48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1321 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_1321  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  483  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51626  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0317  hypothetical protein  29.41 
 
 
244 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1201  hypothetical protein  31.36 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.378726  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0062  hypothetical protein  29.29 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0118  putative phytochrome sensor protein  26.92 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0265  hypothetical protein  28.19 
 
 
232 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3475  protein of unknown function DUF484  28 
 
 
224 aa  62  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0824  hypothetical protein  28.57 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.124637  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0735  hypothetical protein  28.57 
 
 
223 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47720  hypothetical protein  28.88 
 
 
231 aa  60.5  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.526088  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0046  putative phytochrome sensor protein  30.41 
 
 
228 aa  58.9  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0184  hypothetical protein  26.27 
 
 
244 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0127  hypothetical protein  26.47 
 
 
233 aa  58.9  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0243  hypothetical protein  25.75 
 
 
236 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.181438  normal  0.791089 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0406  hypothetical protein  28.43 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6022  hypothetical protein  25.88 
 
 
233 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0223  hypothetical protein  27.27 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.282298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69700  hypothetical protein  25.44 
 
 
233 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.536796  normal  0.526464 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0860  hypothetical protein  28.5 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04123  hypothetical protein  24.75 
 
 
226 aa  54.3  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5229  hypothetical protein  26.46 
 
 
236 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5138  hypothetical protein  26.46 
 
 
236 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.850397 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0392  hypothetical protein  25.14 
 
 
206 aa  51.2  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00204  uncharacterized conserved protein, YigA-like protein  26.24 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5290  hypothetical protein  26.01 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4075  hypothetical protein  24.88 
 
 
232 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0379  hypothetical protein  26.32 
 
 
210 aa  49.7  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2392  hypothetical protein  26.53 
 
 
232 aa  48.5  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0081  hypothetical protein  27.59 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5500  hypothetical protein  25.98 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0078  hypothetical protein  27.36 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0056  hypothetical protein  28.81 
 
 
223 aa  45.4  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0197  hypothetical protein  26.05 
 
 
229 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000607225 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4307  hypothetical protein  23.96 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2997  protein of unknown function DUF484  24.46 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3687  hypothetical protein  24.46 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.949397  normal  0.502028 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0496  hypothetical protein  22.48 
 
 
249 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2543  hypothetical protein  24.65 
 
 
232 aa  43.5  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.181155  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2365  protein of unknown function DUF484  29.69 
 
 
227 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108305  hitchhiker  0.000000169554 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3836  protein of unknown function DUF484  26.29 
 
 
218 aa  43.5  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130921  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2745  hypothetical protein  29.69 
 
 
227 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.63273  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3581  hypothetical protein  24.21 
 
 
211 aa  43.5  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.239769  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0236  hypothetical protein  20.51 
 
 
227 aa  42.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0115318  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3696  protein of unknown function DUF484  27.5 
 
 
229 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3632  hypothetical protein  24.74 
 
 
211 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.731285 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0392  hypothetical protein  24.74 
 
 
211 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.401343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3373  protein of unknown function DUF484  27.92 
 
 
229 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0393  hypothetical protein  24.74 
 
 
211 aa  42  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>