255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3494 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
539 aa  1039    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.687292  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  77.33 
 
 
543 aa  683    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.74 
 
 
488 aa  469  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0381583  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.54 
 
 
506 aa  386  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.539581  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 
510 aa  360  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.51 
 
 
504 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3311  putative phosphonate ABC transporter, permease protein  41.41 
 
 
503 aa  354  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.251777  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.89 
 
 
509 aa  350  5e-95  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.04 
 
 
501 aa  350  6e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.213097  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.88 
 
 
505 aa  345  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1768  ABC transporter complex for phosphonate inner membrane binding subunit  42.24 
 
 
496 aa  344  2.9999999999999997e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0117243  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.59 
 
 
499 aa  331  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.440289  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.49 
 
 
496 aa  318  2e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3336  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.4 
 
 
521 aa  144  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.45187 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36 
 
 
279 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0800707  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
282 aa  116  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000186214 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1617  phosphonate ABC transporter permease  46.56 
 
 
284 aa  114  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.36633  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2238  phosphonate ABC transporter permease  37.19 
 
 
281 aa  111  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3020  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.11 
 
 
570 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0490  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.51 
 
 
576 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0456  ABC phosphonate transporter, fused inner membrane subunits  28.89 
 
 
576 aa  107  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
535 aa  105  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0485  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.51 
 
 
576 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
523 aa  103  8e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1689  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.82 
 
 
523 aa  102  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.365245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3199  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  46.9 
 
 
275 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0131264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.28 
 
 
275 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141056  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1824  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  41.98 
 
 
518 aa  100  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147268 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0693  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.02 
 
 
275 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0773426  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.91 
 
 
275 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2432  phosphonate ABC transporter permease  45.13 
 
 
275 aa  99  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236507  normal  0.0603094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1804  ABC transporter permease  46.02 
 
 
277 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21150  ABC transporter permease  45.61 
 
 
277 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454841  normal  0.839555 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0826  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  43.65 
 
 
275 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107681  normal  0.0222039 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0789  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  45.13 
 
 
275 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0852  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.65 
 
 
431 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19770  phosphonate ABC transporter, permease component  43.33 
 
 
276 aa  94.7  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0593864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1322  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  25.9 
 
 
533 aa  92  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497345  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  26.11 
 
 
511 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115761  normal  0.0544773 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14291  putative phosphonate ABC transporter  27.87 
 
 
521 aa  87.4  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3945  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.11 
 
 
294 aa  85.9  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.351226  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
271 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
271 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
271 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  34.48 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  34.48 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  34.48 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  34.48 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.53 
 
 
277 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.53 
 
 
277 aa  84  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0103  ABC-type phosphate/phosphonate transport system permease component  22.6 
 
 
516 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0671  putative phosphonate ABC transporter  28.12 
 
 
500 aa  83.2  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1418  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.16 
 
 
266 aa  82  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.48 
 
 
272 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07841  putative phosphonate ABC transporter  25.12 
 
 
510 aa  81.3  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360834 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.1 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.1 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4430  phosphonate ABC transporter permease  35.62 
 
 
293 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5856  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  35.92 
 
 
294 aa  79  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234805  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0859  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.72 
 
 
263 aa  79  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0148333  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  30.53 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4086  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  32.65 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0261465  normal  0.0836049 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2185  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.78 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1185  putative phosphonate ABC transporter  33.93 
 
 
509 aa  77.4  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.234014  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.69 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2993  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  29.22 
 
 
266 aa  76.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0766  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.21 
 
 
293 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2674  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.22 
 
 
266 aa  76.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3793  phosphonate ABC transporter, permease protein  27.42 
 
 
264 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3721  phosphonate ABC transporter, permease protein  27.42 
 
 
264 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254444  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.88 
 
 
269 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3822  phosphonate ABC transporter permease  33.33 
 
 
300 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571251  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0367  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  26.15 
 
 
272 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3744  phosphonate ABC transporter, permease protein  27.42 
 
 
264 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000212765  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1522  phosphonate ABC transporter, permease protein  26.88 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.0146163 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.69 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3371  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  27.42 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0022523  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3473  phosphonate ABC transporter permease  27.42 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3390  phosphonate ABC transporter, permease  27.42 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0936447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3748  phosphonate ABC transporter permease  27.42 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3702  phosphonate ABC transporter, permease protein  27.42 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000191718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4577  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.62 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3439  phosphonate ABC transporter, permease  27.42 
 
 
264 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2338  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  27.42 
 
 
265 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000033517  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.14 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0868  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.55 
 
 
255 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0827  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  30.85 
 
 
255 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0220667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0853  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.85 
 
 
255 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3720  phosphonate ABC transporter, permease protein  30 
 
 
267 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0181873  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3472  phosphonate ABC transporter permease  30 
 
 
267 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.153404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3438  phosphonate ABC transporter, permease  30 
 
 
267 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.573649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3389  phosphonate ABC transporter, permease  30 
 
 
267 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00227176  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2202  phosphonate ABC transporter inner membrane subunit  33.33 
 
 
542 aa  72.4  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2012  putative ABC transporter inner membrane component  28.68 
 
 
271 aa  72.4  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100736  decreased coverage  0.00339933 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3747  phosphonate ABC transporter permease  30 
 
 
267 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.375049  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3701  phosphonate ABC transporter, permease protein  30 
 
 
267 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177586 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07441  putative phosphonate ABC transporter  32.98 
 
 
500 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.314852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3792  phosphonate ABC transporter, permease protein  30 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1451  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.33 
 
 
269 aa  72  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.349089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>