85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2392 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2392  hypothetical protein  100 
 
 		 232 aa  473  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002112  hypothetical protein  64.81 
 
 		 243 aa  300  2e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00308  3'-5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase  64.38 
 
 		 243 aa  299  3e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0127  hypothetical protein  49.1 
 
 		 233 aa  210  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4075  hypothetical protein  36.62 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0392  hypothetical protein  36.06 
 
 		 206 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3632  hypothetical protein  33.5 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0392  hypothetical protein  33.5 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.401343 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0393  hypothetical protein  33.5 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3581  hypothetical protein  33.01 
 
 		 211 aa  108  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.239769  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0184  hypothetical protein  36.89 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3994  hypothetical protein  35.1 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.865142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3895  protein of unknown function DUF484  35.1 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3972  hypothetical protein  35.1 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4088  hypothetical protein  35.1 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4307  hypothetical protein  32.04 
 
 		 206 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00204  uncharacterized conserved protein, YigA-like protein  30.41 
 
 		 231 aa  102  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3248  hypothetical protein  35.1 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0078  hypothetical protein  32.86 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0379  hypothetical protein  33.51 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0446  hypothetical protein  34.31 
 
 		 246 aa  99  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0183  hypothetical protein  33.48 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.82752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0265  hypothetical protein  31.82 
 
 		 232 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0233  hypothetical protein  34.22 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.832062  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4165  hypothetical protein  32.73 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0650171  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0206  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.464879  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4010  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0542  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3974  hypothetical protein  32.73 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.469497  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0184  hypothetical protein  31.31 
 
 		 244 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0496  hypothetical protein  31.19 
 
 		 249 aa  91.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4128  hypothetical protein  33.01 
 
 		 212 aa  91.3  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.561037 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69700  hypothetical protein  32.57 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.536796  normal  0.526464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6022  hypothetical protein  32.57 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0488  hypothetical protein  31.55 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0367589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0324  hypothetical protein  32.52 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0223  hypothetical protein  30.84 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.282298  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0243  hypothetical protein  31.75 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.181438  normal  0.791089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5229  hypothetical protein  31.28 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5138  hypothetical protein  31.28 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.850397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5290  hypothetical protein  31.28 
 
 		 236 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0236  hypothetical protein  31.48 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0115318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4228  hypothetical protein  32.26 
 
 		 235 aa  85.5  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47720  hypothetical protein  31.08 
 
 		 231 aa  85.1  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526088  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4176  hypothetical protein  31.16 
 
 		 235 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4158  hypothetical protein  31.16 
 
 		 235 aa  85.1  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4335  hypothetical protein  31.16 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4276  hypothetical protein  31.16 
 
 		 235 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3982  hypothetical protein  29.95 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.482275  normal  0.262457 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0118  putative phytochrome sensor protein  32.55 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5500  hypothetical protein  29.65 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0046  putative phytochrome sensor protein  29.41 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5249  hypothetical protein  30.04 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4329  hypothetical protein  29.6 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03686  hypothetical protein  29.6 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.233581  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4169  protein of unknown function DUF484  29.6 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03635  hypothetical protein  29.6 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.259129  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4270  hypothetical protein  29.6 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4035  hypothetical protein  29.6 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4197  hypothetical protein  29.6 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0817858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4176  hypothetical protein  29.6 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0299074 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0197  hypothetical protein  29.73 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000607225 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3475  protein of unknown function DUF484  29.33 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04123  hypothetical protein  31.19 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3114  hypothetical protein  28.14 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.702474  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0193  hypothetical protein  27.01 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0317  hypothetical protein  25.7 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3836  protein of unknown function DUF484  28.02 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130921  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0860  hypothetical protein  24.64 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2527  hypothetical protein  25.35 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.448456  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1201  hypothetical protein  26.73 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.378726  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0406  hypothetical protein  25.46 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0062  hypothetical protein  28.71 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0824  hypothetical protein  28.12 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.124637  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0735  hypothetical protein  27.85 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3586  hypothetical protein  26.89 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1321  hypothetical protein  26.53 
 
 		 240 aa  48.5  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51626  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1454  hypothetical protein  24.89 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1059  hypothetical protein  25.23 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.436704  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3434  hypothetical protein  24.88 
 
 		 237 aa  45.8  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3373  protein of unknown function DUF484  27.15 
 
 		 229 aa  45.1  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0056  hypothetical protein  33.33 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3696  protein of unknown function DUF484  32.04 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0081  hypothetical protein  25.81 
 
 		 241 aa  42.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0900  protein of unknown function DUF484  25.35 
 
 		 232 aa  42  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>