20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_20940 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_20940    100 
 
 
243 bp  482  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.114124  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15130  transposase  83.51 
 
 
915 bp  115  6e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0124781  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  94.74 
 
 
906 bp  60  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  94.74 
 
 
906 bp  60  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  94.74 
 
 
906 bp  60  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2043    94.74 
 
 
2389 bp  60  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153153  hitchhiker  0.00767267 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  88.68 
 
 
906 bp  58  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2741  Integrase catalytic region  88.68 
 
 
450 bp  58  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0894729  normal  0.05514 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  88.68 
 
 
906 bp  58  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1636    88.68 
 
 
906 bp  58  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  88.68 
 
 
906 bp  58  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  92.11 
 
 
876 bp  52  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.305005 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  86.79 
 
 
906 bp  50.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2977  Tn4652, transposase subunit B  85.96 
 
 
906 bp  50.1  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  85.96 
 
 
852 bp  50.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3906    85.96 
 
 
912 bp  50.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414091  normal  0.612395 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02392  ISPsy21, transposase OrfB  83.82 
 
 
774 bp  48.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  100 
 
 
906 bp  46.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  100 
 
 
906 bp  46.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0066    91.43 
 
 
631 bp  46.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>