273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0867 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
275 aa  527  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  87.64 
 
 
275 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141056  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0826  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  96.03 
 
 
275 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107681  normal  0.0222039 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0852  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  95.24 
 
 
431 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2432  phosphonate ABC transporter permease  80.66 
 
 
275 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236507  normal  0.0603094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3199  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  75.55 
 
 
275 aa  358  6e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0131264 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0693  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  81.92 
 
 
275 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0773426  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19770  phosphonate ABC transporter, permease component  75.27 
 
 
276 aa  351  7e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0593864  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0789  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  79.93 
 
 
275 aa  338  4e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1804  ABC transporter permease  75.84 
 
 
277 aa  329  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21150  ABC transporter permease  75.41 
 
 
277 aa  300  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454841  normal  0.839555 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.88 
 
 
279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0800707  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.18 
 
 
282 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000186214 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1617  phosphonate ABC transporter permease  57.88 
 
 
284 aa  260  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.36633  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1689  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  55.85 
 
 
523 aa  257  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.365245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3336  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  56.23 
 
 
521 aa  257  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.45187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.85 
 
 
523 aa  256  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1824  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  53.14 
 
 
518 aa  256  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2238  phosphonate ABC transporter permease  57.04 
 
 
281 aa  238  5e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0456  ABC phosphonate transporter, fused inner membrane subunits  47.97 
 
 
576 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0485  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  47.15 
 
 
576 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0490  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  47.15 
 
 
576 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3945  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.32 
 
 
294 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.351226  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.8 
 
 
271 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1803  phosphonate ABC transporter permease PhnE  41.91 
 
 
256 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.26 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3020  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  48.68 
 
 
570 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21140  ABC transporter permease  41.7 
 
 
256 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0807284  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.48 
 
 
277 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.48 
 
 
277 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0868  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.59 
 
 
255 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19760  phosphonate ABC transporter, permease component  40.66 
 
 
252 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.092761  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4577  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.5 
 
 
271 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.85 
 
 
259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3860  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  44.03 
 
 
293 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.206995  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4151  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.53 
 
 
274 aa  132  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.91 
 
 
276 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  37.99 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0423  ABC type permease  38.61 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436548  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  37.99 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  37.99 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2431  phosphonate ABC transporter permease  37.92 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0629355  normal  0.0565288 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0459  ABC type permease  38.61 
 
 
261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  37.99 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  37.99 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  37.99 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  37.99 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.48 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2287  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.09 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.48 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  34.43 
 
 
259 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35 
 
 
263 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0788  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  46.53 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0853  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.39 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 
259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0766  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.6 
 
 
293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0692  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  45.83 
 
 
255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.056532  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4522  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.34 
 
 
280 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2185  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.14 
 
 
290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3200  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  48.09 
 
 
253 aa  129  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0198653 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3822  phosphonate ABC transporter permease  44.37 
 
 
300 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571251  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0827  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  38.46 
 
 
255 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0220667 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 
259 aa  128  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  34.71 
 
 
272 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5856  putative PhnE protein, phosphonate ABC transporter, putative membrane protein  44.23 
 
 
294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234805  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3390  phosphonate ABC transporter, permease  30.4 
 
 
264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0936447  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.71 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 
259 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3702  phosphonate ABC transporter, permease protein  30.4 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000191718 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3473  phosphonate ABC transporter permease  30.4 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3439  phosphonate ABC transporter, permease  30.4 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3748  phosphonate ABC transporter permease  30.4 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1320  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.14 
 
 
294 aa  127  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0837  ABC phosphonate transporter, inner membrane subunit PhnE  34.94 
 
 
280 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4430  phosphonate ABC transporter permease  42.95 
 
 
293 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.6 
 
 
341 aa  125  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.6 
 
 
341 aa  125  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1418  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.31 
 
 
266 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6356  phosphonate ABC transporter, permease protein  38.16 
 
 
298 aa  125  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.690717  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3744  phosphonate ABC transporter, permease protein  29.3 
 
 
264 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000212765  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4621  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.77 
 
 
280 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438003 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2918  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.31 
 
 
294 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1522  phosphonate ABC transporter, permease protein  30.04 
 
 
264 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.0146163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17510  Phosphonate transport systems inner membrane component  33.98 
 
 
269 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.77 
 
 
270 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3793  phosphonate ABC transporter, permease protein  29.3 
 
 
264 aa  123  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3326  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  31.8 
 
 
365 aa  122  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4086  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  40.88 
 
 
293 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0261465  normal  0.0836049 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  37.62 
 
 
275 aa  122  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2557  phosphonates ABC transporter, permease protein  35.65 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108995  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2298  ABC phosphonate permease  35.94 
 
 
271 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4203  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  42.77 
 
 
294 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.852389  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3721  phosphonate ABC transporter, permease protein  33.03 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2249  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.17 
 
 
262 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.859646  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.37 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0367  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.64 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20330  phosphonate ABC tranporter permease protein  35.02 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.293398  normal  0.582568 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3371  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.11 
 
 
264 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0022523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>