More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2996 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2996  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
637 aa  1282    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00186457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.38 
 
 
603 aa  551  1e-155  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1591  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.82 
 
 
603 aa  544  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2430  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.44 
 
 
625 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00134328  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1287  methyl accepting chemotaxis protein, putative  47.64 
 
 
627 aa  502  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1604  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.26 
 
 
617 aa  405  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00349401  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1741  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.47 
 
 
597 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.049484  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0469  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.84 
 
 
608 aa  236  8e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.149565 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.15 
 
 
580 aa  204  4e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2108  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.43 
 
 
572 aa  203  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.798353  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1419  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.61 
 
 
641 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2481  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.93 
 
 
597 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0822598  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1396  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.91 
 
 
583 aa  112  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2577  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.8 
 
 
596 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0805708  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1376  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.92 
 
 
599 aa  100  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0139  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.97 
 
 
569 aa  92.8  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6729  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.31 
 
 
577 aa  70.1  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.340695  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0285  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.3 
 
 
411 aa  64.7  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4667  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.43 
 
 
590 aa  61.6  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3566  putative chemotaxis sensory transducer protein  21.38 
 
 
580 aa  59.7  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81094  normal  0.0204442 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0724  chemotaxis sensory transducer  24.18 
 
 
405 aa  58.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.435605 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.69 
 
 
406 aa  57.4  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03238  chemotaxis sensory transducer  26.57 
 
 
429 aa  55.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.62 
 
 
546 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.44 
 
 
566 aa  55.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.89 
 
 
566 aa  55.8  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00082247  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0615  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.75 
 
 
745 aa  54.3  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.685399  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.75 
 
 
745 aa  54.3  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.21 
 
 
532 aa  54.3  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0879  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.7 
 
 
633 aa  54.3  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1223  methyl-accepting chemotaxis protein  26.48 
 
 
381 aa  53.9  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.86 
 
 
739 aa  53.5  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000403913  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0671  putative twitching motility transmembrane protein  25.56 
 
 
743 aa  53.5  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1961  putative DNA-binding response regulator  24.81 
 
 
421 aa  52.8  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.26 
 
 
416 aa  53.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160053  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.48 
 
 
532 aa  52  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0260  putative chemotaxis transducer  25.27 
 
 
391 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.237341  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1789  hypothetical protein  22.62 
 
 
604 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.08 
 
 
383 aa  52.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1693  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.39 
 
 
598 aa  52  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0850375  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2016  methyl-accepting chemotaxis protein  28.82 
 
 
433 aa  51.6  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000104003  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2839  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.06 
 
 
546 aa  51.6  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.52 
 
 
550 aa  51.2  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2179  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.04 
 
 
415 aa  51.2  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0228  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.34 
 
 
667 aa  50.8  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4635  methyl-accepting chemotaxis protein  24.59 
 
 
658 aa  50.8  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  27.14 
 
 
663 aa  50.4  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0112406  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.13 
 
 
673 aa  50.4  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0181  methyl-accepting chemotaxis protein  28.68 
 
 
696 aa  50.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00160845  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0509  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.34 
 
 
666 aa  50.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000844427  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.34 
 
 
667 aa  50.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  24.42 
 
 
660 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  24.42 
 
 
660 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0595  methyl-accepting chemotaxis protein  25.84 
 
 
314 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  24.42 
 
 
660 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0247  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.49 
 
 
528 aa  50.1  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  24.42 
 
 
660 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.53 
 
 
712 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0894354  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.83 
 
 
575 aa  50.4  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1245  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.5 
 
 
543 aa  50.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403133  normal  0.310409 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3813  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.4 
 
 
658 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0320682 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3904  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.4 
 
 
658 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.202773  normal  0.313356 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1662  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.17 
 
 
550 aa  49.3  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.57 
 
 
543 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0283  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.33 
 
 
420 aa  49.7  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0811  methyl-accepting chemotaxis protein  25.84 
 
 
314 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.01 
 
 
546 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  24.42 
 
 
660 aa  49.7  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0137  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.92 
 
 
748 aa  49.7  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0496  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.41 
 
 
670 aa  49.7  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.474098  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0696  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  21.94 
 
 
659 aa  49.3  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.738999  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0367  chemotaxis sensory transducer  24.52 
 
 
483 aa  49.7  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.124323  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.4 
 
 
658 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.82 
 
 
619 aa  48.9  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0042391  normal  0.0195698 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2783  methyl-accepting chemotaxis protein  29.57 
 
 
705 aa  48.9  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.260069  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2016  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.43 
 
 
519 aa  48.5  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2549  chemotaxis sensory transducer  28.51 
 
 
707 aa  48.9  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3325  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.37 
 
 
491 aa  48.9  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0262  chemotaxis sensory transducer  28.7 
 
 
442 aa  48.5  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.244306  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5394  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.45 
 
 
585 aa  48.9  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0438487  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0619  hypothetical protein  22.16 
 
 
579 aa  48.9  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02270  putative chemotaxis transducer  25.77 
 
 
390 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319109  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3639  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.33 
 
 
652 aa  48.9  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.64 
 
 
533 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3591  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.24 
 
 
718 aa  48.9  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000229176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  26.92 
 
 
544 aa  48.5  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1385  methyl-accepting chemotaxis protein  29.81 
 
 
520 aa  48.5  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1140  chemotaxis sensory transducer  24.02 
 
 
418 aa  48.5  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4621  methyl-accepting chemotaxis protein  25.84 
 
 
313 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000649403 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0606  methyl-accepting chemotaxis protein  27.05 
 
 
587 aa  48.5  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.95 
 
 
707 aa  48.5  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1704  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  26.67 
 
 
663 aa  48.1  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.034056  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1267  methyl-accepting chemotaxis protein  29.75 
 
 
557 aa  48.1  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3145  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.59 
 
 
832 aa  48.1  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.390275  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0684  methyl-accepting chemotaxis protein  23.2 
 
 
314 aa  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0246587  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2159  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  27.12 
 
 
523 aa  48.1  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416992  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  29.81 
 
 
522 aa  48.1  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  29.81 
 
 
522 aa  48.1  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2222  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.29 
 
 
378 aa  48.1  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.894674  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.85 
 
 
539 aa  48.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>