More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4179 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4179  phosphonate ABC transporter permease  100 
 
 
288 aa  577  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0773  phosphonate ABC transporter permease  86.32 
 
 
292 aa  471  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.741951  normal  0.989098 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  73.6 
 
 
270 aa  385  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  71.26 
 
 
269 aa  379  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  71.54 
 
 
266 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  72.61 
 
 
263 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  68.92 
 
 
259 aa  369  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  68.53 
 
 
259 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0827  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  71.09 
 
 
267 aa  361  6e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.152622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  68.92 
 
 
259 aa  358  5e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  66.92 
 
 
272 aa  357  9.999999999999999e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  68.53 
 
 
259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  68.53 
 
 
259 aa  356  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  68.13 
 
 
259 aa  354  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0837  ABC phosphonate transporter, inner membrane subunit PhnE  71.76 
 
 
280 aa  353  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4522  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  75.21 
 
 
280 aa  352  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  67.73 
 
 
259 aa  350  1e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4621  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  72.13 
 
 
280 aa  348  6e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438003 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1747  phosphonate ABC transporter permease PhnE  72.61 
 
 
264 aa  348  8e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0183  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  72.24 
 
 
267 aa  348  8e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20330  phosphonate ABC tranporter permease protein  72.61 
 
 
264 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.293398  normal  0.582568 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  71.37 
 
 
271 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  71.37 
 
 
271 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  71.37 
 
 
271 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  70.93 
 
 
271 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  70.93 
 
 
271 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  70.93 
 
 
271 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  70.93 
 
 
271 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2249  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  71.18 
 
 
262 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.859646  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2557  phosphonates ABC transporter, permease protein  70.31 
 
 
262 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108995  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  53.38 
 
 
277 aa  299  5e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  53.38 
 
 
277 aa  299  5e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03936  hypothetical protein  68.23 
 
 
205 aa  263  4e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  51.98 
 
 
271 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0394  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  52.96 
 
 
679 aa  232  7.000000000000001e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.417915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.56 
 
 
272 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3326  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  41.44 
 
 
365 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03935  hypothetical protein  68.91 
 
 
122 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1320  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.02 
 
 
294 aa  175  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1522  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.8 
 
 
264 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.0146163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4996  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.69 
 
 
264 aa  169  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0396446  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.56 
 
 
276 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3473  phosphonate ABC transporter permease  36.96 
 
 
264 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410084  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.56 
 
 
276 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3748  phosphonate ABC transporter permease  36.96 
 
 
264 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3702  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.96 
 
 
264 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000191718 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1319  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.86 
 
 
287 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.758207  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3390  phosphonate ABC transporter, permease  36.96 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0936447  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3744  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.58 
 
 
264 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000212765  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2297  ABC phosphonate permease  41.59 
 
 
268 aa  166  4e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3793  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.19 
 
 
264 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.19 
 
 
276 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  36.4 
 
 
275 aa  165  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3721  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.32 
 
 
264 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254444  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3822  phosphonate ABC transporter permease  47.26 
 
 
300 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571251  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0177  phosphonate ABC transporter permease  40.09 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000132377  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3439  phosphonate ABC transporter, permease  36.58 
 
 
264 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3371  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.79 
 
 
264 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0022523  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3380  putative phosphonate transport system permease protein htxC phnE  41.55 
 
 
273 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2338  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.43 
 
 
265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000033517  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2918  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.25 
 
 
294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0132  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.52 
 
 
266 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0127  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.52 
 
 
266 aa  162  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2298  ABC phosphonate permease  40.09 
 
 
271 aa  162  9e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0766  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.48 
 
 
293 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1418  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.91 
 
 
266 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3860  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.17 
 
 
293 aa  159  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.206995  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6365  phosphonate ABC transporter, permease component  40 
 
 
289 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0563067  normal  0.924702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4086  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  43.48 
 
 
293 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0261465  normal  0.0836049 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2185  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  51.97 
 
 
290 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2284  phosphonate ABC transporter, permease protein  32.82 
 
 
266 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0852833  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0423  ABC type permease  41.45 
 
 
261 aa  155  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436548  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0459  ABC type permease  41.45 
 
 
261 aa  155  7e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4576  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.9 
 
 
269 aa  155  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4430  phosphonate ABC transporter permease  44.28 
 
 
293 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.86 
 
 
341 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.86 
 
 
341 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1322  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.98 
 
 
533 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497345  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4995  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.11 
 
 
245 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250762  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.17 
 
 
277 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.39 
 
 
511 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115761  normal  0.0544773 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0873  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  36.48 
 
 
265 aa  153  4e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.122179 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6356  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.83 
 
 
298 aa  153  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.690717  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4203  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.42 
 
 
294 aa  152  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.852389  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5856  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  37.01 
 
 
294 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234805  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5855  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  41.04 
 
 
282 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0463216  normal  0.82281 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2674  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.91 
 
 
266 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2993  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  37.91 
 
 
266 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2796  phosphonate ABC transporter, permease protein  31.36 
 
 
293 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1342  phosphonate ABC transporter permease  31.36 
 
 
293 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0131  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, permease component  35.23 
 
 
289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0113761  hitchhiker  0.00000772966 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3792  phosphonate ABC transporter, permease protein  44.12 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3438  phosphonate ABC transporter, permease  44.12 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.573649  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1523  phosphonate ABC transporter, permease protein  44.12 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137606  normal  0.0137345 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2675  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0563966 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.36 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3389  phosphonate ABC transporter, permease  44.12 
 
 
267 aa  147  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00227176  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3701  phosphonate ABC transporter, permease protein  44.12 
 
 
267 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177586 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3747  phosphonate ABC transporter permease  44.12 
 
 
267 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.375049  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1232  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.38 
 
 
265 aa  146  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.917781  normal  0.196342 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>