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.050434  normal  0.0106691 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1450  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.05 
 
 
273 aa  139  7e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.126194  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4429  phosphonate ABC transporter permease  36.67 
 
 
282 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0250  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  38.65 
 
 
277 aa  136  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0765  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.22 
 
 
288 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.460298  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3965  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.57 
 
 
272 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.692533 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0998  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.62 
 
 
265 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0868  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.76 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2012  putative ABC transporter inner membrane component  34.11 
 
 
271 aa  133  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100736  decreased coverage  0.00339933 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2681  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
288 aa  132  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4430  phosphonate ABC transporter permease  37.57 
 
 
293 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>