240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2801 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_1794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.4 
 
 
510 aa  776    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134566  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.27 
 
 
509 aa  677    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
501 aa  999    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.213097  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.94 
 
 
504 aa  589  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.8 
 
 
505 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3311  putative phosphonate ABC transporter, permease protein  58.57 
 
 
503 aa  579  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.251777  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1768  ABC transporter complex for phosphonate inner membrane binding subunit  59.48 
 
 
496 aa  562  1.0000000000000001e-159  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0117243  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1545  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.23 
 
 
499 aa  553  1e-156  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.440289  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.75 
 
 
496 aa  525  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.97 
 
 
506 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.539581  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.95 
 
 
488 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0381583  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3494  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 
539 aa  347  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.687292  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.72 
 
 
543 aa  330  4e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1617  phosphonate ABC transporter permease  37.12 
 
 
284 aa  101  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.36633  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1721  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 
282 aa  100  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000186214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
279 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0800707  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2238  phosphonate ABC transporter permease  39.85 
 
 
281 aa  98.2  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1824  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  36.5 
 
 
518 aa  91.7  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.147268 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
523 aa  91.3  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4360  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.28 
 
 
275 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.141056  normal  0.676785 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1689  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.91 
 
 
523 aa  90.1  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.365245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3336  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.33 
 
 
521 aa  89.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.45187 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14291  putative phosphonate ABC transporter  27.23 
 
 
521 aa  89  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0456  ABC phosphonate transporter, fused inner membrane subunits  27.04 
 
 
576 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2432  phosphonate ABC transporter permease  37.17 
 
 
275 aa  87  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.236507  normal  0.0603094 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0826  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  36.28 
 
 
275 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.107681  normal  0.0222039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3257  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.1 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814913  normal  0.191415 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19770  phosphonate ABC transporter, permease component  36.13 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0593864  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3199  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  37.17 
 
 
275 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0131264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0867  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.23 
 
 
275 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.9 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3857  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.9 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0852  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  36.28 
 
 
431 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.539789 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21150  ABC transporter permease  35.09 
 
 
277 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.454841  normal  0.839555 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1804  ABC transporter permease  35.09 
 
 
277 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07841  putative phosphonate ABC transporter  25.99 
 
 
510 aa  81.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360834 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1522  phosphonate ABC transporter, permease protein  26.94 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0252842  normal  0.0146163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0789  phosphonate ABC transporter, permease protein, putative  35.4 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0693  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.4 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0773426  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2338  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  25.46 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000033517  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3473  phosphonate ABC transporter permease  27.55 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.410084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3390  phosphonate ABC transporter, permease  27.55 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0936447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3748  phosphonate ABC transporter permease  27.55 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3702  phosphonate ABC transporter, permease protein  27.55 
 
 
264 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000191718 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3439  phosphonate ABC transporter, permease  27.55 
 
 
264 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2409  phosphonates ABC transporter, permease protein  28.05 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3348  phosphonates ABC transporter, permease protein  26.51 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3302  phosphonate ABC transporter, permease protein  26.51 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314465  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3336  phosphonate ABC transporter, permease protein  26.51 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.31183  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2596  phosphonates ABC transporter, permease protein  28.05 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1187  phosphonates ABC transporter, permease protein  28.05 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0326  phosphonates ABC transporter, permease protein  28.05 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0490  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.17 
 
 
576 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1322  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  22.8 
 
 
533 aa  77  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.497345  normal  0.731542 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3744  phosphonate ABC transporter, permease protein  26.02 
 
 
264 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000212765  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0485  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  35.17 
 
 
576 aa  76.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3793  phosphonate ABC transporter, permease protein  26.02 
 
 
264 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.893389  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2906  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.02 
 
 
511 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00115761  normal  0.0544773 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3721  phosphonate ABC transporter, permease protein  27.04 
 
 
264 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.254444  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3020  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  26.98 
 
 
570 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1648  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
535 aa  74.3  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3371  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  26.02 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0022523  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2888  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  27.92 
 
 
263 aa  73.9  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117638  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2966  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  26.7 
 
 
266 aa  72.8  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0367  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.88 
 
 
272 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2675  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  31.5 
 
 
297 aa  71.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0563966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2914  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  26.29 
 
 
269 aa  71.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.263053  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0261  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  27.54 
 
 
271 aa  70.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2011  putative ABC transporter inner membrane component  27.8 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.050434  normal  0.0106691 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1418  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  25.25 
 
 
266 aa  70.5  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2337  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.03 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000326587  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1803  phosphonate ABC transporter permease PhnE  28.67 
 
 
256 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0307  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.62 
 
 
259 aa  69.3  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.685305  normal  0.115805 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4605  phosphonate ABC transporter, permease protein  24.26 
 
 
259 aa  68.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6089  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  26.4 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3707  phosphonate ABC transporter permease  31.16 
 
 
292 aa  69.3  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.324444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21140  ABC transporter permease  28.67 
 
 
256 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0807284  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4657  phosphonate ABC transporter, permease protein  24.62 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4569  phosphonate ABC transporter, permease protein  24.62 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3945  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  26.05 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.351226  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4344  phosphonate ABC transporter, permease protein  24.62 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3923  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  24.62 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4577  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  27.52 
 
 
271 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5616  phosphonate ABC transporter, permease protein  24.62 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03975  phosphonate/organophosphate ester transporter  24.62 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl571  phosphonate ABC transporter permease component  28.65 
 
 
871 aa  68.2  0.0000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.720919  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0827  alkylphosphonate ABC transporter, permease protein  28.8 
 
 
911 aa  67.8  0.0000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0384777  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0250  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  26.92 
 
 
277 aa  67.8  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.435435  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2993  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  27.45 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2674  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  27.45 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0868  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.64 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0853  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  30.06 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0827  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  30.06 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0220667 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3472  phosphonate ABC transporter permease  27.39 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.153404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3701  phosphonate ABC transporter, permease protein  27.39 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000177586 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2081  phosphonate ABC transporter inner membrane protein  25.96 
 
 
335 aa  67.4  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3747  phosphonate ABC transporter permease  27.39 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.375049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3743  phosphonate ABC transporter, permease protein  27.39 
 
 
267 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000033324  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0766  phosphonate ABC transporter, inner membrane subunit  28.42 
 
 
293 aa  67.4  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.688417  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3389  phosphonate ABC transporter, permease  27.39 
 
 
267 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00227176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>