More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2100 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2100  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 443 aa  867    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0629  DNA-directed DNA polymerase  82.9 
 
 		 542 aa  669    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2368  DNA-directed DNA polymerase  58.44 
 
 		 445 aa  467  9.999999999999999e-131  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2776  DNA-directed DNA polymerase  60.23 
 
 		 417 aa  457  1e-127  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285612  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2466  UMUC domain protein DNA-repair protein  58.33 
 
 		 476 aa  455  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.666562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  39.68 
 
 		 360 aa  229  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  36.61 
 
 		 354 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  36.36 
 
 		 367 aa  206  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  35.09 
 
 		 365 aa  204  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  34.25 
 
 		 368 aa  202  8e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  34.81 
 
 		 358 aa  199  9e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  35.18 
 
 		 360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  35.22 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  35.31 
 
 		 371 aa  196  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  34.44 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0642  DNA-directed DNA polymerase  32.97 
 
 		 364 aa  194  3e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  37.19 
 
 		 466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  38.52 
 
 		 380 aa  189  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  38.51 
 
 		 378 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  38.51 
 
 		 378 aa  189  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0560  DNA polymerase IV  32.11 
 
 		 365 aa  187  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  37.14 
 
 		 420 aa  187  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  32.37 
 
 		 364 aa  186  6e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  35.36 
 
 		 359 aa  186  7e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  36.95 
 
 		 424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  38.12 
 
 		 378 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  31.27 
 
 		 393 aa  183  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  35.26 
 
 		 375 aa  183  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  35.56 
 
 		 374 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  36.94 
 
 		 357 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  33.98 
 
 		 369 aa  180  5.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  32.26 
 
 		 364 aa  179  7e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  31.35 
 
 		 389 aa  179  7e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  39.27 
 
 		 376 aa  179  7e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  36.91 
 
 		 384 aa  179  8e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  35.36 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  36.67 
 
 		 357 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  31.51 
 
 		 359 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  38.93 
 
 		 355 aa  179  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  36.77 
 
 		 392 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  33.7 
 
 		 373 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  35.46 
 
 		 425 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  33.15 
 
 		 359 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  28.8 
 
 		 345 aa  177  4e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  33.83 
 
 		 834 aa  177  4e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  34.92 
 
 		 381 aa  177  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  34.89 
 
 		 363 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  34.76 
 
 		 363 aa  176  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  35.57 
 
 		 359 aa  176  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  36.09 
 
 		 356 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  33.33 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  31.03 
 
 		 367 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  36.94 
 
 		 408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  33.33 
 
 		 449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  36.94 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1128  DNA polymerase IV  39.34 
 
 		 429 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456598  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  36.19 
 
 		 405 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  36.94 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  33.33 
 
 		 417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  37.13 
 
 		 419 aa  173  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06310  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  33.88 
 
 		 454 aa  173  5e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  36.68 
 
 		 410 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  34.77 
 
 		 378 aa  172  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2507  DNA-directed DNA polymerase  31.47 
 
 		 358 aa  172  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  39.4 
 
 		 379 aa  172  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  37.8 
 
 		 410 aa  172  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  33.97 
 
 		 365 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  39.56 
 
 		 356 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  31.32 
 
 		 359 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0931  DNA polymerase IV  30.93 
 
 		 353 aa  172  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.643762  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0274  DNA-directed DNA polymerase  33.59 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  41.85 
 
 		 369 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  35.2 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  36.91 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1587  DNA polymerase IV  38.41 
 
 		 362 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  37.43 
 
 		 360 aa  171  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2871  DNA polymerase IV  38.06 
 
 		 359 aa  171  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  31.98 
 
 		 385 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2236  DNA polymerase IV  35.93 
 
 		 400 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.783166  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1727  DNA polymerase IV  35.93 
 
 		 404 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1508  DNA polymerase IV  35.93 
 
 		 400 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  36.64 
 
 		 419 aa  170  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  35.28 
 
 		 369 aa  170  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3083  DNA polymerase IV  35.93 
 
 		 400 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2675  DNA polymerase IV  35.93 
 
 		 406 aa  170  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1555  DNA-directed DNA polymerase  36.83 
 
 		 422 aa  170  6e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.558973  normal  0.0210398 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1397  DNA polymerase IV  33.78 
 
 		 354 aa  170  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2751  DNA polymerase IV  35.93 
 
 		 404 aa  170  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2619  DNA polymerase IV  35.93 
 
 		 403 aa  170  6e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2052  DNA polymerase IV  39.93 
 
 		 407 aa  169  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217696  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  30.62 
 
 		 356 aa  169  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0614  DNA polymerase IV  34.26 
 
 		 355 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0597  DNA polymerase IV  33.98 
 
 		 355 aa  169  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2166  DNA-directed DNA polymerase  31.08 
 
 		 364 aa  169  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0965  DNA polymerase IV  29.61 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2071  DNA-directed DNA polymerase  36 
 
 		 348 aa  169  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  32.72 
 
 		 371 aa  169  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  30.94 
 
 		 368 aa  168  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0937  DNA-directed DNA polymerase  33.16 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  32.5 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>