89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00308 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00308  3'-5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase  100 
 
 		 243 aa  503  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002112  hypothetical protein  90.12 
 
 		 243 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2392  hypothetical protein  64.38 
 
 		 232 aa  318  5e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0127  hypothetical protein  46.4 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4075  hypothetical protein  35.41 
 
 		 232 aa  121  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0392  hypothetical protein  34.3 
 
 		 206 aa  115  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0392  hypothetical protein  33.01 
 
 		 211 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.401343 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3632  hypothetical protein  33.01 
 
 		 211 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4088  hypothetical protein  34.93 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3895  protein of unknown function DUF484  34.93 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207888 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3972  hypothetical protein  34.93 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3994  hypothetical protein  34.93 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.865142  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0393  hypothetical protein  33.01 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0184  hypothetical protein  34.04 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3581  hypothetical protein  32.54 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.239769  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4307  hypothetical protein  32.04 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3248  hypothetical protein  34.76 
 
 		 211 aa  110  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0446  hypothetical protein  32.67 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0078  hypothetical protein  34.43 
 
 		 230 aa  108  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0379  hypothetical protein  34.57 
 
 		 210 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0542  hypothetical protein  33.96 
 
 		 234 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0206  hypothetical protein  33.96 
 
 		 234 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.464879  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4010  hypothetical protein  33.96 
 
 		 234 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4128  hypothetical protein  32.8 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.561037 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4165  hypothetical protein  32.39 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0650171  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3974  hypothetical protein  32.39 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.469497  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0233  hypothetical protein  33.19 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.832062  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00204  uncharacterized conserved protein, YigA-like protein  29.21 
 
 		 231 aa  100  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0265  hypothetical protein  31.63 
 
 		 232 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0183  hypothetical protein  30.41 
 
 		 234 aa  99.4  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.82752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0496  hypothetical protein  32.29 
 
 		 249 aa  98.6  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0488  hypothetical protein  31.47 
 
 		 212 aa  98.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0367589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4158  hypothetical protein  30.23 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4176  hypothetical protein  30.23 
 
 		 235 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4228  hypothetical protein  30.23 
 
 		 235 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4276  hypothetical protein  30.23 
 
 		 235 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4335  hypothetical protein  30.23 
 
 		 235 aa  95.9  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69700  hypothetical protein  33.49 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.536796  normal  0.526464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6022  hypothetical protein  33.49 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0324  hypothetical protein  32.29 
 
 		 208 aa  92.8  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3982  hypothetical protein  27.44 
 
 		 235 aa  92  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.482275  normal  0.262457 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5138  hypothetical protein  31.6 
 
 		 236 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.850397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0243  hypothetical protein  30.49 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.181438  normal  0.791089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5229  hypothetical protein  31.17 
 
 		 236 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5290  hypothetical protein  31.17 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5249  hypothetical protein  30.09 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0223  hypothetical protein  29.72 
 
 		 244 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.282298  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0184  hypothetical protein  30.52 
 
 		 244 aa  85.9  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4197  hypothetical protein  29.77 
 
 		 235 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0817858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4176  hypothetical protein  29.77 
 
 		 235 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0299074 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03635  hypothetical protein  29.77 
 
 		 235 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.259129  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4270  hypothetical protein  29.77 
 
 		 235 aa  85.5  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4169  protein of unknown function DUF484  29.77 
 
 		 235 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4035  hypothetical protein  29.77 
 
 		 235 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4329  hypothetical protein  29.77 
 
 		 235 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03686  hypothetical protein  29.77 
 
 		 235 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.233581  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0046  putative phytochrome sensor protein  30.73 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47720  hypothetical protein  29.17 
 
 		 231 aa  83.2  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526088  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0236  hypothetical protein  27.57 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0115318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5500  hypothetical protein  28.28 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0118  putative phytochrome sensor protein  28.7 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0317  hypothetical protein  27.19 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0860  hypothetical protein  26.94 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0197  hypothetical protein  26.67 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000607225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04123  hypothetical protein  31.05 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3836  protein of unknown function DUF484  25.85 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130921  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3586  hypothetical protein  27.14 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3114  hypothetical protein  27.43 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.702474  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3475  protein of unknown function DUF484  27.49 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0193  hypothetical protein  27.15 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0406  hypothetical protein  25 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1201  hypothetical protein  22.36 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.378726  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0062  hypothetical protein  25.11 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2527  hypothetical protein  25.85 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.448456  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1321  hypothetical protein  25.65 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51626  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0824  hypothetical protein  26.67 
 
 		 223 aa  52  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.124637  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0735  hypothetical protein  26.67 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2017  hypothetical protein  26.79 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1734  protein of unknown function DUF484  26.46 
 
 		 224 aa  48.9  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2745  hypothetical protein  23.71 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63273  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2365  protein of unknown function DUF484  23.71 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108305  hitchhiker  0.000000169554 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0393  hypothetical protein  29.36 
 
 		 551 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0056  hypothetical protein  32.99 
 
 		 223 aa  42.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0208  hypothetical protein  29.52 
 
 		 245 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3427  hypothetical protein  29.52 
 
 		 245 aa  42  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0196  hypothetical protein  29.52 
 
 		 245 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3259  hypothetical protein  29.52 
 
 		 245 aa  42  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2168  hypothetical protein  29.52 
 
 		 245 aa  42  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.23247  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2921  hypothetical protein  29.52 
 
 		 245 aa  42  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>