99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0053 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0053  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.183417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3696  protein of unknown function DUF484  88.46 
 
 		 229 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3373  protein of unknown function DUF484  88.03 
 
 		 229 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0056  hypothetical protein  71.37 
 
 		 223 aa  335  3.9999999999999995e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0081  hypothetical protein  70.34 
 
 		 241 aa  331  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0171  hypothetical protein  55.6 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4374  hypothetical protein  52.24 
 
 		 240 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0348  protein of unknown function DUF484  52.26 
 
 		 240 aa  248  8e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682729 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3427  hypothetical protein  52.89 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2921  hypothetical protein  52.89 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.804703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2168  hypothetical protein  52.89 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.23247  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3259  hypothetical protein  52.89 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0196  hypothetical protein  52.89 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0208  hypothetical protein  52.89 
 
 		 245 aa  246  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0393  hypothetical protein  52.89 
 
 		 551 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0075  hypothetical protein  51.65 
 
 		 239 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6436  hypothetical protein  51.22 
 
 		 242 aa  241  7e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.787904 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3103  hypothetical protein  53.94 
 
 		 241 aa  241  9e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.648418 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3086  hypothetical protein  53.53 
 
 		 241 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2472  hypothetical protein  53.53 
 
 		 241 aa  238  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3081  hypothetical protein  53.56 
 
 		 242 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115623 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3132  hypothetical protein  52.08 
 
 		 249 aa  235  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.595026  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2995  hypothetical protein  52.94 
 
 		 241 aa  234  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0364868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3687  hypothetical protein  49.15 
 
 		 230 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.949397  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2997  protein of unknown function DUF484  49.15 
 
 		 230 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0900  protein of unknown function DUF484  47.88 
 
 		 232 aa  214  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0800  hypothetical protein  47.46 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3244  hypothetical protein  46.84 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.561328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1454  hypothetical protein  47.83 
 
 		 237 aa  208  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3443  hypothetical protein  47.6 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1059  hypothetical protein  46.72 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.436704  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0130  hypothetical protein  47.81 
 
 		 226 aa  198  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0920825 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3434  hypothetical protein  46.29 
 
 		 237 aa  198  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4554  hypothetical protein  43.27 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0193  hypothetical protein  39.83 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2543  hypothetical protein  37.66 
 
 		 232 aa  141  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181155  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3836  protein of unknown function DUF484  39.01 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130921  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0197  hypothetical protein  36.84 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000607225 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2527  hypothetical protein  37.82 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.448456  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2017  hypothetical protein  35.53 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1734  protein of unknown function DUF484  33.77 
 
 		 224 aa  113  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0860  hypothetical protein  33.33 
 
 		 234 aa  93.2  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0046  putative phytochrome sensor protein  34.33 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0317  hypothetical protein  31.8 
 
 		 244 aa  89.7  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1201  hypothetical protein  31.65 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.378726  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6022  hypothetical protein  30.21 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69700  hypothetical protein  30.21 
 
 		 233 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.536796  normal  0.526464 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0062  hypothetical protein  33.47 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0118  putative phytochrome sensor protein  29.26 
 
 		 245 aa  80.5  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04123  hypothetical protein  30.21 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0223  hypothetical protein  29.24 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.282298  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0265  hypothetical protein  30.17 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47720  hypothetical protein  30.64 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526088  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0184  hypothetical protein  28.81 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0406  hypothetical protein  26.81 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0243  hypothetical protein  36.75 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.181438  normal  0.791089 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0735  hypothetical protein  28.99 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5229  hypothetical protein  36.75 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0236  hypothetical protein  28.03 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0115318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5138  hypothetical protein  37.39 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.850397 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0824  hypothetical protein  28.99 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.124637  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5290  hypothetical protein  36.75 
 
 		 236 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4075  hypothetical protein  29.54 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3475  protein of unknown function DUF484  27.13 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5500  hypothetical protein  40 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3586  hypothetical protein  27.23 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.060512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0392  hypothetical protein  26.16 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0393  hypothetical protein  28.51 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00204  uncharacterized conserved protein, YigA-like protein  29.66 
 
 		 231 aa  58.5  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3632  hypothetical protein  27.71 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0392  hypothetical protein  27.71 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.401343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4307  hypothetical protein  28.95 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3581  hypothetical protein  27.47 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.239769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3895  protein of unknown function DUF484  25.88 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207888 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3994  hypothetical protein  25.88 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.865142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3972  hypothetical protein  25.88 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4088  hypothetical protein  25.88 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0432871 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4128  hypothetical protein  29.66 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.561037 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0496  hypothetical protein  25.33 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4010  hypothetical protein  27.04 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3114  hypothetical protein  30.97 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.702474  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0446  hypothetical protein  24.45 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0206  hypothetical protein  27.04 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.464879  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0542  hypothetical protein  27.04 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0379  hypothetical protein  32.71 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0488  hypothetical protein  27.59 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0367589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2365  protein of unknown function DUF484  28.86 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108305  hitchhiker  0.000000169554 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2745  hypothetical protein  28.86 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63273  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0233  hypothetical protein  25.6 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.832062  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0184  hypothetical protein  24.69 
 
 		 233 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.165838  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0127  hypothetical protein  25.68 
 
 		 233 aa  47.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0324  hypothetical protein  31.78 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3982  hypothetical protein  25.93 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.482275  normal  0.262457 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0078  hypothetical protein  25.76 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4176  hypothetical protein  24.89 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4158  hypothetical protein  24.89 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4335  hypothetical protein  24.89 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4276  hypothetical protein  24.89 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4228  hypothetical protein  24.89 
 
 		 235 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>