230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0103 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0103  ABC-type phosphate/phosphonate transport system permease component  100 
 
 
516 aa  1004    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07281  putative phosphonate ABC transporter  99.03 
 
 
516 aa  993    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.058351  hitchhiker  0.00530258 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07841  putative phosphonate ABC transporter  50.5 
 
 
510 aa  421  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360834 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14291  putative phosphonate ABC transporter  45.42 
 
 
521 aa  389  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0671  putative phosphonate ABC transporter  38.92 
 
 
500 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07441  putative phosphonate ABC transporter  40.6 
 
 
500 aa  286  8e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.314852  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1292  putative phosphonate ABC transporter  38.51 
 
 
510 aa  270  5.9999999999999995e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.871722  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1185  putative phosphonate ABC transporter  39.1 
 
 
509 aa  265  1e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.234014  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07241  putative phosphonate ABC transporter  38.86 
 
 
376 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07261  putative phosphonate ABC transporter  39.38 
 
 
376 aa  226  6e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.06 
 
 
535 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3336  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  25.43 
 
 
521 aa  119  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.45187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.87 
 
 
523 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1689  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  22.87 
 
 
523 aa  102  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.365245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.38 
 
 
279 aa  99  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0800707  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.91 
 
 
510 aa  98.6  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.04 
 
 
275 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141056  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0456  ABC phosphonate transporter, fused inner membrane subunits  26.46 
 
 
576 aa  97.1  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.94 
 
 
488 aa  97.1  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0381583  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1824  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  27.54 
 
 
518 aa  95.1  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147268 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28 
 
 
501 aa  93.2  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.213097  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  23.19 
 
 
539 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.687292  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
275 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2432  phosphonate ABC transporter permease  33.8 
 
 
275 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236507  normal  0.0603094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.06 
 
 
506 aa  90.5  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.539581  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.3 
 
 
282 aa  90.1  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000186214 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0826  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  35.96 
 
 
275 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107681  normal  0.0222039 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0693  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.77 
 
 
275 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0773426  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3199  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.1 
 
 
275 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0131264 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  24.27 
 
 
259 aa  88.6  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  24.27 
 
 
272 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.12 
 
 
263 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.27 
 
 
259 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  24.27 
 
 
259 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  24.27 
 
 
259 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  24.27 
 
 
259 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0852  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.96 
 
 
431 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19770  phosphonate ABC transporter, permease component  26.5 
 
 
276 aa  87  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0593864  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.02 
 
 
277 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  24.27 
 
 
259 aa  87  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.02 
 
 
277 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0789  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  31.93 
 
 
275 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0183  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  27.59 
 
 
267 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685184  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2238  phosphonate ABC transporter permease  27.09 
 
 
281 aa  86.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.27 
 
 
259 aa  85.5  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0485  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.33 
 
 
576 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20330  phosphonate ABC tranporter permease protein  26.9 
 
 
264 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.293398  normal  0.582568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1747  phosphonate ABC transporter permease PhnE  26.9 
 
 
264 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.69 
 
 
505 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4621  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  25.13 
 
 
280 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438003 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0490  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.33 
 
 
576 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2557  phosphonates ABC transporter, permease protein  26.7 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108995  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30 
 
 
270 aa  83.6  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1804  ABC transporter permease  32.77 
 
 
277 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21150  ABC transporter permease  33.61 
 
 
277 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454841  normal  0.839555 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1768  ABC transporter complex for phosphonate inner membrane binding subunit  22.85 
 
 
496 aa  83.2  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0117243  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2249  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  25.65 
 
 
262 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.859646  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.54 
 
 
266 aa  82  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1617  phosphonate ABC transporter permease  31.06 
 
 
284 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.36633  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.08 
 
 
543 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0853  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  26.27 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  25.88 
 
 
269 aa  80.9  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0827  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  26.51 
 
 
255 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0220667 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4522  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  23.56 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.34 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0837  ABC phosphonate transporter, inner membrane subunit PhnE  23.56 
 
 
280 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  25.35 
 
 
271 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  25.35 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0868  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  25.81 
 
 
255 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  25.35 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  25.35 
 
 
271 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  25.35 
 
 
271 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  25.35 
 
 
271 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  25.35 
 
 
271 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3311  putative phosphonate ABC transporter, permease protein  30.52 
 
 
503 aa  78.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.251777  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1418  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  23.48 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.5 
 
 
509 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  26.51 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3822  phosphonate ABC transporter permease  25.36 
 
 
300 aa  77  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571251  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2185  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.2 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.52 
 
 
277 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17510  Phosphonate transport systems inner membrane component  23.66 
 
 
269 aa  75.1  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2918  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  26.67 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4151  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  22.73 
 
 
274 aa  73.6  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2674  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  23.26 
 
 
266 aa  72.4  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2676  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.68 
 
 
256 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0566744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5856  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  26.76 
 
 
294 aa  72.4  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234805  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2993  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  23.26 
 
 
266 aa  72.4  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4995  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  23.68 
 
 
245 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250762  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2287  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  22.73 
 
 
274 aa  72.4  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.15 
 
 
504 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3945  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  23.12 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.351226  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4430  phosphonate ABC transporter permease  24.42 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3860  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  25.53 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.206995  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3326  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  23.93 
 
 
365 aa  70.5  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.26 
 
 
499 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.440289  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4996  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.55 
 
 
264 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0396446  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6365  phosphonate ABC transporter, permease component  26.76 
 
 
289 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0563067  normal  0.924702 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3472  phosphonate ABC transporter permease  30.71 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.153404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3438  phosphonate ABC transporter, permease  30.71 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.573649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>