115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3086 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2472  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3086  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3103  hypothetical protein  99.59 
 
 
241 aa  480  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.648418 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2995  hypothetical protein  98.34 
 
 
241 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0364868 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6436  hypothetical protein  97.11 
 
 
242 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.787904 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0171  hypothetical protein  84.23 
 
 
250 aa  408  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3259  hypothetical protein  83.4 
 
 
245 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0393  hypothetical protein  83.4 
 
 
551 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3132  hypothetical protein  97.93 
 
 
249 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595026  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2921  hypothetical protein  83.4 
 
 
245 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2168  hypothetical protein  83.4 
 
 
245 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.23247  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0196  hypothetical protein  83.4 
 
 
245 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0208  hypothetical protein  83.4 
 
 
245 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3427  hypothetical protein  83.4 
 
 
245 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3081  hypothetical protein  91.74 
 
 
242 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115623 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0348  protein of unknown function DUF484  75 
 
 
240 aa  378  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.682729 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4374  hypothetical protein  75.83 
 
 
240 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0075  hypothetical protein  72.92 
 
 
239 aa  359  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3696  protein of unknown function DUF484  53.72 
 
 
229 aa  257  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3373  protein of unknown function DUF484  53.31 
 
 
229 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0053  hypothetical protein  54.29 
 
 
237 aa  250  2e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.183417  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0056  hypothetical protein  50.62 
 
 
223 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0081  hypothetical protein  49.38 
 
 
241 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3443  hypothetical protein  47.9 
 
 
228 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0800  hypothetical protein  47.48 
 
 
233 aa  215  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0900  protein of unknown function DUF484  45.83 
 
 
232 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3687  hypothetical protein  45.61 
 
 
230 aa  210  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.949397  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2997  protein of unknown function DUF484  45.61 
 
 
230 aa  210  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3244  hypothetical protein  42.5 
 
 
225 aa  202  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.561328  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4554  hypothetical protein  44.13 
 
 
243 aa  199  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0130  hypothetical protein  46.25 
 
 
226 aa  198  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0920825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1059  hypothetical protein  42.26 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.436704  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3434  hypothetical protein  42.86 
 
 
237 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1454  hypothetical protein  40 
 
 
237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0193  hypothetical protein  36.97 
 
 
223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3836  protein of unknown function DUF484  36.4 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130921  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0197  hypothetical protein  34.17 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000607225 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2543  hypothetical protein  35.32 
 
 
232 aa  125  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181155  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2527  hypothetical protein  35.98 
 
 
223 aa  122  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.448456  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2017  hypothetical protein  31.76 
 
 
224 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1734  protein of unknown function DUF484  30.9 
 
 
224 aa  96.3  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0317  hypothetical protein  29.44 
 
 
244 aa  85.1  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0236  hypothetical protein  28.51 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0115318  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0223  hypothetical protein  28.57 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.282298  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0184  hypothetical protein  28.28 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47720  hypothetical protein  30.38 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526088  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4075  hypothetical protein  26.86 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69700  hypothetical protein  27.57 
 
 
233 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.536796  normal  0.526464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6022  hypothetical protein  27.57 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0860  hypothetical protein  28.15 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0265  hypothetical protein  27.76 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0496  hypothetical protein  31.56 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0046  putative phytochrome sensor protein  27.8 
 
 
228 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1201  hypothetical protein  27.24 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.378726  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04123  hypothetical protein  30.13 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0243  hypothetical protein  26.75 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.181438  normal  0.791089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5229  hypothetical protein  25.93 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5138  hypothetical protein  25.93 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.850397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5290  hypothetical protein  26.34 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3475  protein of unknown function DUF484  28.4 
 
 
224 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2745  hypothetical protein  31.54 
 
 
227 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63273  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2365  protein of unknown function DUF484  31.54 
 
 
227 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108305  hitchhiker  0.000000169554 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3581  hypothetical protein  27.78 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.239769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5500  hypothetical protein  26.72 
 
 
241 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4307  hypothetical protein  26.5 
 
 
206 aa  58.9  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0735  hypothetical protein  28.45 
 
 
223 aa  58.5  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0392  hypothetical protein  23.43 
 
 
206 aa  58.5  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3895  protein of unknown function DUF484  26.5 
 
 
204 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207888 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3994  hypothetical protein  26.5 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.865142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3972  hypothetical protein  26.5 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4088  hypothetical protein  26.5 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0824  hypothetical protein  27.62 
 
 
223 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.124637  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0118  putative phytochrome sensor protein  22.78 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0078  hypothetical protein  23.75 
 
 
230 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0446  hypothetical protein  24.79 
 
 
246 aa  57.4  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3586  hypothetical protein  26.52 
 
 
221 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060512  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4228  hypothetical protein  25.62 
 
 
235 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214924  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4158  hypothetical protein  25.62 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4176  hypothetical protein  25.62 
 
 
235 aa  57  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0393  hypothetical protein  27.78 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3632  hypothetical protein  26.07 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0392  hypothetical protein  26.07 
 
 
211 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.401343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4276  hypothetical protein  25.62 
 
 
235 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4335  hypothetical protein  25.62 
 
 
235 aa  56.6  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0379  hypothetical protein  29.41 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0233  hypothetical protein  26.83 
 
 
233 aa  55.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.832062  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4128  hypothetical protein  28.97 
 
 
212 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.561037 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00204  uncharacterized conserved protein, YigA-like protein  33.33 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0062  hypothetical protein  25.94 
 
 
232 aa  52.8  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0184  hypothetical protein  25.1 
 
 
233 aa  52.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0324  hypothetical protein  29.57 
 
 
208 aa  51.6  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0488  hypothetical protein  26.89 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0367589  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0127  hypothetical protein  25 
 
 
233 aa  51.6  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0453  hypothetical protein  26.05 
 
 
274 aa  49.7  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0206  hypothetical protein  24.51 
 
 
234 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.464879  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0542  hypothetical protein  24.51 
 
 
234 aa  49.7  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4010  hypothetical protein  24.51 
 
 
234 aa  49.7  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0406  hypothetical protein  23.55 
 
 
223 aa  49.3  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3982  hypothetical protein  24.39 
 
 
235 aa  48.9  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.482275  normal  0.262457 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4169  protein of unknown function DUF484  25.1 
 
 
235 aa  47  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>