197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1292 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1292  putative phosphonate ABC transporter  100 
 
 
510 aa  964    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.871722  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1185  putative phosphonate ABC transporter  61.54 
 
 
509 aa  481  1e-134  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.234014  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14291  putative phosphonate ABC transporter  43.63 
 
 
521 aa  341  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0103  ABC-type phosphate/phosphonate transport system permease component  37.75 
 
 
516 aa  335  7.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07281  putative phosphonate ABC transporter  38.34 
 
 
516 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.058351  hitchhiker  0.00530258 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07841  putative phosphonate ABC transporter  39.28 
 
 
510 aa  300  4e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360834 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0671  putative phosphonate ABC transporter  32.19 
 
 
500 aa  257  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07441  putative phosphonate ABC transporter  31.03 
 
 
500 aa  224  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.314852  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07241  putative phosphonate ABC transporter  30.87 
 
 
376 aa  186  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07261  putative phosphonate ABC transporter  29.02 
 
 
376 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.85 
 
 
504 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3336  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.7 
 
 
521 aa  114  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.45187 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.88 
 
 
488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0381583  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1824  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  26.62 
 
 
518 aa  110  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147268 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.3 
 
 
501 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.213097  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1768  ABC transporter complex for phosphonate inner membrane binding subunit  26.51 
 
 
496 aa  109  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0117243  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.01 
 
 
510 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.67 
 
 
505 aa  107  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  24.54 
 
 
509 aa  100  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
535 aa  98.6  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  26.7 
 
 
523 aa  97.4  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1689  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  26.86 
 
 
523 aa  96.3  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.365245 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  25.97 
 
 
506 aa  94.7  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.539581  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 
543 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
539 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.687292  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  25.97 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  25.97 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  25.97 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  25.97 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  26.23 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  25.97 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  25.97 
 
 
259 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  26.26 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.89 
 
 
279 aa  76.6  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0800707  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3199  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.27 
 
 
275 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0131264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19770  phosphonate ABC transporter, permease component  28.91 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0593864  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0693  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.12 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0773426  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0789  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 
275 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3945  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.86 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.351226  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2298  ABC phosphonate permease  31.25 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2432  phosphonate ABC transporter permease  31.41 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236507  normal  0.0603094 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.43 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.26 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000186214 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0456  ABC phosphonate transporter, fused inner membrane subunits  26.06 
 
 
576 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1617  phosphonate ABC transporter permease  30.77 
 
 
284 aa  69.3  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.36633  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
275 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3311  putative phosphonate ABC transporter, permease protein  26.94 
 
 
503 aa  68.6  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.251777  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0837  ABC phosphonate transporter, inner membrane subunit PhnE  27.43 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0826  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 
275 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107681  normal  0.0222039 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
499 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.440289  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4522  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  25.65 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1418  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  27.32 
 
 
266 aa  67  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  30.77 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.34 
 
 
277 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.34 
 
 
277 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
275 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141056  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2238  phosphonate ABC transporter permease  31.21 
 
 
281 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0852  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
431 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21150  ABC transporter permease  32.85 
 
 
277 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454841  normal  0.839555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  25.88 
 
 
277 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1804  ABC transporter permease  32.85 
 
 
277 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4621  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  25.75 
 
 
280 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438003 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.47 
 
 
341 aa  64.7  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.47 
 
 
341 aa  64.7  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2081  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  25.59 
 
 
335 aa  63.5  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2431  phosphonate ABC transporter permease  32.58 
 
 
255 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0629355  normal  0.0565288 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
556 aa  63.5  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0183  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  27.01 
 
 
267 aa  63.5  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685184  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4995  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.61 
 
 
245 aa  63.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.250762  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.21 
 
 
276 aa  63.5  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.21 
 
 
276 aa  63.5  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.24 
 
 
269 aa  63.2  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0367  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  26.06 
 
 
272 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4785  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  29.35 
 
 
280 aa  62  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161487  normal  0.0587654 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.21 
 
 
276 aa  62.8  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.21 
 
 
270 aa  62  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.24 
 
 
263 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3792  phosphonate ABC transporter, permease protein  31.97 
 
 
267 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3743  phosphonate ABC transporter, permease protein  32.48 
 
 
267 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000033324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3370  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.48 
 
 
267 aa  61.6  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000747615  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  25.82 
 
 
271 aa  62  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  23.04 
 
 
271 aa  62  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 
271 aa  62  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  25.82 
 
 
271 aa  62  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0423  ABC type permease  30.82 
 
 
261 aa  62  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436548  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0459  ABC type permease  30.82 
 
 
261 aa  62  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  25.82 
 
 
271 aa  62  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 
271 aa  62  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  32.14 
 
 
271 aa  62  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  25.82 
 
 
271 aa  62  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2185  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  25.33 
 
 
290 aa  61.6  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3472  phosphonate ABC transporter permease  32.48 
 
 
267 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.153404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3438  phosphonate ABC transporter, permease  32.48 
 
 
267 aa  61.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.573649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3389  phosphonate ABC transporter, permease  32.48 
 
 
267 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00227176  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3747  phosphonate ABC transporter permease  32.48 
 
 
267 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.375049  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0490  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.82 
 
 
576 aa  61.6  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  23.74 
 
 
266 aa  61.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3701  phosphonate ABC transporter, permease protein  32.48 
 
 
267 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177586 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1523  phosphonate ABC transporter, permease protein  32.48 
 
 
267 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137606  normal  0.0137345 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3236  phosphonate ABC transporter permease  26.11 
 
 
276 aa  60.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>