90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1636 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  99.78 
 
 		 906 bp  1780    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1636    100 
 
 		 906 bp  1796    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  99.78 
 
 		 906 bp  1780    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  99.67 
 
 		 906 bp  1772    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  99.67 
 
 		 906 bp  1772    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2741  Integrase catalytic region  99.56 
 
 		 450 bp  876    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0894729  normal  0.05514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0760  integrase catalytic subunit  87.25 
 
 		 735 bp  99.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  91.55 
 
 		 906 bp  93.7  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  91.55 
 
 		 906 bp  93.7  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2043    91.55 
 
 		 2389 bp  93.7  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153153  hitchhiker  0.00767267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  91.55 
 
 		 906 bp  93.7  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  85.09 
 
 		 900 bp  91.7  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  85.09 
 
 		 900 bp  91.7  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  89.61 
 
 		 906 bp  89.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  89.61 
 
 		 906 bp  89.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  90.14 
 
 		 876 bp  85.7  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  95.92 
 
 		 852 bp  81.8  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3906    95.92 
 
 		 912 bp  81.8  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414091  normal  0.612395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1445    89.04 
 
 		 324 bp  81.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  88.73 
 
 		 906 bp  77.8  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02392  ISPsy21, transposase OrfB  83.64 
 
 		 774 bp  75.8  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  87.18 
 
 		 906 bp  75.8  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  86.42 
 
 		 906 bp  73.8  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3375    93.88 
 
 		 279 bp  73.8  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.292751 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  86.42 
 
 		 906 bp  73.8  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3563    91.07 
 
 		 943 bp  71.9  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452743  normal  0.133184 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2222  integrase catalytic subunit  92.31 
 
 		 837 bp  71.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1616    91.07 
 
 		 793 bp  71.9  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1815  hypothetical protein  87.32 
 
 		 309 bp  69.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3544    86.67 
 
 		 802 bp  69.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3476  hypothetical protein  97.37 
 
 		 657 bp  67.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.184573 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  91.84 
 
 		 915 bp  65.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13357  transposase  90.38 
 
 		 885 bp  63.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.77516e-37  normal  0.294919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12114  hypothetical protein  90.38 
 
 		 885 bp  63.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.76426e-46  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12378  transposase  90.38 
 
 		 885 bp  63.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6977900000000003e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12381  transposase  90.38 
 
 		 885 bp  63.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.55066e-37  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12415    90.38 
 
 		 1916 bp  63.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000185069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12416  transposase  90.38 
 
 		 885 bp  63.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.46754e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12828  transposase  90.38 
 
 		 885 bp  63.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44608e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13130    90.38 
 
 		 2027 bp  63.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000997502  normal  0.0691909 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13132  transposase  90.38 
 
 		 885 bp  63.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000174572  normal  0.138383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13206  transposase  90.38 
 
 		 885 bp  63.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3114300000000003e-18  normal  0.570802 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01694  TnpB  86.76 
 
 		 300 bp  63.9  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  91.67 
 
 		 849 bp  63.9  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12047    90.38 
 
 		 2615 bp  63.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0256543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  91.67 
 
 		 849 bp  63.9  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10852  transposase  90.38 
 
 		 885 bp  63.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.901690000000001e-44  decreased coverage  0.0000000161998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11348  transposase  90.38 
 
 		 837 bp  63.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.0645000000000005e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11738    90.38 
 
 		 1775 bp  63.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.28559e-27  normal  0.52056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11739  transposase  90.38 
 
 		 885 bp  63.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.46568e-46  normal  0.519629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11780  transposase  90.38 
 
 		 885 bp  63.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.89938e-72  hitchhiker  0.00000000193173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11785  transposase  90.38 
 
 		 885 bp  63.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.8775e-79  hitchhiker  0.0000000184324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11792  transposase  90.38 
 
 		 885 bp  63.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.87208e-50  hitchhiker  0.00000308071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12048  transposase  90.38 
 
 		 885 bp  63.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.2114e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11806  transposase  90.38 
 
 		 885 bp  63.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.55346e-33  hitchhiker  0.00499729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11773  transposase  90.38 
 
 		 885 bp  63.9  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.63075e-23  hitchhiker  0.0000000024473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6731    91.49 
 
 		 2015 bp  61.9  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  82.24 
 
 		 906 bp  61.9  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0482  putative transposase  86.57 
 
 		 96 bp  61.9  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.775995  normal  0.273328 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3736  integrase catalytic region  94.74 
 
 		 906 bp  60  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3929    92.86 
 
 		 216 bp  60  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5392    90 
 
 		 124 bp  60  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.619468  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3705  integrase catalytic region  94.74 
 
 		 906 bp  60  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1608    91.11 
 
 		 916 bp  58  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2687    92.68 
 
 		 267 bp  58  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20940    88.68 
 
 		 243 bp  58  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.114124  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  91.11 
 
 		 915 bp  58  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  89.8 
 
 		 849 bp  58  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  89.8 
 
 		 849 bp  58  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  81.48 
 
 		 912 bp  56  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2977  Tn4652, transposase subunit B  90.91 
 
 		 906 bp  56  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  90.7 
 
 		 858 bp  54  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  90.7 
 
 		 858 bp  54  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0539  transposase  88.24 
 
 		 300 bp  54  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0536    88.24 
 
 		 456 bp  54  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.193561  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  90.7 
 
 		 858 bp  54  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  88.24 
 
 		 906 bp  54  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  88.24 
 
 		 906 bp  54  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  90.7 
 
 		 858 bp  54  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  90.7 
 
 		 858 bp  54  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5582  integrase catalytic subunit  93.94 
 
 		 915 bp  50.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0423164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  88.89 
 
 		 915 bp  50.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5587  integrase catalytic subunit  93.94 
 
 		 915 bp  50.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.123613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5653  integrase catalytic subunit  93.94 
 
 		 915 bp  50.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5987  hypothetical protein  93.94 
 
 		 765 bp  50.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129837 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6152    82.41 
 
 		 249 bp  48.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 5562 bp  48.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7786  hypothetical protein  91.67 
 
 		 324 bp  48.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0016591  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1703    91.67 
 
 		 641 bp  48.1  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3855  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  100 
 
 		 519 bp  48.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>