More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2014 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1824  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  73.1 
 
 
518 aa  696    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
523 aa  986    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1689  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  98.85 
 
 
523 aa  972    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.365245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3336  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  76.92 
 
 
521 aa  728    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.45187 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0485  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  47.2 
 
 
576 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0456  ABC phosphonate transporter, fused inner membrane subunits  46.23 
 
 
576 aa  282  9e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0490  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  45.58 
 
 
576 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.25 
 
 
279 aa  258  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0800707  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.98 
 
 
282 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000186214 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3020  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.57 
 
 
570 aa  246  8e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.34 
 
 
275 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141056  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19770  phosphonate ABC transporter, permease component  57.89 
 
 
276 aa  234  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0593864  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1617  phosphonate ABC transporter permease  52.92 
 
 
284 aa  231  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.36633  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0868  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  56.68 
 
 
255 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3199  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  57.14 
 
 
275 aa  225  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0131264 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1803  phosphonate ABC transporter permease PhnE  59.29 
 
 
256 aa  224  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21140  ABC transporter permease  60.66 
 
 
256 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0807284  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0853  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  57.08 
 
 
255 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2431  phosphonate ABC transporter permease  58.54 
 
 
255 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0629355  normal  0.0565288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0827  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  57.52 
 
 
255 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0220667 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.28 
 
 
275 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2238  phosphonate ABC transporter permease  52.57 
 
 
281 aa  217  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1804  ABC transporter permease  56.13 
 
 
277 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1322  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.5 
 
 
533 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497345  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0693  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  58.65 
 
 
275 aa  209  7e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0773426  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3200  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  58.33 
 
 
253 aa  209  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0198653 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2432  phosphonate ABC transporter permease  54.72 
 
 
275 aa  207  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236507  normal  0.0603094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0788  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  56.43 
 
 
255 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19760  phosphonate ABC transporter, permease component  59.92 
 
 
252 aa  205  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.092761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21150  ABC transporter permease  56.11 
 
 
277 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454841  normal  0.839555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0826  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  53.74 
 
 
275 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107681  normal  0.0222039 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0692  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  58.26 
 
 
255 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.056532  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.88 
 
 
511 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115761  normal  0.0544773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0852  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  54.63 
 
 
431 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1720  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  53.54 
 
 
278 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000362895 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0789  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  57.14 
 
 
275 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.76 
 
 
535 aa  184  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4359  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  59.36 
 
 
255 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  0.555216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4959  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  30.16 
 
 
588 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2239  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  48.93 
 
 
279 aa  164  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3945  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.2 
 
 
294 aa  154  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.351226  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2058  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  51.26 
 
 
279 aa  153  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149072  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
539 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.687292  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.79 
 
 
276 aa  147  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.42 
 
 
276 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.42 
 
 
276 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.74 
 
 
272 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3326  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  30.45 
 
 
365 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.25 
 
 
269 aa  136  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3473  phosphonate ABC transporter permease  31.68 
 
 
264 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3439  phosphonate ABC transporter, permease  31.68 
 
 
264 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3744  phosphonate ABC transporter, permease protein  31.68 
 
 
264 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000212765  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3748  phosphonate ABC transporter permease  31.68 
 
 
264 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1522  phosphonate ABC transporter, permease protein  30.53 
 
 
264 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.0146163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6356  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.69 
 
 
298 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.690717  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3702  phosphonate ABC transporter, permease protein  31.68 
 
 
264 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000191718 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.51 
 
 
271 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  40.09 
 
 
271 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.32 
 
 
277 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  40.09 
 
 
271 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  38.96 
 
 
271 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  40.09 
 
 
271 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.64 
 
 
271 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.64 
 
 
271 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.32 
 
 
277 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  40.09 
 
 
271 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.18 
 
 
270 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3390  phosphonate ABC transporter, permease  31.68 
 
 
264 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0936447  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.48 
 
 
504 aa  134  5e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0459  ABC type permease  40.82 
 
 
261 aa  133  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0423  ABC type permease  40.82 
 
 
261 aa  133  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436548  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0132  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  27.94 
 
 
266 aa  133  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0127  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  27.94 
 
 
266 aa  133  6.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
556 aa  133  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.96 
 
 
259 aa  133  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3793  phosphonate ABC transporter, permease protein  30.92 
 
 
264 aa  133  9e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2338  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.92 
 
 
265 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000033517  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.1 
 
 
488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0381583  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 
263 aa  131  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.64 
 
 
341 aa  131  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.64 
 
 
341 aa  131  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.16 
 
 
266 aa  130  5.0000000000000004e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3721  phosphonate ABC transporter, permease protein  33.65 
 
 
264 aa  130  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254444  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3371  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.12 
 
 
264 aa  130  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0022523  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  39.27 
 
 
275 aa  130  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2284  phosphonate ABC transporter, permease protein  28.89 
 
 
266 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0852833  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4522  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.88 
 
 
280 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  37.16 
 
 
259 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.82 
 
 
259 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  37.16 
 
 
272 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  37.16 
 
 
259 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  37.16 
 
 
259 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0837  ABC phosphonate transporter, inner membrane subunit PhnE  37.16 
 
 
280 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.16 
 
 
259 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
543 aa  128  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 
259 aa  128  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4621  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.68 
 
 
280 aa  128  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438003 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4996  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
264 aa  127  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0396446  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3720  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.78 
 
 
267 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0181873  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3472  phosphonate ABC transporter permease  39.78 
 
 
267 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.153404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>