99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0406 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0406  hypothetical protein  100 
 
 
223 aa  462  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0193  hypothetical protein  30.7 
 
 
223 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0317  hypothetical protein  31.51 
 
 
244 aa  102  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0860  hypothetical protein  32.56 
 
 
234 aa  99  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0197  hypothetical protein  32.56 
 
 
229 aa  97.8  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000607225 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47720  hypothetical protein  32.57 
 
 
231 aa  91.7  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526088  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0265  hypothetical protein  34.74 
 
 
232 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0118  putative phytochrome sensor protein  28.91 
 
 
245 aa  85.9  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1201  hypothetical protein  27.52 
 
 
236 aa  85.5  5e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.378726  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0496  hypothetical protein  28.5 
 
 
249 aa  85.1  9e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69700  hypothetical protein  33.49 
 
 
233 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.536796  normal  0.526464 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2543  hypothetical protein  26.64 
 
 
232 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181155  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2527  hypothetical protein  29.02 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.448456  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6022  hypothetical protein  33.49 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3836  protein of unknown function DUF484  33.01 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130921  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0046  putative phytochrome sensor protein  30 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2365  protein of unknown function DUF484  31.05 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108305  hitchhiker  0.000000169554 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2745  hypothetical protein  31.05 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63273  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3586  hypothetical protein  29.25 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060512  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0735  hypothetical protein  27.35 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0824  hypothetical protein  26.92 
 
 
223 aa  73.6  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.124637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0223  hypothetical protein  30.14 
 
 
244 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.282298  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0184  hypothetical protein  30.14 
 
 
244 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04123  hypothetical protein  26.22 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3475  protein of unknown function DUF484  24.78 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0236  hypothetical protein  28.63 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0115318  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0056  hypothetical protein  28.51 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0053  hypothetical protein  26.81 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.183417  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0081  hypothetical protein  29.07 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4554  hypothetical protein  25.21 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5138  hypothetical protein  31.02 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.850397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5229  hypothetical protein  30.8 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3696  protein of unknown function DUF484  26.29 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3373  protein of unknown function DUF484  26.29 
 
 
229 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00204  uncharacterized conserved protein, YigA-like protein  28.64 
 
 
231 aa  67  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0800  hypothetical protein  26.67 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5290  hypothetical protein  30.41 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1454  hypothetical protein  26.03 
 
 
237 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3244  hypothetical protein  23.53 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.561328  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4075  hypothetical protein  27.57 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0243  hypothetical protein  30.41 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.181438  normal  0.791089 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3114  hypothetical protein  28.44 
 
 
239 aa  65.5  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.702474  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2997  protein of unknown function DUF484  25.43 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3687  hypothetical protein  25.43 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.949397  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0062  hypothetical protein  26.32 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0127  hypothetical protein  27.45 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0130  hypothetical protein  24.66 
 
 
226 aa  63.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0920825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0900  protein of unknown function DUF484  24.44 
 
 
232 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3443  hypothetical protein  25.11 
 
 
228 aa  60.1  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5500  hypothetical protein  27.75 
 
 
241 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1321  hypothetical protein  28.43 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51626  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1059  hypothetical protein  25.21 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.436704  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0196  hypothetical protein  25.93 
 
 
245 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3427  hypothetical protein  25.93 
 
 
245 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0208  hypothetical protein  25.93 
 
 
245 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2168  hypothetical protein  25.93 
 
 
245 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.23247  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3259  hypothetical protein  25.93 
 
 
245 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2921  hypothetical protein  25.93 
 
 
245 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2392  hypothetical protein  25.46 
 
 
232 aa  55.5  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0392  hypothetical protein  35.19 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0393  hypothetical protein  25.93 
 
 
551 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0379  hypothetical protein  31.82 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0078  hypothetical protein  25.35 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0446  hypothetical protein  25.59 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0171  hypothetical protein  25.31 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1734  protein of unknown function DUF484  23.11 
 
 
224 aa  53.5  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2017  hypothetical protein  21.93 
 
 
224 aa  52.4  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0348  protein of unknown function DUF484  22.82 
 
 
240 aa  52  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.682729 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0075  hypothetical protein  24.03 
 
 
239 aa  52  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0324  hypothetical protein  28.12 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0488  hypothetical protein  27.86 
 
 
212 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0367589  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3103  hypothetical protein  27.59 
 
 
241 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.648418 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3632  hypothetical protein  22.86 
 
 
211 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4010  hypothetical protein  37.08 
 
 
234 aa  48.9  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0392  hypothetical protein  22.86 
 
 
211 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.401343 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0542  hypothetical protein  37.08 
 
 
234 aa  48.9  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0206  hypothetical protein  37.08 
 
 
234 aa  48.9  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.464879  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2472  hypothetical protein  28.32 
 
 
241 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3086  hypothetical protein  28.32 
 
 
241 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3132  hypothetical protein  28.69 
 
 
249 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595026  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00308  3'-5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase  25 
 
 
243 aa  48.5  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3081  hypothetical protein  28.32 
 
 
242 aa  48.5  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115623 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4128  hypothetical protein  29.02 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.561037 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4374  hypothetical protein  23.4 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4307  hypothetical protein  24.06 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0393  hypothetical protein  23.81 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3434  hypothetical protein  22.94 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6436  hypothetical protein  27.73 
 
 
242 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.787904 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3895  protein of unknown function DUF484  29.63 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207888 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2995  hypothetical protein  27.68 
 
 
241 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0364868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3994  hypothetical protein  29.63 
 
 
209 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.865142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3972  hypothetical protein  29.63 
 
 
209 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4088  hypothetical protein  29.63 
 
 
209 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3974  hypothetical protein  25 
 
 
234 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.469497  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3581  hypothetical protein  25.12 
 
 
211 aa  45.1  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.239769  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3248  hypothetical protein  25.12 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002112  hypothetical protein  26.73 
 
 
243 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4165  hypothetical protein  24.07 
 
 
234 aa  42.4  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0650171  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3982  hypothetical protein  27.55 
 
 
235 aa  42.4  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.482275  normal  0.262457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>