158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1409 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1409  preprotein translocase subunit SecB-like protein  100 
 
 		 143 aa  295  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000344425  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3490  protein export chaperone SecB  38.81 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0889  preprotein translocase subunit SecB  45.28 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.098397  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0930  preprotein translocase subunit SecB  45.76 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.603252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3813  preprotein translocase subunit SecB  48.08 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0716  preprotein translocase subunit SecB  52.27 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.946363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1312  preprotein translocase subunit SecB  48.84 
 
 		 155 aa  55.1  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655485  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3855  preprotein translocase subunit SecB  46.67 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.138411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1650  protein-export protein SecB  28.1 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.833903  normal  0.583875 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0422  preprotein translocase subunit SecB  28.32 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0041  preprotein translocase subunit SecB  37.31 
 
 		 169 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.815394 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4100  protein-export protein SecB  56.76 
 
 		 154 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154363  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0157  preprotein translocase subunit SecB  31.25 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.533969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0269  preprotein translocase subunit SecB  50 
 
 		 156 aa  52  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0399  preprotein translocase subunit SecB  32.32 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2127  preprotein translocase, SecB subunit  55.26 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1786  protein-export protein SecB  55.26 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0419  preprotein translocase subunit SecB  46.81 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0304  preprotein translocase subunit SecB  32.97 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.497877  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4178  preprotein translocase subunit SecB  50 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2857  preprotein translocase subunit SecB  27.5 
 
 		 164 aa  51.6  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.567716  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0449  preprotein translocase subunit SecB  50 
 
 		 160 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.513958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1816  protein-export protein SecB  51.28 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0364683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1805  preprotein translocase subunit SecB  32.98 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0537  preprotein translocase subunit SecB  50 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3447  preprotein translocase subunit SecB  26.72 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2865  preprotein translocase subunit SecB  51.28 
 
 		 164 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794301 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3205  preprotein translocase subunit SecB  47.73 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2771  preprotein translocase subunit SecB  51.28 
 
 		 163 aa  51.2  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0665  preprotein translocase subunit SecB  47.73 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2240  preprotein translocase subunit SecB  51.28 
 
 		 164 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.274715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2854  preprotein translocase subunit SecB  51.28 
 
 		 164 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0178  preprotein translocase subunit SecB  47.73 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1414  preprotein translocase subunit SecB  47.73 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0481  preprotein translocase subunit SecB  47.73 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0500  preprotein translocase subunit SecB  47.73 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2841  preprotein translocase subunit SecB  47.73 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6183  preprotein translocase subunit SecB  51.28 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2909  preprotein translocase subunit SecB  51.28 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2898  preprotein translocase subunit SecB  30.95 
 
 		 166 aa  50.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.303411  normal  0.576024 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1237  preprotein translocase subunit SecB  30.95 
 
 		 175 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2185  protein translocase subunit secB  39.22 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.893597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1945  protein-export protein SecB  48.72 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1559  protein-export protein SecB  32.22 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.664981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1682  protein-export protein SecB  32.22 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2402  preprotein translocase subunit SecB  28.7 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1124  preprotein translocase subunit SecB  40.3 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0940  protein-export protein SecB  45.24 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.743949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2674  preprotein translocase subunit SecB  28.57 
 
 		 166 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.876121  normal  0.501465 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1838  protein-export protein SecB  32.22 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.294685  normal  0.302662 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0356  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 		 173 aa  48.9  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0685148 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0106  preprotein translocase subunit SecB  46.34 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0552853 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0298  preprotein translocase subunit SecB  36.14 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0015  hypothetical protein  30.37 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0997  protein-export protein SecB  31.51 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2072  preprotein translocase subunit SecB  40 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0116  preprotein translocase subunit SecB  46.34 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0212  preprotein translocase subunit SecB  45 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.162983 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0231  preprotein translocase subunit SecB  45 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00543911 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1992  preprotein translocase subunit SecB  40 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2537  preprotein translocase subunit SecB  50 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.849005  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1953  protein-export protein SecB  50 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000705897  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0193  preprotein translocase subunit SecB  44.74 
 
 		 171 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0848  preprotein translocase subunit SecB  40 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.406378  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0048  protein translocase subunit secB  41.3 
 
 		 164 aa  47.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2825  preprotein translocase subunit SecB  46.81 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0672  protein translocase subunit secB  29.46 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000222078 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3502  preprotein translocase subunit SecB  46.81 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3200  preprotein translocase subunit SecB  33.33 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.0234316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1373  protein-export protein SecB  32.94 
 
 		 168 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.682681  normal  0.109724 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3712  protein-export protein SecB  40 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.247927 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03970  preprotein translocase subunit SecB  39.58 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00541  preprotein translocase subunit SecB  31.34 
 
 		 169 aa  46.2  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1130  preprotein translocase subunit SecB  35.09 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00591719  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1222  preprotein translocase subunit SecB  35.09 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1541  preprotein translocase subunit SecB  48.72 
 
 		 154 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0307  preprotein translocase subunit SecB  35.85 
 
 		 172 aa  45.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0034  preprotein translocase subunit SecB  56.25 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3940  preprotein translocase subunit SecB  37.78 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.222523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2784  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 		 177 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.351495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4266  preprotein translocase subunit SecB  37.78 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.200304 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2346  protein-export protein SecB  36.21 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0798372  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3214  preprotein translocase subunit SecB  40 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1702  preprotein translocase subunit SecB  41.86 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0465  preprotein translocase subunit SecB  41.86 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0314  preprotein translocase subunit SecB  37.5 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0978509 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0135  preprotein translocase subunit SecB  28.21 
 
 		 172 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0613  preprotein translocase subunit SecB  43.75 
 
 		 152 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0254  preprotein translocase subunit SecB  35.85 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1788  preprotein translocase subunit SecB  31.08 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2025  protein-export protein SecB  39.13 
 
 		 178 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3483  preprotein translocase subunit SecB  37.78 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.176392  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3422  preprotein translocase subunit SecB  27.16 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0007  preprotein translocase subunit SecB  37.78 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3804  preprotein translocase subunit SecB  26.5 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.903933  normal  0.687684 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0156  preprotein translocase subunit SecB  30.88 
 
 		 171 aa  44.3  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1250  protein-export protein SecB  40.48 
 
 		 168 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.813079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1296  preprotein translocase subunit SecB  35 
 
 		 159 aa  43.9  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.451695  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0807  preprotein translocase subunit SecB  42.86 
 
 		 151 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.231005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3208  protein-export protein chaperone SecB  29.49 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.191942 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>