More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2776 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2776  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 417 aa  827    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.285612  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2368  DNA-directed DNA polymerase  64.82 
 
 		 445 aa  486  1e-136  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2100  DNA-directed DNA polymerase  60.23 
 
 		 443 aa  456  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0629  DNA-directed DNA polymerase  62.47 
 
 		 542 aa  441  1e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2466  UMUC domain protein DNA-repair protein  60.72 
 
 		 476 aa  423  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.666562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  37.32 
 
 		 354 aa  236  4e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  39.95 
 
 		 360 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2765  DNA polymerase IV  35.34 
 
 		 367 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0642  DNA-directed DNA polymerase  35.07 
 
 		 364 aa  210  4e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0619  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 		 345 aa  206  5e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.146752  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0622  DNA-directed DNA polymerase  37.23 
 
 		 365 aa  205  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1469  DNA-directed DNA polymerase  34.43 
 
 		 368 aa  203  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0560  DNA polymerase IV  34.67 
 
 		 365 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0931  DNA polymerase IV  34.7 
 
 		 353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.643762  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  34.25 
 
 		 393 aa  197  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  33.43 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  34.63 
 
 		 358 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  36.92 
 
 		 380 aa  193  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  36.24 
 
 		 384 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  37.17 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  37.47 
 
 		 381 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  39.67 
 
 		 355 aa  189  5.999999999999999e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  38.12 
 
 		 466 aa  189  8e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  33.15 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0937  DNA-directed DNA polymerase  35.25 
 
 		 436 aa  187  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  36.83 
 
 		 425 aa  187  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  35.13 
 
 		 372 aa  186  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0949  DNA-directed DNA polymerase  35.75 
 
 		 385 aa  186  6e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.868276  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  33.43 
 
 		 359 aa  186  6e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  37.96 
 
 		 378 aa  186  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2166  DNA-directed DNA polymerase  33.24 
 
 		 364 aa  186  7e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  36.26 
 
 		 375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  34.26 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  32.88 
 
 		 367 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  35.49 
 
 		 359 aa  183  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  37.04 
 
 		 352 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  35 
 
 		 373 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  37.19 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3422  DNA polymerase IV  36.39 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  37.19 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  35 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  33.15 
 
 		 364 aa  181  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  33.75 
 
 		 436 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0597  DNA polymerase IV  40.23 
 
 		 355 aa  180  4e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0352  DNA polymerase IV  34.86 
 
 		 351 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.990512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0347  DNA polymerase IV  34.86 
 
 		 351 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0362  DNA polymerase IV  34.86 
 
 		 351 aa  180  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.933253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  37.29 
 
 		 356 aa  180  4.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0614  DNA polymerase IV  40.23 
 
 		 355 aa  179  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  37.5 
 
 		 378 aa  179  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0343  DNA polymerase IV  34.86 
 
 		 351 aa  179  5.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.663031 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  34.82 
 
 		 363 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  35.92 
 
 		 408 aa  179  8e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  37.33 
 
 		 374 aa  179  9e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2649  DNA-directed DNA polymerase  32.57 
 
 		 403 aa  179  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0008  DNA-directed DNA polymerase  33.78 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  34.97 
 
 		 408 aa  179  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3092  DNA polymerase IV  36.07 
 
 		 358 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3990  DNA polymerase IV  35.74 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  37.18 
 
 		 410 aa  178  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  34.26 
 
 		 399 aa  178  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  34.46 
 
 		 359 aa  178  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  33.81 
 
 		 414 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  36.63 
 
 		 410 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  39.45 
 
 		 369 aa  177  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  34.55 
 
 		 431 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3530  DNA polymerase IV  36.77 
 
 		 421 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0354  DNA polymerase IV  34.59 
 
 		 351 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360383 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0383  ImpB/MucB/SamB family protein  33.06 
 
 		 357 aa  177  3e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00108419  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  35.95 
 
 		 359 aa  176  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3604  DNA polymerase IV  34.95 
 
 		 364 aa  176  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  37.22 
 
 		 386 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  34.43 
 
 		 369 aa  176  6e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2410  DNA polymerase IV  34.26 
 
 		 429 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.18017 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0927  DNA polymerase IV  35.88 
 
 		 352 aa  176  6e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  35.33 
 
 		 376 aa  176  7e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0962  DNA polymerase IV  38.15 
 
 		 353 aa  176  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  31.71 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0274  DNA-directed DNA polymerase  34.13 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  35.93 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  34.08 
 
 		 449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6682  DNA polymerase IV  38.6 
 
 		 435 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  30.97 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  34.65 
 
 		 417 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  32.01 
 
 		 360 aa  175  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1195  DNA polymerase IV  35.59 
 
 		 353 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2071  DNA-directed DNA polymerase  40.23 
 
 		 348 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  35.77 
 
 		 360 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7420  DNA polymerase IV  36.31 
 
 		 429 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.108606  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4012  DNA polymerase IV  36.82 
 
 		 354 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333158  normal  0.93726 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2871  DNA polymerase IV  36.07 
 
 		 359 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  35.91 
 
 		 430 aa  174  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1203  DNA polymerase IV  36.82 
 
 		 354 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2067  DNA-directed DNA polymerase  35.03 
 
 		 388 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  36.16 
 
 		 356 aa  173  6.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1397  DNA polymerase IV  35.11 
 
 		 354 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3376  DNA-directed DNA polymerase  33.78 
 
 		 351 aa  172  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  36.24 
 
 		 424 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3041  DNA polymerase IV  33.33 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.678009  normal  0.273789 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  31.52 
 
 		 356 aa  172  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>