268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2238 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_2238  phosphonate ABC transporter permease  100 
 
 
281 aa  546  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.09 
 
 
279 aa  406  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0800707  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1617  phosphonate ABC transporter permease  76.36 
 
 
284 aa  395  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.36633  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.4 
 
 
282 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000186214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.41 
 
 
275 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141056  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1824  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  52.4 
 
 
518 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147268 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1689  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  54.28 
 
 
523 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.365245 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.04 
 
 
523 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19770  phosphonate ABC transporter, permease component  58.09 
 
 
276 aa  251  9.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0593864  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.97 
 
 
275 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3336  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  53.18 
 
 
521 aa  244  9e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.45187 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3199  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  57.35 
 
 
275 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0131264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0826  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  59.03 
 
 
275 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107681  normal  0.0222039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1804  ABC transporter permease  56.5 
 
 
277 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2432  phosphonate ABC transporter permease  56.18 
 
 
275 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236507  normal  0.0603094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0852  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  59.47 
 
 
431 aa  221  9e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0693  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  55.97 
 
 
275 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0773426  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0789  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  56.34 
 
 
275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21150  ABC transporter permease  61.88 
 
 
277 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454841  normal  0.839555 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0456  ABC phosphonate transporter, fused inner membrane subunits  41.06 
 
 
576 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0485  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.28 
 
 
576 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0490  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.98 
 
 
576 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3945  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.44 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.351226  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.39 
 
 
271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.22 
 
 
276 aa  129  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21140  ABC transporter permease  38.13 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0807284  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.22 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.22 
 
 
276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.7 
 
 
272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2431  phosphonate ABC transporter permease  45.27 
 
 
255 aa  126  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0629355  normal  0.0565288 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0692  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.76 
 
 
255 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.056532  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1803  phosphonate ABC transporter permease PhnE  39.09 
 
 
256 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0868  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.98 
 
 
255 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0788  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  44.06 
 
 
255 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0853  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.75 
 
 
255 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3200  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
253 aa  123  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0198653 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0827  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  36.28 
 
 
255 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0220667 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2012  putative ABC transporter inner membrane component  36.11 
 
 
271 aa  122  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100736  decreased coverage  0.00339933 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0423  ABC type permease  37.69 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436548  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0459  ABC type permease  37.69 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  34.58 
 
 
259 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1418  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.4 
 
 
266 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  33.96 
 
 
259 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  34.58 
 
 
272 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19760  phosphonate ABC transporter, permease component  37.99 
 
 
252 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.092761  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.58 
 
 
259 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6356  phosphonate ABC transporter, permease protein  37.44 
 
 
298 aa  120  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.690717  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  34.58 
 
 
259 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0367  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.71 
 
 
272 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  34.58 
 
 
259 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  34.58 
 
 
259 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3326  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  35.62 
 
 
365 aa  119  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2680  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39 
 
 
298 aa  119  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000232167  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.53 
 
 
277 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2185  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.63 
 
 
290 aa  119  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.53 
 
 
277 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.45 
 
 
259 aa  118  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3822  phosphonate ABC transporter permease  38.56 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571251  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5856  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  35.18 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234805  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  33.33 
 
 
275 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
539 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.687292  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3020  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  47.03 
 
 
570 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.35 
 
 
266 aa  115  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1413  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.31 
 
 
299 aa  115  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3965  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.86 
 
 
272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.692533 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  34.23 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  34.23 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  34.23 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  34.23 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  34.23 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  34.23 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2993  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  36.65 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  34.23 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2674  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.65 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1342  phosphonate ABC transporter permease  33.58 
 
 
293 aa  113  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0250  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  35.5 
 
 
277 aa  112  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.03 
 
 
263 aa  112  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6365  phosphonate ABC transporter, permease component  38.43 
 
 
289 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0563067  normal  0.924702 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3236  phosphonate ABC transporter permease  31.78 
 
 
276 aa  112  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.17 
 
 
293 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0897  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.8 
 
 
298 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.223328  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2796  phosphonate ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 
293 aa  112  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4577  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0183  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  34.58 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685184  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4996  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.7 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0396446  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.17 
 
 
341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.17 
 
 
341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4522  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.39 
 
 
280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.07 
 
 
270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4430  phosphonate ABC transporter permease  35.68 
 
 
293 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1925  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  30.45 
 
 
272 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.77597  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0837  ABC phosphonate transporter, inner membrane subunit PhnE  31.67 
 
 
280 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2298  ABC phosphonate permease  33.5 
 
 
271 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3860  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.22 
 
 
293 aa  109  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.206995  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4621  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.08 
 
 
280 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438003 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1720  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.94 
 
 
278 aa  108  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000362895 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3473  phosphonate ABC transporter permease  28.76 
 
 
264 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3390  phosphonate ABC transporter, permease  28.76 
 
 
264 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0936447  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2297  ABC phosphonate permease  34.88 
 
 
268 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3702  phosphonate ABC transporter, permease protein  28.76 
 
 
264 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000191718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>