More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1604 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1604  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
617 aa  1244    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00349401  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1741  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.51 
 
 
597 aa  497  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.049484  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2996  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.26 
 
 
637 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00186457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.14 
 
 
603 aa  388  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1591  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.85 
 
 
603 aa  385  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2430  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.35 
 
 
625 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00134328  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1287  methyl accepting chemotaxis protein, putative  38.65 
 
 
627 aa  355  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2108  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.01 
 
 
572 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.798353  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.56 
 
 
580 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0469  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.77 
 
 
608 aa  201  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.149565 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1419  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.78 
 
 
641 aa  187  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1396  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.06 
 
 
583 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2481  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.02 
 
 
597 aa  97.1  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0822598  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2577  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.02 
 
 
596 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0805708  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0139  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.49 
 
 
569 aa  90.5  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287103  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1376  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.67 
 
 
599 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4667  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.95 
 
 
590 aa  72  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.55 
 
 
519 aa  63.5  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.418042  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4353  methyl-accepting chemotaxis protein  20.91 
 
 
575 aa  62  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.19 
 
 
468 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853292  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1100  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.74 
 
 
465 aa  60.5  0.00000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0274031  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3156  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.96 
 
 
416 aa  60.5  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000160053  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2883  chemotaxis sensory transducer  26.4 
 
 
537 aa  60.1  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  7.44547e-18  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3236  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.19 
 
 
476 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315544  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3566  putative chemotaxis sensory transducer protein  20.21 
 
 
580 aa  59.3  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81094  normal  0.0204442 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5132  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.19 
 
 
468 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.202601  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3267  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.83 
 
 
581 aa  57.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.435218 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.04 
 
 
664 aa  57.4  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00177625  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.04 
 
 
664 aa  57.4  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6729  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.88 
 
 
577 aa  57  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.340695  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2663  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.62 
 
 
418 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.457369  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3483  putative methyl-accepting chemotaxis protein  23.78 
 
 
352 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3310  putative methyl-accepting chemotaxis protein  23.78 
 
 
352 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.740696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1534  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.15 
 
 
297 aa  56.2  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3390  putative methyl-accepting chemotaxis protein  23.78 
 
 
351 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.927334 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3320  putative methyl-accepting chemotaxis protein  23.78 
 
 
351 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.781767  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0759  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.39 
 
 
406 aa  55.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3384  putative methyl-accepting chemotaxis protein  23.78 
 
 
352 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.644477  normal  0.732859 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1386  methyl-accepting chemotaxis protein  29.59 
 
 
611 aa  55.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1160  chemotaxis sensory transducer  25.41 
 
 
559 aa  55.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0484  methyl-accepting chemotaxis protein  36.76 
 
 
706 aa  54.3  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00175726  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0556  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.83 
 
 
690 aa  54.3  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.83 
 
 
690 aa  53.9  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4122  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.4 
 
 
676 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0181  methyl-accepting chemotaxis protein  27.88 
 
 
696 aa  53.5  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00160845  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1491  chemotaxis sensory transducer  26.85 
 
 
393 aa  53.5  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000901619  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1816  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.84 
 
 
514 aa  53.9  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.4 
 
 
661 aa  53.5  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0619  methyl-accepting chemotaxis protein  36.76 
 
 
696 aa  52.8  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00139031  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5394  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.39 
 
 
585 aa  52.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0438487  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.32 
 
 
618 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.47 
 
 
619 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0042391  normal  0.0195698 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1571  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.21 
 
 
362 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1146  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.05 
 
 
668 aa  52.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.970933  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.36 
 
 
762 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000205913  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2142  methyl-accepting chemotaxis protein  36.76 
 
 
712 aa  52  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0206  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
425 aa  52  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0285  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.59 
 
 
411 aa  52.4  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.69 
 
 
681 aa  52  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000583139  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1284  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  26.62 
 
 
707 aa  51.6  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  34 
 
 
459 aa  51.6  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1324  methyl-accepting chemotaxis protein  34 
 
 
459 aa  51.2  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1557  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  20.23 
 
 
530 aa  51.2  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0755  chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 
567 aa  51.2  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.25 
 
 
360 aa  51.6  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0345  methyl-accepting chemotaxis protein DmcB  25.78 
 
 
410 aa  50.4  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1648  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 
832 aa  50.4  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.365743  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2783  methyl-accepting chemotaxis protein  35.94 
 
 
705 aa  50.4  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.260069  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.7 
 
 
689 aa  50.4  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946735  normal  0.191331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 
541 aa  50.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0539  methyl-accepting chemotaxis protein  33 
 
 
459 aa  50.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.1 
 
 
697 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1539  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 
432 aa  50.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.457708  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0520  GntT protein  20.81 
 
 
306 aa  50.1  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5512  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  24.29 
 
 
492 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.434942 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0350  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 
430 aa  50.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0418  methyl-accepting chemotaxis protein  30.36 
 
 
430 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3951  hypothetical protein  27.19 
 
 
420 aa  50.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.131979  normal  0.604734 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4900  methyl-accepting chemotaxis protein  30.36 
 
 
430 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.18 
 
 
687 aa  49.3  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0850  methyl-accepting chemotaxis protein  40.74 
 
 
721 aa  49.3  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000224033  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2549  methyl-accepting chemotaxis protein  35.38 
 
 
699 aa  49.3  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0016673  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.89 
 
 
693 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  31.25 
 
 
490 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.46 
 
 
430 aa  49.7  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2179  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.61 
 
 
415 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.57 
 
 
537 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0130  chemotaxis sensory transducer  39.34 
 
 
491 aa  49.3  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25 
 
 
543 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2760  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.09 
 
 
639 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.58 
 
 
680 aa  49.7  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2149  hypothetical protein  24.81 
 
 
374 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.393338  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0469  methyl-accepting chemotaxis protein  30.36 
 
 
430 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21590  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.16 
 
 
500 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2026  chemotaxis sensory transducer  23.02 
 
 
440 aa  49.3  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21850  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.84 
 
 
484 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.925753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0079  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.63 
 
 
588 aa  49.3  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.031352  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0065  methyl-accepting chemotaxis protein  23.75 
 
 
548 aa  49.3  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.826549  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0356  methyl-accepting chemotaxis protein  30.36 
 
 
430 aa  48.5  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0339  methyl-accepting chemotaxis protein  30.36 
 
 
430 aa  48.5  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>