92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2365 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2745  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63273  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2365  protein of unknown function DUF484  100 
 
 		 227 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108305  hitchhiker  0.000000169554 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0062  hypothetical protein  33.48 
 
 		 232 aa  89.7  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0317  hypothetical protein  30.09 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6022  hypothetical protein  30.97 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69700  hypothetical protein  30.53 
 
 		 233 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.536796  normal  0.526464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0223  hypothetical protein  32.42 
 
 		 244 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.282298  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0184  hypothetical protein  32.42 
 
 		 244 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1201  hypothetical protein  32.29 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.378726  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0265  hypothetical protein  30.88 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0243  hypothetical protein  31.25 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.181438  normal  0.791089 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0406  hypothetical protein  31.05 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0824  hypothetical protein  30.49 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.124637  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3475  protein of unknown function DUF484  31.22 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0860  hypothetical protein  31.05 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0735  hypothetical protein  30.49 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5290  hypothetical protein  30.67 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5229  hypothetical protein  30.67 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5138  hypothetical protein  30.67 
 
 		 236 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.850397 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2543  hypothetical protein  28.18 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181155  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0193  hypothetical protein  28.44 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0118  putative phytochrome sensor protein  32.11 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5500  hypothetical protein  29.72 
 
 		 241 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0197  hypothetical protein  31.51 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000607225 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47720  hypothetical protein  30.97 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526088  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3836  protein of unknown function DUF484  28.85 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130921  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0800  hypothetical protein  30.63 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0236  hypothetical protein  27.06 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0115318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4374  hypothetical protein  28.75 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4075  hypothetical protein  26.98 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0496  hypothetical protein  27.48 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0171  hypothetical protein  29.17 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04123  hypothetical protein  29.09 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2168  hypothetical protein  29.08 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.23247  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0196  hypothetical protein  29.08 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3244  hypothetical protein  28.7 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.561328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0208  hypothetical protein  29.08 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3427  hypothetical protein  29.08 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2921  hypothetical protein  29.08 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3259  hypothetical protein  29.08 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0348  protein of unknown function DUF484  27.92 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682729 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2017  hypothetical protein  28.82 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0393  hypothetical protein  29.08 
 
 		 551 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1059  hypothetical protein  27.48 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.436704  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1734  protein of unknown function DUF484  28.12 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0046  putative phytochrome sensor protein  28.95 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0075  hypothetical protein  28.45 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0081  hypothetical protein  31.17 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2997  protein of unknown function DUF484  28.7 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3687  hypothetical protein  28.7 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.949397  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3373  protein of unknown function DUF484  31.47 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4554  hypothetical protein  29.57 
 
 		 243 aa  57  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0379  hypothetical protein  33.93 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0056  hypothetical protein  30.64 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6436  hypothetical protein  27.27 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.787904 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0900  protein of unknown function DUF484  30.32 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2527  hypothetical protein  27.52 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.448456  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3443  hypothetical protein  30.67 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3696  protein of unknown function DUF484  30.6 
 
 		 229 aa  52.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0130  hypothetical protein  27.6 
 
 		 226 aa  52  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0920825 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3581  hypothetical protein  31.73 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.239769  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3103  hypothetical protein  28.63 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.648418 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0392  hypothetical protein  25.84 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3586  hypothetical protein  25 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0324  hypothetical protein  32.14 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3114  hypothetical protein  30.67 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.702474  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2472  hypothetical protein  28.63 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3086  hypothetical protein  28.63 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2995  hypothetical protein  29.05 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0364868 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4128  hypothetical protein  28.93 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.561037 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2478  diguanylate cyclase with GAF sensor  26.34 
 
 		 379 aa  49.7  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0053  hypothetical protein  34.82 
 
 		 237 aa  48.9  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3895  protein of unknown function DUF484  28.57 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207888 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4088  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3972  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3994  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.865142  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4307  hypothetical protein  30.48 
 
 		 206 aa  48.9  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3081  hypothetical protein  27.27 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115623 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3132  hypothetical protein  27.73 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595026  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3248  hypothetical protein  25.45 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00204  uncharacterized conserved protein, YigA-like protein  31.68 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1454  hypothetical protein  24.57 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0392  hypothetical protein  30.48 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.401343 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3632  hypothetical protein  30.48 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0393  hypothetical protein  30.48 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0488  hypothetical protein  27.78 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0367589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0446  hypothetical protein  24.02 
 
 		 246 aa  45.4  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6003  diguanylate cyclase  28.81 
 
 		 371 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.753958  normal  0.321238 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0078  hypothetical protein  36.05 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1321  hypothetical protein  29.69 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51626  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2239  diguanylate cyclase  40.51 
 
 		 387 aa  43.5  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3974  hypothetical protein  25.75 
 
 		 234 aa  42.4  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.469497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>