284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0868 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0868  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
255 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0853  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  96.08 
 
 
255 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0827  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  95.29 
 
 
255 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0220667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4359  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  89.02 
 
 
255 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  0.555216 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2431  phosphonate ABC transporter permease  76.08 
 
 
255 aa  329  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0629355  normal  0.0565288 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0788  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  75.59 
 
 
255 aa  328  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0692  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  75.59 
 
 
255 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.056532  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19760  phosphonate ABC transporter, permease component  76.37 
 
 
252 aa  293  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.092761  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3200  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  75.64 
 
 
253 aa  289  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0198653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21140  ABC transporter permease  70.08 
 
 
256 aa  288  7e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0807284  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1803  phosphonate ABC transporter permease PhnE  73.53 
 
 
256 aa  285  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1824  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  57.2 
 
 
518 aa  228  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3336  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  58.2 
 
 
521 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.45187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.01 
 
 
523 aa  211  7e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1689  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  57.58 
 
 
523 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.365245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1720  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  54.69 
 
 
278 aa  195  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000362895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2239  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  54.08 
 
 
279 aa  189  5e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2058  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  55.98 
 
 
279 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149072  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.82 
 
 
277 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.82 
 
 
277 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0456  ABC phosphonate transporter, fused inner membrane subunits  47.72 
 
 
576 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1618  phosphonate ABC transporter permease  53.91 
 
 
274 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.177587  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.74 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0485  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  47.79 
 
 
576 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0490  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  48.42 
 
 
576 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3945  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.75 
 
 
294 aa  149  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.351226  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.76 
 
 
259 aa  149  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.74 
 
 
259 aa  149  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6356  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.02 
 
 
298 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.690717  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19770  phosphonate ABC transporter, permease component  40 
 
 
276 aa  149  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0593864  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.74 
 
 
259 aa  149  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.74 
 
 
259 aa  148  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.74 
 
 
259 aa  148  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  39.74 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.72 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.61 
 
 
263 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.58 
 
 
272 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.3 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  39.73 
 
 
275 aa  145  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.37 
 
 
270 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4996  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.45 
 
 
264 aa  144  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0396446  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.67 
 
 
266 aa  142  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0423  ABC type permease  42 
 
 
261 aa  142  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436548  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0459  ABC type permease  42 
 
 
261 aa  142  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3326  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  35.37 
 
 
365 aa  142  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3020  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.95 
 
 
570 aa  141  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3380  putative phosphonate transport system permease protein htxC phnE  38.63 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.590376  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4522  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.45 
 
 
280 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3199  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.36 
 
 
275 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0131264 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  37.61 
 
 
271 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  37.61 
 
 
271 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  37.61 
 
 
271 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  37.61 
 
 
271 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  37.61 
 
 
271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  37.61 
 
 
271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  37.61 
 
 
271 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
275 aa  139  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141056  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.11 
 
 
341 aa  139  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.11 
 
 
341 aa  139  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0837  ABC phosphonate transporter, inner membrane subunit PhnE  40 
 
 
280 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1804  ABC transporter permease  41.08 
 
 
277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.89 
 
 
279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0800707  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.12 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4621  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.45 
 
 
280 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438003 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2432  phosphonate ABC transporter permease  38.78 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236507  normal  0.0603094 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3473  phosphonate ABC transporter permease  36.24 
 
 
264 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3390  phosphonate ABC transporter, permease  36.24 
 
 
264 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0936447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3748  phosphonate ABC transporter permease  36.24 
 
 
264 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1747  phosphonate ABC transporter permease PhnE  40.09 
 
 
264 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3702  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.24 
 
 
264 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000191718 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20330  phosphonate ABC tranporter permease protein  40.09 
 
 
264 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.293398  normal  0.582568 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1522  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.16 
 
 
264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.0146163 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.29 
 
 
276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.29 
 
 
276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21150  ABC transporter permease  41.08 
 
 
277 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454841  normal  0.839555 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3744  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.78 
 
 
264 aa  131  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000212765  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.29 
 
 
276 aa  131  9e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3721  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.78 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254444  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2081  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  39 
 
 
335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3371  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.7 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0022523  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2249  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.32 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.859646  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3793  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.32 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3439  phosphonate ABC transporter, permease  35.78 
 
 
264 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2557  phosphonates ABC transporter, permease protein  36.75 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108995  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0693  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.58 
 
 
275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0773426  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2297  ABC phosphonate permease  39.57 
 
 
268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2298  ABC phosphonate permease  35.74 
 
 
271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2338  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.32 
 
 
265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000033517  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0183  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  39.06 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0127  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.5 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0132  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.5 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0367  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.09 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2797  phosphonate ABC transporter, permease protein  40.31 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1343  phosphonate ABC transporter permease  40.31 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0495626 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2284  phosphonate ABC transporter, permease protein  32.77 
 
 
266 aa  126  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0852833  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0827  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.56 
 
 
267 aa  126  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.152622  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5856  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  39.15 
 
 
294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234805  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4086  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  36.73 
 
 
293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0261465  normal  0.0836049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.4 
 
 
277 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2876  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.79 
 
 
286 aa  125  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>