More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2594 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2594  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
314 aa  627  1e-179  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.19 
 
 
326 aa  99.8  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.89 
 
 
331 aa  87  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  28.75 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  28.03 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1063  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  28.16 
 
 
312 aa  82.4  0.000000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.974335  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.25 
 
 
328 aa  81.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  27.88 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.53 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 
373 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.64 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  29.17 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  25.16 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.03 
 
 
336 aa  79  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  27.33 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  27.65 
 
 
328 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.54 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1563  UDP-glucose 4-epimerase  26.35 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  27.84 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2109  putative UDP-glucose 4-epimerase  25.91 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.947732 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  27.6 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6265  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 
379 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  27.27 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2878  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.33 
 
 
322 aa  75.9  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  28.8 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.850459  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.93 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.207226 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
325 aa  75.5  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1753  UDP-glucose 4-epimerase  23.24 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0261532  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  28.03 
 
 
337 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.22 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.27 
 
 
313 aa  74.7  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  27.53 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  28.74 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  30.18 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0737  UDP-glucose 4-epimerase  26.65 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  27.94 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.53 
 
 
317 aa  73.6  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2810  UDP-galactose 4-epimerase  28.78 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0626054  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  27.33 
 
 
328 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2973  UDP-glucose 4-epimerase  26.85 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14357  predicted protein  24.33 
 
 
359 aa  72.8  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  28.18 
 
 
337 aa  73.2  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1467  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  24.86 
 
 
336 aa  72.4  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.9 
 
 
368 aa  72.4  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00157391  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3287  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.1 
 
 
310 aa  72.8  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0956  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.67 
 
 
344 aa  72.8  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  27.67 
 
 
336 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.02 
 
 
326 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  28.93 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3550  UDP-galactose 4-epimerase  30.07 
 
 
355 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.211522 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2271  UDP-glucose 4-epimerase  25.82 
 
 
340 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.967584  normal  0.133855 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_18839  predicted protein  26.28 
 
 
345 aa  72.4  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  28.36 
 
 
330 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01321  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  23.19 
 
 
338 aa  71.6  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.07 
 
 
329 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2591  UDP-galactose 4-epimerase  28.24 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.496154  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  26.73 
 
 
338 aa  71.2  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
324 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2799  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.44 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141685  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  26.55 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3676  UDP-glucose 4-epimerase  29.82 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05730  UDP-galactose 4-epimerase  27.71 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.805791  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.29 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.95 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.72 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.92 
 
 
331 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.14 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  26.61 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.11 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  27.62 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 
313 aa  70.5  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3613  UDP-glucose 4-epimerase  24.56 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.965696  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  26.61 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.14 
 
 
323 aa  70.5  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0877  UDP-glucose 4-epimerase  34.72 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  27.04 
 
 
350 aa  70.1  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  29.02 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25 
 
 
324 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152558  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1774  UDP-galactose 4-epimerase  24.92 
 
 
336 aa  70.1  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3721  putative epimerase/dehydratase  24.66 
 
 
384 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2501  UDP-glucose 4-epimerase  29.12 
 
 
340 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1396  WbnF  24.3 
 
 
352 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.508073  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0370  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
326 aa  69.7  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4331  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  29.76 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1896  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 
331 aa  69.3  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2911  UDP-glucose 4-epimerase  25.68 
 
 
342 aa  69.3  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 
369 aa  68.9  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34177  normal  0.395764 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.13 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0346  UDP-glucose 4-epimerase  25.66 
 
 
351 aa  68.9  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.28 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2329  UDP-galactose 4-epimerase  33.56 
 
 
335 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00335064  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  27.48 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1520  ADP-L-glycero-D-manno-heptose-6-epimerase  24.76 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00376715  hitchhiker  3.69674e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3029  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  22.59 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>