116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4128 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4128  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  431  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.561037 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0488  hypothetical protein  87.26 
 
 		 212 aa  366  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0367589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0324  hypothetical protein  83.9 
 
 		 208 aa  333  7.999999999999999e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0379  hypothetical protein  80.66 
 
 		 210 aa  332  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3248  hypothetical protein  72.17 
 
 		 211 aa  319  1.9999999999999998e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0446  hypothetical protein  72.55 
 
 		 246 aa  318  3e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0392  hypothetical protein  69.95 
 
 		 206 aa  296  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3994  hypothetical protein  67.45 
 
 		 209 aa  295  5e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.865142  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3581  hypothetical protein  66.51 
 
 		 211 aa  294  5e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.239769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3972  hypothetical protein  67.45 
 
 		 209 aa  295  5e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4088  hypothetical protein  67.45 
 
 		 209 aa  295  5e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3895  protein of unknown function DUF484  69.27 
 
 		 204 aa  294  8e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207888 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0393  hypothetical protein  63.21 
 
 		 211 aa  286  1e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3632  hypothetical protein  63.21 
 
 		 211 aa  287  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0392  hypothetical protein  63.21 
 
 		 211 aa  287  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.401343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4307  hypothetical protein  63.9 
 
 		 206 aa  281  5.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4075  hypothetical protein  39.9 
 
 		 232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0078  hypothetical protein  36.61 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00204  uncharacterized conserved protein, YigA-like protein  37.81 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0236  hypothetical protein  32.86 
 
 		 227 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0115318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0127  hypothetical protein  31.58 
 
 		 233 aa  102  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2392  hypothetical protein  33.01 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0184  hypothetical protein  32.2 
 
 		 244 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002112  hypothetical protein  33.98 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0223  hypothetical protein  31.71 
 
 		 244 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.282298  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47720  hypothetical protein  31.94 
 
 		 231 aa  91.7  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526088  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00308  3'-5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase  33.01 
 
 		 243 aa  91.3  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0243  hypothetical protein  29.82 
 
 		 236 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.181438  normal  0.791089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0265  hypothetical protein  31.42 
 
 		 232 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5229  hypothetical protein  29.26 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5138  hypothetical protein  29.26 
 
 		 236 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.850397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5290  hypothetical protein  28.82 
 
 		 236 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0183  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  85.5  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.82752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5500  hypothetical protein  29.7 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0206  hypothetical protein  34.22 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.464879  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0542  hypothetical protein  34.22 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4010  hypothetical protein  34.22 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69700  hypothetical protein  29.67 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.536796  normal  0.526464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6022  hypothetical protein  29.19 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4165  hypothetical protein  29.96 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0650171  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3974  hypothetical protein  30.7 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.469497  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0046  putative phytochrome sensor protein  28.96 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0317  hypothetical protein  27.04 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0860  hypothetical protein  30.88 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0233  hypothetical protein  32.89 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.832062  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3114  hypothetical protein  29.61 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.702474  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0496  hypothetical protein  25.47 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0184  hypothetical protein  29.52 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4554  hypothetical protein  37.72 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0193  hypothetical protein  27.49 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4228  hypothetical protein  29.36 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4276  hypothetical protein  29.36 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4158  hypothetical protein  29.36 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4176  hypothetical protein  29.36 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4335  hypothetical protein  29.36 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04123  hypothetical protein  26.15 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2997  protein of unknown function DUF484  29.27 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3687  hypothetical protein  29.27 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.949397  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0062  hypothetical protein  27.32 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3982  hypothetical protein  28.96 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.482275  normal  0.262457 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0824  hypothetical protein  26.39 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.124637  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0118  putative phytochrome sensor protein  26.63 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1454  hypothetical protein  29.68 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0197  hypothetical protein  26.79 
 
 		 229 aa  62  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000607225 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0735  hypothetical protein  25.93 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5249  hypothetical protein  29.36 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03686  hypothetical protein  29.36 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.233581  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4169  protein of unknown function DUF484  29.36 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03635  hypothetical protein  29.36 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.259129  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3836  protein of unknown function DUF484  31.78 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130921  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4035  hypothetical protein  29.36 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4329  hypothetical protein  29.36 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4197  hypothetical protein  29.36 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0817858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4176  hypothetical protein  29.36 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0299074 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4270  hypothetical protein  29.36 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0075  hypothetical protein  27 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2527  hypothetical protein  29.81 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.448456  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2017  hypothetical protein  30.36 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0900  protein of unknown function DUF484  26.48 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3696  protein of unknown function DUF484  26.91 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3475  protein of unknown function DUF484  24.37 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1201  hypothetical protein  24.79 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.378726  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0081  hypothetical protein  27.35 
 
 		 241 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3373  protein of unknown function DUF484  26.46 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2543  hypothetical protein  26.24 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181155  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1734  protein of unknown function DUF484  24.64 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0348  protein of unknown function DUF484  31.78 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682729 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1059  hypothetical protein  25.56 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.436704  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4374  hypothetical protein  29.25 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3132  hypothetical protein  29.91 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595026  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0800  hypothetical protein  28.31 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3103  hypothetical protein  28.97 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.648418 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2995  hypothetical protein  29.91 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0364868 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3081  hypothetical protein  29.91 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115623 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0171  hypothetical protein  30.84 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3443  hypothetical protein  26.67 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2472  hypothetical protein  28.97 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3086  hypothetical protein  28.97 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0393  hypothetical protein  32 
 
 		 551 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0208  hypothetical protein  30.84 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>