180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3490 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3490  protein export chaperone SecB  100 
 
 		 143 aa  299  9e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1409  preprotein translocase subunit SecB-like protein  38.81 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000344425  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0672  protein translocase subunit secB  35 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000222078 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2402  preprotein translocase subunit SecB  37.27 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2127  preprotein translocase, SecB subunit  34.31 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1786  protein-export protein SecB  34.31 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3422  preprotein translocase subunit SecB  33.08 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3282  preprotein translocase subunit SecB  38.71 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0034  preprotein translocase subunit SecB  44.58 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3940  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.222523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1541  preprotein translocase subunit SecB  34.62 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4266  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0298  preprotein translocase subunit SecB  29.37 
 
 		 164 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1556  preprotein translocase subunit SecB  39.53 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144211  normal  0.156074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0157  preprotein translocase subunit SecB  40 
 
 		 162 aa  63.5  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.533969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2185  protein translocase subunit secB  37.84 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2784  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.351495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2025  protein-export protein SecB  37.65 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1124  preprotein translocase subunit SecB  36.47 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0422  preprotein translocase subunit SecB  31.48 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0015  hypothetical protein  27.41 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0807  preprotein translocase subunit SecB  40.48 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.231005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0997  protein-export protein SecB  31.73 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1788  preprotein translocase subunit SecB  33.64 
 
 		 166 aa  62  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3214  preprotein translocase subunit SecB  33.71 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0613  preprotein translocase subunit SecB  36.47 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0399  preprotein translocase subunit SecB  38.67 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0304  preprotein translocase subunit SecB  31.48 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497877  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1373  protein-export protein SecB  30.1 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682681  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0106  preprotein translocase subunit SecB  39.13 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0552853 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1250  protein-export protein SecB  30.63 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.813079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1213  preprotein translocase subunit SecB  33.98 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1953  protein-export protein SecB  41.43 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000705897  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0048  protein translocase subunit secB  41.43 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1559  protein-export protein SecB  38.24 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.664981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1838  protein-export protein SecB  38.24 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1738  preprotein translocase subunit SecB  41.03 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00191697  normal  0.166056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3712  protein-export protein SecB  38.24 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0537  preprotein translocase subunit SecB  32.41 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0269  preprotein translocase subunit SecB  32.41 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1682  protein-export protein SecB  38.24 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113073  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2537  preprotein translocase subunit SecB  34.09 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.849005  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2256  preprotein translocase subunit SecB  38.67 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2227  preprotein translocase subunit SecB  38.67 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0889  preprotein translocase subunit SecB  27.68 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.098397  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4178  preprotein translocase subunit SecB  32.11 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3447  preprotein translocase subunit SecB  31.4 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1805  preprotein translocase subunit SecB  28.44 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3200  preprotein translocase subunit SecB  30.25 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.0234316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4882  preprotein translocase subunit SecB  38.55 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4138  preprotein translocase subunit SecB  37.25 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0072  preprotein translocase subunit SecB  37.25 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0078  preprotein translocase subunit SecB  37.25 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1237  preprotein translocase subunit SecB  30.84 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3483  preprotein translocase subunit SecB  35.37 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1296  preprotein translocase subunit SecB  31.46 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.451695  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2898  preprotein translocase subunit SecB  30.84 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3813  preprotein translocase subunit SecB  37.18 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1650  protein-export protein SecB  33.33 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.833903  normal  0.583875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3855  preprotein translocase subunit SecB  28.57 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.138411  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04700  preprotein translocase subunit SecB  32.09 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.800736  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3242  hypothetical protein  25.44 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0116  preprotein translocase subunit SecB  30.28 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4019  preprotein translocase subunit SecB  33.65 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0848  preprotein translocase subunit SecB  30.11 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406378  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2072  preprotein translocase subunit SecB  30.11 
 
 		 163 aa  57  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0336  preprotein translocase subunit SecB  31.62 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.523386  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2857  preprotein translocase subunit SecB  31.19 
 
 		 164 aa  57  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.567716  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0930  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.603252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0126  preprotein translocase subunit SecB  33.62 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1992  preprotein translocase subunit SecB  30.11 
 
 		 163 aa  57  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03467  export protein SecB  33.62 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0096  protein-export protein SecB  33.62 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5324  protein-export protein SecB  37.35 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3205  preprotein translocase subunit SecB  32.41 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4113  preprotein translocase subunit SecB  33.62 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0665  preprotein translocase subunit SecB  32.41 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4982  preprotein translocase subunit SecB  33.62 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3946  preprotein translocase subunit SecB  33.62 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.738209 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1312  preprotein translocase subunit SecB  28.97 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3821  preprotein translocase subunit SecB  33.62 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0412  preprotein translocase subunit SecB  31.58 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.704473 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0007  preprotein translocase subunit SecB  34.12 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03418  hypothetical protein  33.62 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4082  preprotein translocase subunit SecB  42.11 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.908003  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0178  preprotein translocase subunit SecB  32.41 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0099  preprotein translocase subunit SecB  33.62 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1414  preprotein translocase subunit SecB  32.41 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0481  preprotein translocase subunit SecB  32.41 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0500  preprotein translocase subunit SecB  32.41 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2841  preprotein translocase subunit SecB  32.41 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4037  preprotein translocase subunit SecB  33.62 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2674  preprotein translocase subunit SecB  29.91 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.876121  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0135  preprotein translocase subunit SecB  25.89 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4363  preprotein translocase subunit SecB  42.11 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5037  protein-export protein SecB  32.18 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0419  preprotein translocase subunit SecB  39.71 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2979  protein translocase subunit secB  35.19 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0449  preprotein translocase subunit SecB  30.56 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.513958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0045  preprotein translocase subunit SecB  41.46 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>