More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4430 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_4430  phosphonate ABC transporter permease  100 
 
 
293 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5856  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  74.57 
 
 
294 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234805  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3822  phosphonate ABC transporter permease  76.63 
 
 
300 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571251  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0766  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  58.56 
 
 
293 aa  312  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1320  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  55.78 
 
 
294 aa  309  4e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4086  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  56.36 
 
 
293 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0261465  normal  0.0836049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3860  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  56.75 
 
 
293 aa  288  1e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.206995  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2918  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  59.59 
 
 
294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4203  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  54.98 
 
 
294 aa  277  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.852389  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2185  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  55.05 
 
 
290 aa  273  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2876  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.79 
 
 
286 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1343  phosphonate ABC transporter permease  36.43 
 
 
286 aa  177  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0495626 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2797  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.43 
 
 
286 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3707  phosphonate ABC transporter permease  36.93 
 
 
292 aa  172  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.324444 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  46 
 
 
275 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.3 
 
 
277 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.3 
 
 
277 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0896  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.36 
 
 
295 aa  161  9e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418792  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4785  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.93 
 
 
280 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161487  normal  0.0587654 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.68 
 
 
259 aa  159  4e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  45 
 
 
271 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  45 
 
 
271 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  45 
 
 
271 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  44.22 
 
 
270 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.68 
 
 
259 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  44.5 
 
 
271 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  44.5 
 
 
271 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  44.5 
 
 
271 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  44.5 
 
 
271 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1319  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.85 
 
 
287 aa  155  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758207  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.01 
 
 
271 aa  155  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  40.43 
 
 
259 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  39.66 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.43 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  40.43 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  40.43 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.32 
 
 
269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  40.34 
 
 
259 aa  152  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42 
 
 
276 aa  152  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42 
 
 
276 aa  152  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4429  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.5 
 
 
319 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1321  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.97 
 
 
288 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.5 
 
 
276 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.38 
 
 
263 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1322  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  44.57 
 
 
533 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497345  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.24 
 
 
272 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.49 
 
 
511 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115761  normal  0.0544773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.67 
 
 
266 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2298  ABC phosphonate permease  36.63 
 
 
271 aa  149  6e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4115  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.44 
 
 
319 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1418  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.46 
 
 
266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2681  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.26 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4522  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.04 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4666  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.79 
 
 
320 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00096025 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0837  ABC phosphonate transporter, inner membrane subunit PhnE  37.83 
 
 
280 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4995  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.63 
 
 
245 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250762  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4996  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.48 
 
 
264 aa  143  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0396446  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20330  phosphonate ABC tranporter permease protein  40.09 
 
 
264 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.293398  normal  0.582568 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3326  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  41.28 
 
 
365 aa  142  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4621  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  44.26 
 
 
280 aa  142  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438003 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3439  phosphonate ABC transporter, permease  31.16 
 
 
264 aa  142  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1747  phosphonate ABC transporter permease PhnE  41.47 
 
 
264 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2993  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  43.28 
 
 
266 aa  142  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2674  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.28 
 
 
266 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0282  ABC transporter membrane spanning protein (phosphonate)  35.37 
 
 
320 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2081  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  39.09 
 
 
335 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1412  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.84 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3390  phosphonate ABC transporter, permease  31.16 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0936447  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0459  ABC type permease  40.53 
 
 
261 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0423  ABC type permease  40.53 
 
 
261 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436548  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3473  phosphonate ABC transporter permease  31.16 
 
 
264 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3702  phosphonate ABC transporter, permease protein  31.16 
 
 
264 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000191718 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3748  phosphonate ABC transporter permease  31.16 
 
 
264 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0827  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
267 aa  139  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.152622  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0773  phosphonate ABC transporter permease  38.02 
 
 
292 aa  139  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.741951  normal  0.989098 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2297  ABC phosphonate permease  37.39 
 
 
268 aa  139  7.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3693  ABC phosphonate transporter inner membrane protein  38.97 
 
 
335 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0183  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  43.82 
 
 
267 aa  136  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685184  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2557  phosphonates ABC transporter, permease protein  38.64 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3472  phosphonate ABC transporter permease  43.39 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.153404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3438  phosphonate ABC transporter, permease  43.39 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.573649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3389  phosphonate ABC transporter, permease  43.39 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00227176  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3370  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.39 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4179  phosphonate ABC transporter permease  37.74 
 
 
288 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3747  phosphonate ABC transporter permease  43.39 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.375049  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.15 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.15 
 
 
341 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3792  phosphonate ABC transporter, permease protein  43.39 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1523  phosphonate ABC transporter, permease protein  43.39 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137606  normal  0.0137345 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3743  phosphonate ABC transporter, permease protein  43.39 
 
 
267 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000033324  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3744  phosphonate ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 
264 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000212765  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3701  phosphonate ABC transporter, permease protein  43.39 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177586 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2249  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.64 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.859646  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1451  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.9 
 
 
269 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349089  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0250  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  39.06 
 
 
277 aa  134  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3720  phosphonate ABC transporter, permease protein  43.39 
 
 
267 aa  132  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0181873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3371  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.07 
 
 
264 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0022523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1522  phosphonate ABC transporter, permease protein  30.07 
 
 
264 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.0146163 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2202  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  35.88 
 
 
542 aa  132  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2796  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.52 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>