More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1824 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.1 
 
 
523 aa  664    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1824  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 
518 aa  1004    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147268 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3336  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  75.49 
 
 
521 aa  709    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.45187 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1689  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  72.9 
 
 
523 aa  659    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.365245 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0485  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  44.87 
 
 
576 aa  292  9e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0456  ABC phosphonate transporter, fused inner membrane subunits  43.35 
 
 
576 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0490  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  43.16 
 
 
576 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.7 
 
 
279 aa  256  9e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0800707  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.24 
 
 
275 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141056  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.43 
 
 
282 aa  241  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000186214 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3020  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.26 
 
 
570 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1617  phosphonate ABC transporter permease  54.81 
 
 
284 aa  239  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.36633  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0868  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  57.2 
 
 
255 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19770  phosphonate ABC transporter, permease component  55.51 
 
 
276 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0593864  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1803  phosphonate ABC transporter permease PhnE  57.43 
 
 
256 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0853  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  56.38 
 
 
255 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2238  phosphonate ABC transporter permease  51.66 
 
 
281 aa  227  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21140  ABC transporter permease  56.22 
 
 
256 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0807284  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0827  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  56.79 
 
 
255 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0220667 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3199  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  53.31 
 
 
275 aa  226  7e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0131264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2431  phosphonate ABC transporter permease  55.97 
 
 
255 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0629355  normal  0.0565288 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.38 
 
 
275 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0788  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  54.66 
 
 
255 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19760  phosphonate ABC transporter, permease component  57.63 
 
 
252 aa  219  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.092761  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3200  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  55.93 
 
 
253 aa  212  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0198653 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1804  ABC transporter permease  52.14 
 
 
277 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0692  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  58.62 
 
 
255 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.056532  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2432  phosphonate ABC transporter permease  53.68 
 
 
275 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236507  normal  0.0603094 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0693  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  53.31 
 
 
275 aa  208  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0773426  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1720  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  55.56 
 
 
278 aa  207  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000362895 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.67 
 
 
511 aa  203  7e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115761  normal  0.0544773 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0826  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  52.21 
 
 
275 aa  199  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107681  normal  0.0222039 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1322  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.26 
 
 
533 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497345  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0852  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  51.33 
 
 
431 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21150  ABC transporter permease  53.57 
 
 
277 aa  197  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454841  normal  0.839555 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0789  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  53.68 
 
 
275 aa  194  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4359  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  55.42 
 
 
255 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  0.555216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2239  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  48.48 
 
 
279 aa  168  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2058  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  52.54 
 
 
279 aa  166  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.149072  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.88 
 
 
535 aa  160  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.6 
 
 
277 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.6 
 
 
277 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  41.55 
 
 
271 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  41.55 
 
 
271 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  41.55 
 
 
271 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  41.55 
 
 
271 aa  152  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  41.1 
 
 
271 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  41.1 
 
 
271 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  40.65 
 
 
271 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1618  phosphonate ABC transporter permease  49.78 
 
 
274 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.177587  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4522  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.52 
 
 
280 aa  146  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.26 
 
 
488 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0381583  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0837  ABC phosphonate transporter, inner membrane subunit PhnE  38.6 
 
 
280 aa  146  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3945  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.65 
 
 
294 aa  145  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.351226  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.63 
 
 
539 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.687292  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6356  phosphonate ABC transporter, permease protein  35.45 
 
 
298 aa  143  7e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.690717  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1280  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
276 aa  143  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61484  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3311  putative phosphonate ABC transporter, permease protein  27 
 
 
503 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.251777  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3991  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.04 
 
 
276 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3240  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.04 
 
 
276 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.655899  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.5 
 
 
270 aa  139  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.03 
 
 
269 aa  138  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  41.01 
 
 
272 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0912  phosphate ABC transporter permease  37.14 
 
 
275 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.166132  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0459  ABC type permease  40.7 
 
 
261 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.110388  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4621  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.65 
 
 
280 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.438003 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0423  ABC type permease  40.7 
 
 
261 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436548  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  34.33 
 
 
259 aa  134  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.45 
 
 
259 aa  133  7.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.14 
 
 
266 aa  133  7.999999999999999e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.74 
 
 
263 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4036  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.1 
 
 
341 aa  131  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.311979  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0216  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  40.1 
 
 
341 aa  131  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3326  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  32.64 
 
 
365 aa  131  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1418  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  38.95 
 
 
266 aa  131  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.45 
 
 
259 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.11 
 
 
271 aa  130  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.45 
 
 
259 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.45 
 
 
259 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  39.35 
 
 
259 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  39.45 
 
 
259 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20330  phosphonate ABC tranporter permease protein  37.44 
 
 
264 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.293398  normal  0.582568 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.92 
 
 
499 aa  130  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.440289  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.93 
 
 
510 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  38.53 
 
 
272 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1747  phosphonate ABC transporter permease PhnE  37.44 
 
 
264 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.415612  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.34 
 
 
509 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4996  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.6 
 
 
264 aa  127  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0396446  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1320  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  33.59 
 
 
294 aa  126  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2249  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.34 
 
 
262 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.859646  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0367  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.65 
 
 
272 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5875  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.06 
 
 
277 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0127  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.6 
 
 
266 aa  125  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1522  phosphonate ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
264 aa  125  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.0146163 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0132  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  32.6 
 
 
266 aa  125  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3793  phosphonate ABC transporter, permease protein  33.49 
 
 
264 aa  124  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3822  phosphonate ABC transporter permease  36.1 
 
 
300 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571251  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3390  phosphonate ABC transporter, permease  33.33 
 
 
264 aa  124  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0936447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3748  phosphonate ABC transporter permease  33.33 
 
 
264 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3702  phosphonate ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
264 aa  124  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000191718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>