More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3975 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3975  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 561 aa  1142    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.761967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2271  lysyl-tRNA synthetase  50.09 
 
 		 491 aa  511  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0757  lysyl-tRNA synthetase  49.64 
 
 		 492 aa  508  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0478688  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3424  lysyl-tRNA synthetase  48.18 
 
 		 492 aa  508  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0836  lysyl-tRNA synthetase  48 
 
 		 492 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000359337  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2234  lysyl-tRNA synthetase  48.12 
 
 		 504 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2360  lysyl-tRNA synthetase, class-2  49.18 
 
 		 491 aa  503  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0659  lysyl-tRNA synthetase  46.5 
 
 		 497 aa  499  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000863751  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1248  lysyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 494 aa  499  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.88178e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00750  Lysyl-tRNA synthetase  47.01 
 
 		 491 aa  501  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253681  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3014  lysyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 		 503 aa  499  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.270584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3240  lysyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 494 aa  499  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000008657  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0422  lysyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 511 aa  496  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1365  lysyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 532 aa  496  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.040149  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1032  lysyl-tRNA synthetase  47.67 
 
 		 501 aa  497  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.565305  normal  0.238368 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0888  lysyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 501 aa  495  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00071  lysyl-tRNA synthetase  50.18 
 
 		 505 aa  498  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.381624  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0301  lysyl-tRNA synthetase  48.47 
 
 		 496 aa  491  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0457  lysyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 506 aa  489  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1462  lysyl-tRNA synthetase  47.58 
 
 		 499 aa  491  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.485699  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1827  lysyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 		 503 aa  488  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0398  lysyl-tRNA synthetase  48.62 
 
 		 506 aa  489  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.575675  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1647  lysyl-tRNA synthetase  47.52 
 
 		 489 aa  490  1e-137  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0620  lysyl-tRNA synthetase  47.45 
 
 		 503 aa  487  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0156  lysyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 		 495 aa  484  1e-135  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.033113  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0078  lysyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 494 aa  482  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.312229  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2993  lysyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 501 aa  482  1e-135  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3422  lysyl-tRNA synthetase  46.85 
 
 		 505 aa  482  1e-135  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.231607  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0251  lysyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 499 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000260184  normal  0.314985 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0163  lysyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 		 488 aa  482  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000142799  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3308  lysyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 505 aa  484  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3296  lysyl-tRNA synthetase  46.45 
 
 		 505 aa  482  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02722  lysine tRNA synthetase, constitutive  46.42 
 
 		 505 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.639926  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0802  lysyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 505 aa  481  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000973431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0819  lysyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 505 aa  481  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4180  lysyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 505 aa  481  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0075  lysyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 494 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3049  lysyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 505 aa  481  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4684  lysyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 505 aa  479  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3370  lysyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 		 505 aa  481  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.234173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0152  lysyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 489 aa  479  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000016249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1561  lysyl-tRNA synthetase  46.73 
 
 		 513 aa  479  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3898  lysyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 505 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3216  lysyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 505 aa  481  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1804  lysyl-tRNA synthetase  47.64 
 
 		 499 aa  479  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0116  lysyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 493 aa  479  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0354257  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3309  lysyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 505 aa  481  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.97294  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0019  lysyl-tRNA synthetase  45.63 
 
 		 494 aa  479  1e-134  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00231338  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3023  lysyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 505 aa  480  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02685  hypothetical protein  46.42 
 
 		 505 aa  481  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.803561  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04000  lysine tRNA synthetase, inducible  46.48 
 
 		 505 aa  478  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3862  lysyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 505 aa  478  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03962  hypothetical protein  46.48 
 
 		 505 aa  478  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3376  lysyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 505 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5645  lysyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 505 aa  478  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1206  lysyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 		 513 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1137  lysyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 		 513 aa  475  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1152  lysyl-tRNA synthetase  46.97 
 
 		 508 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.562013  normal  0.115463 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0485  lysyl-tRNA synthetase  46.79 
 
 		 514 aa  476  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.481097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0539  lysyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 515 aa  477  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00455686  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0726  lysyl-tRNA synthetase  47.26 
 
 		 504 aa  477  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000447446  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1472  lysyl-tRNA synthetase  46.42 
 
 		 514 aa  475  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1078  lysyl-tRNA synthetase  50.55 
 
 		 513 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2571  lysyl-tRNA synthetase  46.18 
 
 		 518 aa  478  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158431  normal  0.0253603 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0810  lysyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 499 aa  477  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000714975  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3208  lysyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 505 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.563866 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4598  lysyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 505 aa  478  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.221304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3274  lysyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 505 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4370  lysyl-tRNA synthetase  46.48 
 
 		 505 aa  478  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.119358  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1349  lysyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 503 aa  478  1e-133  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000670094  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0553  lysyl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 515 aa  477  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3271  lysyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 505 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3196  lysyl-tRNA synthetase  46.06 
 
 		 505 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.442927  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0865  lysyl-tRNA synthetase  45.36 
 
 		 505 aa  474  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0958  lysyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 514 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0760523 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0983  lysyl-tRNA synthetase  47.25 
 
 		 496 aa  474  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19490  lysyl-tRNA synthetase (class II)  47.46 
 
 		 499 aa  473  1e-132  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00347128  unclonable  0.00000000087404 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5424  lysyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 524 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5959  lysyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 508 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0225  lysyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 503 aa  474  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16530  lysyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 		 501 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.530256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2136  lysyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 508 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251549 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2118  lysyl-tRNA synthetase  45.86 
 
 		 508 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414372  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3742  lysyl-tRNA synthetase  48.36 
 
 		 496 aa  474  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.464722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2028  lysyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 		 508 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39390  lysyl-tRNA synthetase  47.5 
 
 		 500 aa  471  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1070  lysyl-tRNA synthetase  44.64 
 
 		 516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3384  lysyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 		 502 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0131  lysyl-tRNA synthetase  47.08 
 
 		 490 aa  472  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000275305  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1883  lysyl-tRNA synthetase  46.35 
 
 		 508 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1438  lysyl-tRNA synthetase  46.21 
 
 		 501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1450  lysyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 		 512 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.499845 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2155  lysyl-tRNA synthetase  45.87 
 
 		 508 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.351617  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0893  lysyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246749  normal  0.0933962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1496  lysyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 500 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1311  lysyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 500 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4121  lysyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 500 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1217  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  45.42 
 
 		 502 aa  465  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00362482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3851  lysyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 505 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0982146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1286  lysyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 508 aa  465  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.342382  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>