116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0324 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0324  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  424  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4128  hypothetical protein  83.9 
 
 		 212 aa  334  5e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.561037 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0379  hypothetical protein  80.68 
 
 		 210 aa  333  9e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0488  hypothetical protein  82.04 
 
 		 212 aa  330  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0367589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3248  hypothetical protein  72.68 
 
 		 211 aa  321  5e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0446  hypothetical protein  71.64 
 
 		 246 aa  315  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0392  hypothetical protein  69.35 
 
 		 206 aa  292  3e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3581  hypothetical protein  66.83 
 
 		 211 aa  288  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.239769  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3632  hypothetical protein  66.34 
 
 		 211 aa  286  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0392  hypothetical protein  66.34 
 
 		 211 aa  286  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.401343 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0393  hypothetical protein  66.34 
 
 		 211 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3895  protein of unknown function DUF484  66.34 
 
 		 204 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207888 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4307  hypothetical protein  65.37 
 
 		 206 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3994  hypothetical protein  66.34 
 
 		 209 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.865142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3972  hypothetical protein  66.34 
 
 		 209 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4088  hypothetical protein  66.34 
 
 		 209 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4075  hypothetical protein  39.5 
 
 		 232 aa  136  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0078  hypothetical protein  37.38 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00204  uncharacterized conserved protein, YigA-like protein  38.31 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0236  hypothetical protein  32.86 
 
 		 227 aa  108  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0115318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0127  hypothetical protein  32.06 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0184  hypothetical protein  32.2 
 
 		 244 aa  101  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0223  hypothetical protein  31.71 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.282298  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2392  hypothetical protein  32.52 
 
 		 232 aa  96.3  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47720  hypothetical protein  31.53 
 
 		 231 aa  94.7  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526088  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5500  hypothetical protein  30.69 
 
 		 241 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0243  hypothetical protein  30.37 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.181438  normal  0.791089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5290  hypothetical protein  30.59 
 
 		 236 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0265  hypothetical protein  29.77 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5138  hypothetical protein  30.77 
 
 		 236 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.850397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5229  hypothetical protein  30.14 
 
 		 236 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6022  hypothetical protein  30.22 
 
 		 233 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69700  hypothetical protein  29.78 
 
 		 233 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.536796  normal  0.526464 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0183  hypothetical protein  33.04 
 
 		 234 aa  85.5  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.82752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002112  hypothetical protein  33.49 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00308  3'-5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase  32.54 
 
 		 243 aa  81.3  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4165  hypothetical protein  31.25 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0650171  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0206  hypothetical protein  33.48 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.464879  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0542  hypothetical protein  33.48 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4010  hypothetical protein  33.48 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3974  hypothetical protein  30.8 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.469497  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0496  hypothetical protein  26.91 
 
 		 249 aa  78.2  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0317  hypothetical protein  29.41 
 
 		 244 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0735  hypothetical protein  27.59 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0193  hypothetical protein  28.3 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0046  putative phytochrome sensor protein  29.11 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0824  hypothetical protein  27.59 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.124637  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0860  hypothetical protein  29.9 
 
 		 234 aa  71.2  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0233  hypothetical protein  31.6 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.832062  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1454  hypothetical protein  26.75 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3475  protein of unknown function DUF484  25.51 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4228  hypothetical protein  28.44 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4276  hypothetical protein  28.44 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4158  hypothetical protein  28.44 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4176  hypothetical protein  28.44 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4335  hypothetical protein  28.44 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1201  hypothetical protein  25.88 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.378726  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3114  hypothetical protein  28.31 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.702474  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3836  protein of unknown function DUF484  27.59 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130921  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04123  hypothetical protein  24.14 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0184  hypothetical protein  29.25 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0197  hypothetical protein  28.64 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000607225 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0062  hypothetical protein  27.32 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2017  hypothetical protein  33.04 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1734  protein of unknown function DUF484  25.24 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0118  putative phytochrome sensor protein  26.63 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3982  hypothetical protein  27.6 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.482275  normal  0.262457 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4554  hypothetical protein  36.28 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0130  hypothetical protein  28.57 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0920825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0075  hypothetical protein  32.77 
 
 		 239 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1059  hypothetical protein  27.68 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.436704  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3443  hypothetical protein  35.88 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4374  hypothetical protein  29.38 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0800  hypothetical protein  28 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5249  hypothetical protein  35.16 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03686  hypothetical protein  35.16 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.233581  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4169  protein of unknown function DUF484  35.16 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03635  hypothetical protein  35.16 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.259129  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4035  hypothetical protein  35.16 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4329  hypothetical protein  35.16 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4197  hypothetical protein  35.16 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0817858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4176  hypothetical protein  35.16 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0299074 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4270  hypothetical protein  35.16 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0348  protein of unknown function DUF484  28.75 
 
 		 240 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682729 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0406  hypothetical protein  27.49 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3586  hypothetical protein  26.83 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2543  hypothetical protein  26.6 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181155  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3081  hypothetical protein  30.43 
 
 		 242 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115623 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2527  hypothetical protein  28.23 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.448456  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6436  hypothetical protein  29.66 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.787904 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3103  hypothetical protein  29.57 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.648418 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0171  hypothetical protein  27.51 
 
 		 250 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3259  hypothetical protein  26.52 
 
 		 245 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0900  protein of unknown function DUF484  28.31 
 
 		 232 aa  52  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2472  hypothetical protein  29.57 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3086  hypothetical protein  29.57 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2921  hypothetical protein  26.52 
 
 		 245 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2168  hypothetical protein  26.52 
 
 		 245 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.23247  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0196  hypothetical protein  26.52 
 
 		 245 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0208  hypothetical protein  26.52 
 
 		 245 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>