97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3974 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3974  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  474  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.469497  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4165  hypothetical protein  97.44 
 
 		 234 aa  454  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0650171  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0184  hypothetical protein  74.36 
 
 		 233 aa  345  2e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4010  hypothetical protein  73.93 
 
 		 234 aa  342  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0206  hypothetical protein  73.93 
 
 		 234 aa  342  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.464879  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0542  hypothetical protein  73.93 
 
 		 234 aa  342  2.9999999999999997e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0183  hypothetical protein  73.08 
 
 		 234 aa  341  5e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.82752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3982  hypothetical protein  66.96 
 
 		 235 aa  323  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.482275  normal  0.262457 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0233  hypothetical protein  70.51 
 
 		 233 aa  318  3e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.832062  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4335  hypothetical protein  67.73 
 
 		 235 aa  317  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4276  hypothetical protein  67.73 
 
 		 235 aa  317  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4176  hypothetical protein  67.73 
 
 		 235 aa  317  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4158  hypothetical protein  67.73 
 
 		 235 aa  317  9e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4228  hypothetical protein  67.27 
 
 		 235 aa  315  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5249  hypothetical protein  63.91 
 
 		 235 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4329  hypothetical protein  63.91 
 
 		 235 aa  305  3e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4035  hypothetical protein  63.91 
 
 		 235 aa  305  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03686  hypothetical protein  63.91 
 
 		 235 aa  305  3e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.233581  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4197  hypothetical protein  63.91 
 
 		 235 aa  305  3e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0817858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4176  hypothetical protein  63.91 
 
 		 235 aa  305  3e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0299074 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4270  hypothetical protein  63.91 
 
 		 235 aa  305  3e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4169  protein of unknown function DUF484  63.91 
 
 		 235 aa  305  3e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03635  hypothetical protein  63.91 
 
 		 235 aa  305  3e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.259129  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0127  hypothetical protein  28.7 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2392  hypothetical protein  32.73 
 
 		 232 aa  95.9  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0078  hypothetical protein  31.65 
 
 		 230 aa  95.9  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0236  hypothetical protein  24.56 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0115318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3248  hypothetical protein  32.59 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00308  3'-5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase  32.89 
 
 		 243 aa  85.5  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002112  hypothetical protein  31.92 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0184  hypothetical protein  31.86 
 
 		 244 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4075  hypothetical protein  27.73 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0392  hypothetical protein  30.8 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0446  hypothetical protein  31.51 
 
 		 246 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00204  uncharacterized conserved protein, YigA-like protein  31.22 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3895  protein of unknown function DUF484  33.64 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4088  hypothetical protein  33.64 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3994  hypothetical protein  33.64 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.865142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3972  hypothetical protein  33.64 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0223  hypothetical protein  30.97 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.282298  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0046  putative phytochrome sensor protein  31.28 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0392  hypothetical protein  30.59 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.401343 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3632  hypothetical protein  30.59 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0393  hypothetical protein  30.59 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4307  hypothetical protein  30.49 
 
 		 206 aa  72  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5500  hypothetical protein  30.14 
 
 		 241 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4128  hypothetical protein  30.95 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.561037 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0379  hypothetical protein  31.47 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3581  hypothetical protein  31.56 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.239769  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0324  hypothetical protein  31.07 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0118  putative phytochrome sensor protein  28.96 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0265  hypothetical protein  27.16 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47720  hypothetical protein  30.63 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526088  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5290  hypothetical protein  29.65 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5138  hypothetical protein  29.2 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.850397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5229  hypothetical protein  29.2 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0243  hypothetical protein  29.39 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.181438  normal  0.791089 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0488  hypothetical protein  28.92 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0367589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69700  hypothetical protein  27.78 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.536796  normal  0.526464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6022  hypothetical protein  27.78 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0860  hypothetical protein  28.63 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0317  hypothetical protein  25.53 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3586  hypothetical protein  26.84 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0496  hypothetical protein  28.45 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2543  hypothetical protein  25.22 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181155  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3114  hypothetical protein  24.38 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.702474  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1201  hypothetical protein  25.42 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.378726  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0171  hypothetical protein  25.4 
 
 		 250 aa  52  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0193  hypothetical protein  23.11 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0197  hypothetical protein  23.32 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000607225 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3427  hypothetical protein  25.82 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0208  hypothetical protein  25.82 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0196  hypothetical protein  25.82 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3259  hypothetical protein  25.82 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2168  hypothetical protein  25.82 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.23247  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2921  hypothetical protein  25.82 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3687  hypothetical protein  25.88 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.949397  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2997  protein of unknown function DUF484  25.88 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0393  hypothetical protein  25.82 
 
 		 551 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0075  hypothetical protein  23.14 
 
 		 239 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0348  protein of unknown function DUF484  23.83 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682729 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3244  hypothetical protein  24.44 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.561328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4374  hypothetical protein  25.39 
 
 		 240 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3373  protein of unknown function DUF484  25.88 
 
 		 229 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0406  hypothetical protein  25 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3696  protein of unknown function DUF484  26.5 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0062  hypothetical protein  26.18 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0081  hypothetical protein  25 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0800  hypothetical protein  24.79 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2745  hypothetical protein  25.75 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63273  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2365  protein of unknown function DUF484  25.75 
 
 		 227 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108305  hitchhiker  0.000000169554 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0056  hypothetical protein  26.99 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1059  hypothetical protein  23.43 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.436704  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3443  hypothetical protein  24.55 
 
 		 228 aa  43.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3434  hypothetical protein  24.11 
 
 		 237 aa  42.4  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0130  hypothetical protein  25.34 
 
 		 226 aa  42  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0920825 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2527  hypothetical protein  25.22 
 
 		 223 aa  42  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.448456  normal  0.216291 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>