More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2993 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2674  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
266 aa  530  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2993  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 
266 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1418  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  83.08 
 
 
266 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  60.98 
 
 
276 aa  302  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  60.98 
 
 
276 aa  302  3.0000000000000004e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  60.57 
 
 
276 aa  300  1e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  60.98 
 
 
275 aa  298  9e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0367  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  53.96 
 
 
272 aa  294  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12521  hypothetical protein  52.71 
 
 
265 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.285208  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11281  hypothetical protein  52.21 
 
 
269 aa  229  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.157869 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1522  phosphonate ABC transporter, permease protein  41.89 
 
 
264 aa  182  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.0146163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3793  phosphonate ABC transporter, permease protein  41.44 
 
 
264 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3721  phosphonate ABC transporter, permease protein  41.44 
 
 
264 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254444  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3473  phosphonate ABC transporter permease  40.99 
 
 
264 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3748  phosphonate ABC transporter permease  40.99 
 
 
264 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3702  phosphonate ABC transporter, permease protein  40.99 
 
 
264 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000191718 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.74 
 
 
277 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3390  phosphonate ABC transporter, permease  40.54 
 
 
264 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0936447  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.74 
 
 
277 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3744  phosphonate ABC transporter, permease protein  40.54 
 
 
264 aa  175  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000212765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3371  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.44 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0022523  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3439  phosphonate ABC transporter, permease  40.54 
 
 
264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2338  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.51 
 
 
265 aa  172  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000033517  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3380  putative phosphonate transport system permease protein htxC phnE  40.89 
 
 
273 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.64 
 
 
272 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2298  ABC phosphonate permease  46.03 
 
 
271 aa  168  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0177  phosphonate ABC transporter permease  42.4 
 
 
264 aa  168  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000132377  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.02 
 
 
511 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115761  normal  0.0544773 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.23 
 
 
266 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2012  putative ABC transporter inner membrane component  40.09 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100736  decreased coverage  0.00339933 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02540  phosphonate transport system inner membrane component  46.58 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3792  phosphonate ABC transporter, permease protein  45.55 
 
 
267 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3472  phosphonate ABC transporter permease  45.55 
 
 
267 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.153404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3438  phosphonate ABC transporter, permease  45.55 
 
 
267 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.573649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3701  phosphonate ABC transporter, permease protein  45.55 
 
 
267 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177586 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3747  phosphonate ABC transporter permease  45.55 
 
 
267 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.375049  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3370  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  45.55 
 
 
267 aa  163  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3389  phosphonate ABC transporter, permease  45.55 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00227176  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3743  phosphonate ABC transporter, permease protein  45.55 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000033324  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17510  Phosphonate transport systems inner membrane component  39.56 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0132  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.73 
 
 
266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0127  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.73 
 
 
266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1523  phosphonate ABC transporter, permease protein  45.55 
 
 
267 aa  162  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137606  normal  0.0137345 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0423  ABC type permease  42.64 
 
 
261 aa  162  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436548  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4151  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.29 
 
 
274 aa  162  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0459  ABC type permease  42.64 
 
 
261 aa  162  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1320  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.5 
 
 
294 aa  162  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2287  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.29 
 
 
274 aa  161  9e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3720  phosphonate ABC transporter, permease protein  45.55 
 
 
267 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0181873  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.71 
 
 
269 aa  161  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1322  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.56 
 
 
533 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497345  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 
259 aa  160  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.07 
 
 
259 aa  159  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 
259 aa  159  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 
259 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  37.14 
 
 
272 aa  159  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2284  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.84 
 
 
266 aa  159  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0852833  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3965  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.64 
 
 
272 aa  159  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.692533 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
259 aa  159  4e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 
259 aa  159  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.47 
 
 
259 aa  159  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6356  phosphonate ABC transporter, permease protein  37.34 
 
 
298 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.690717  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.97 
 
 
270 aa  158  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
341 aa  158  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.86 
 
 
341 aa  158  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1925  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  37.5 
 
 
272 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.77597  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3945  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.2 
 
 
294 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.351226  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  40.89 
 
 
271 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  40.89 
 
 
271 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  40.89 
 
 
271 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0250  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  40.91 
 
 
277 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3236  phosphonate ABC transporter permease  38.91 
 
 
276 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.94 
 
 
277 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5856  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  41.46 
 
 
294 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234805  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.25 
 
 
263 aa  156  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  40.39 
 
 
271 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3693  ABC phosphonate transporter inner membrane protein  43.16 
 
 
335 aa  155  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  40.39 
 
 
271 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  40.39 
 
 
271 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  40.39 
 
 
271 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0896  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.27 
 
 
295 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.418792  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4996  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.45 
 
 
264 aa  153  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0396446  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2337  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.34 
 
 
268 aa  154  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000326587  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4522  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.91 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4430  phosphonate ABC transporter permease  43.28 
 
 
293 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2876  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.33 
 
 
286 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2081  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  42.11 
 
 
335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2297  ABC phosphonate permease  37.84 
 
 
268 aa  152  7e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2797  phosphonate ABC transporter, permease protein  41.8 
 
 
286 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1343  phosphonate ABC transporter permease  41.8 
 
 
286 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0495626 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0837  ABC phosphonate transporter, inner membrane subunit PhnE  37.91 
 
 
280 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0766  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.1 
 
 
293 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4995  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.82 
 
 
245 aa  149  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250762  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4621  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.34 
 
 
280 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438003 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2202  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  36.59 
 
 
542 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3262  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.616884 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2557  phosphonates ABC transporter, permease protein  40.65 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108995  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2249  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.65 
 
 
262 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.859646  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3863  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  39.76 
 
 
273 aa  145  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0182  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.71 
 
 
542 aa  145  7.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>