111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1201 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1201  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  460  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.378726  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0062  hypothetical protein  49.77 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0046  putative phytochrome sensor protein  39.81 
 
 
228 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0860  hypothetical protein  34.76 
 
 
234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0317  hypothetical protein  34.68 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3475  protein of unknown function DUF484  35.78 
 
 
224 aa  122  7e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0496  hypothetical protein  35.32 
 
 
249 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6022  hypothetical protein  35.19 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0735  hypothetical protein  35.91 
 
 
223 aa  120  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0824  hypothetical protein  35.91 
 
 
223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.124637  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69700  hypothetical protein  34.76 
 
 
233 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.536796  normal  0.526464 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0265  hypothetical protein  35.56 
 
 
232 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0236  hypothetical protein  33.78 
 
 
227 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0115318  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47720  hypothetical protein  36.2 
 
 
231 aa  116  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526088  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04123  hypothetical protein  33.8 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0184  hypothetical protein  32.62 
 
 
244 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0243  hypothetical protein  33.48 
 
 
236 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.181438  normal  0.791089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5229  hypothetical protein  33.03 
 
 
236 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5138  hypothetical protein  33.03 
 
 
236 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.850397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5290  hypothetical protein  33.03 
 
 
236 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3836  protein of unknown function DUF484  31.92 
 
 
218 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130921  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0118  putative phytochrome sensor protein  34.62 
 
 
245 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0223  hypothetical protein  31.62 
 
 
244 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.282298  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0056  hypothetical protein  34.78 
 
 
223 aa  102  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5500  hypothetical protein  32.38 
 
 
241 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0193  hypothetical protein  29.68 
 
 
223 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2543  hypothetical protein  30.14 
 
 
232 aa  93.6  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181155  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3687  hypothetical protein  31.74 
 
 
230 aa  92.8  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.949397  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2997  protein of unknown function DUF484  31.74 
 
 
230 aa  92.8  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0081  hypothetical protein  32.17 
 
 
241 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0130  hypothetical protein  34.06 
 
 
226 aa  89.7  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0920825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1059  hypothetical protein  30.53 
 
 
231 aa  89  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.436704  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0171  hypothetical protein  31.54 
 
 
250 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3259  hypothetical protein  32.23 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2921  hypothetical protein  32.23 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2168  hypothetical protein  32.23 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.23247  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0196  hypothetical protein  32.23 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0208  hypothetical protein  32.23 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3427  hypothetical protein  32.23 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0393  hypothetical protein  32.23 
 
 
551 aa  86.7  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3373  protein of unknown function DUF484  30.34 
 
 
229 aa  85.9  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0406  hypothetical protein  27.52 
 
 
223 aa  85.5  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3244  hypothetical protein  31.78 
 
 
225 aa  85.5  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.561328  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4075  hypothetical protein  26.91 
 
 
232 aa  85.5  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1454  hypothetical protein  31.72 
 
 
237 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3696  protein of unknown function DUF484  29.91 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0197  hypothetical protein  28.7 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000607225 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2365  protein of unknown function DUF484  32.29 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108305  hitchhiker  0.000000169554 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2745  hypothetical protein  32.29 
 
 
227 aa  83.2  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63273  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0053  hypothetical protein  30.51 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.183417  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3434  hypothetical protein  31.58 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3443  hypothetical protein  29.69 
 
 
228 aa  79  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0446  hypothetical protein  25.76 
 
 
246 aa  79  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0800  hypothetical protein  31 
 
 
233 aa  78.2  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2527  hypothetical protein  30.32 
 
 
223 aa  78.2  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.448456  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3586  hypothetical protein  27.48 
 
 
221 aa  77.8  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060512  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0900  protein of unknown function DUF484  29.36 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0348  protein of unknown function DUF484  27.71 
 
 
240 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.682729 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0392  hypothetical protein  26.24 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4374  hypothetical protein  27.31 
 
 
240 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0075  hypothetical protein  28.86 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3248  hypothetical protein  27.66 
 
 
211 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4554  hypothetical protein  30.77 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1321  hypothetical protein  31.36 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51626  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0078  hypothetical protein  25.64 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0393  hypothetical protein  26.36 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3632  hypothetical protein  26.36 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0392  hypothetical protein  26.36 
 
 
211 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.401343 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3114  hypothetical protein  28.94 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.702474  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2017  hypothetical protein  27.31 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6436  hypothetical protein  26.91 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.787904 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3581  hypothetical protein  25.45 
 
 
211 aa  67  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.239769  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3994  hypothetical protein  25.91 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.865142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3972  hypothetical protein  25.91 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4088  hypothetical protein  25.91 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3895  protein of unknown function DUF484  25.91 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207888 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00204  uncharacterized conserved protein, YigA-like protein  26.79 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3103  hypothetical protein  27.02 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.648418 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2472  hypothetical protein  27.02 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3086  hypothetical protein  27.02 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4307  hypothetical protein  26.36 
 
 
206 aa  63.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1734  protein of unknown function DUF484  26.2 
 
 
224 aa  63.5  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0324  hypothetical protein  25.73 
 
 
208 aa  62.8  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0379  hypothetical protein  26.07 
 
 
210 aa  62.4  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0488  hypothetical protein  24.17 
 
 
212 aa  58.9  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0367589  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2478  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.57 
 
 
379 aa  58.5  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2239  diguanylate cyclase  31.91 
 
 
387 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2392  hypothetical protein  26.73 
 
 
232 aa  56.2  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4228  hypothetical protein  25.21 
 
 
235 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214924  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0206  hypothetical protein  27.75 
 
 
234 aa  55.5  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.464879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4128  hypothetical protein  24.53 
 
 
212 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.561037 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0542  hypothetical protein  27.75 
 
 
234 aa  55.5  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4010  hypothetical protein  27.75 
 
 
234 aa  55.5  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4158  hypothetical protein  25.21 
 
 
235 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4176  hypothetical protein  25.21 
 
 
235 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4276  hypothetical protein  24.79 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4335  hypothetical protein  24.79 
 
 
235 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002112  hypothetical protein  23.95 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3081  hypothetical protein  32.69 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115623 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00308  3'-5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase  22.36 
 
 
243 aa  52.4  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>