101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3906 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_3906    100 
 
 		 912 bp  1808    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414091  normal  0.612395 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  99.3 
 
 		 852 bp  1641    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3375    88.89 
 
 		 279 bp  287  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.292751 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  79.5 
 
 		 858 bp  232  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  79.5 
 
 		 858 bp  232  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  79.5 
 
 		 858 bp  232  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  79.5 
 
 		 858 bp  232  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  79.5 
 
 		 858 bp  232  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  80.92 
 
 		 915 bp  224  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  84.81 
 
 		 849 bp  210  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  84.81 
 
 		 849 bp  210  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  80.6 
 
 		 855 bp  206  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  80.6 
 
 		 855 bp  206  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  80.6 
 
 		 855 bp  206  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  80.6 
 
 		 855 bp  206  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1608    80.28 
 
 		 916 bp  202  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  79.72 
 
 		 912 bp  180  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1748  integrase, catalytic region  85.45 
 
 		 240 bp  176  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32158 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  80.09 
 
 		 849 bp  170  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  80.09 
 
 		 849 bp  170  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4953  integrase catalytic region  81.91 
 
 		 852 bp  157  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  86.13 
 
 		 915 bp  121  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  85.71 
 
 		 915 bp  119  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2492    86.61 
 
 		 565 bp  103  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  normal  0.0258476 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1749    86.09 
 
 		 198 bp  101  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31896 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5392    86.18 
 
 		 124 bp  101  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.619468  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  84.5 
 
 		 906 bp  97.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  84.5 
 
 		 906 bp  97.6  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  85.59 
 
 		 900 bp  93.7  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  85.59 
 
 		 900 bp  93.7  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6152    83.58 
 
 		 249 bp  91.7  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1719    83.1 
 
 		 473 bp  91.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  79.52 
 
 		 906 bp  89.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2222  integrase catalytic subunit  94.44 
 
 		 837 bp  83.8  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1616    84.07 
 
 		 793 bp  81.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3563    84.07 
 
 		 943 bp  81.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452743  normal  0.133184 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  95.92 
 
 		 906 bp  81.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1636    95.92 
 
 		 906 bp  81.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  95.92 
 
 		 906 bp  81.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  95.92 
 
 		 906 bp  81.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2741  Integrase catalytic region  95.92 
 
 		 450 bp  81.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0894729  normal  0.05514 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  79.17 
 
 		 906 bp  79.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  79.17 
 
 		 906 bp  79.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01694  TnpB  82.22 
 
 		 300 bp  77.8  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1141  integrase catalytic region  87.84 
 
 		 552 bp  75.8  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.555646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  93.88 
 
 		 906 bp  73.8  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6731    88.24 
 
 		 2015 bp  71.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.144839 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2977  Tn4652, transposase subunit B  89.83 
 
 		 906 bp  69.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6153    88.71 
 
 		 327 bp  67.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10852  transposase  90.74 
 
 		 885 bp  67.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.901690000000001e-44  decreased coverage  0.0000000161998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11348  transposase  90.74 
 
 		 837 bp  67.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.0645000000000005e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11738    90.74 
 
 		 1775 bp  67.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.28559e-27  normal  0.52056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11739  transposase  90.74 
 
 		 885 bp  67.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.46568e-46  normal  0.519629 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11773  transposase  90.74 
 
 		 885 bp  67.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.63075e-23  hitchhiker  0.0000000024473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11780  transposase  90.74 
 
 		 885 bp  67.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.89938e-72  hitchhiker  0.00000000193173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11785  transposase  90.74 
 
 		 885 bp  67.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.8775e-79  hitchhiker  0.0000000184324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11792  transposase  90.74 
 
 		 885 bp  67.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.87208e-50  hitchhiker  0.00000308071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11806  transposase  90.74 
 
 		 885 bp  67.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.55346e-33  hitchhiker  0.00499729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12047    90.74 
 
 		 2615 bp  67.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0256543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12048  transposase  90.74 
 
 		 885 bp  67.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.2114e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12114  hypothetical protein  90.74 
 
 		 885 bp  67.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.76426e-46  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12378  transposase  90.74 
 
 		 885 bp  67.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6977900000000003e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12381  transposase  90.74 
 
 		 885 bp  67.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.55066e-37  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12415    90.74 
 
 		 1916 bp  67.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000185069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12416  transposase  90.74 
 
 		 885 bp  67.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.46754e-28  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12828  transposase  90.74 
 
 		 885 bp  67.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44608e-31  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13130    90.74 
 
 		 2027 bp  67.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000997502  normal  0.0691909 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13132  transposase  90.74 
 
 		 885 bp  67.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000174572  normal  0.138383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13206  transposase  90.74 
 
 		 885 bp  67.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3114300000000003e-18  normal  0.570802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13357  transposase  90.74 
 
 		 885 bp  67.9  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.77516e-37  normal  0.294919 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0760  integrase catalytic subunit  82.3 
 
 		 735 bp  65.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0647  transposase subunit; putative  93.33 
 
 		 120 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  91.67 
 
 		 906 bp  63.9  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0115  ISBt3 transposase subunit protein  85.53 
 
 		 336 bp  63.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.35522  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2037  transposase subunit; putative  93.02 
 
 		 279 bp  61.9  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1286  hypothetical protein  84.34 
 
 		 558 bp  61.9  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.350643  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3544    88.14 
 
 		 802 bp  61.9  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  85.92 
 
 		 936 bp  61.9  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2177  hypothetical protein  87.93 
 
 		 252 bp  60  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000500681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  78 
 
 		 906 bp  60  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  79.75 
 
 		 906 bp  60  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  79.75 
 
 		 906 bp  60  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02392  ISPsy21, transposase OrfB  90 
 
 		 774 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02252  ISPsy21, transposase OrfB  85.51 
 
 		 687 bp  58  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03920  ISPsy21, transposase OrfB  85.51 
 
 		 513 bp  58  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.67034  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0133  transposase subunit; putative  90.91 
 
 		 207 bp  56  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2043    90.91 
 
 		 2389 bp  56  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153153  hitchhiker  0.00767267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  90.91 
 
 		 906 bp  56  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  90.91 
 
 		 906 bp  56  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  90.91 
 
 		 906 bp  56  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3889  hypothetical protein  94.12 
 
 		 405 bp  52  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3384  hypothetical protein  80.7 
 
 		 345 bp  52  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1287  hypothetical protein  93.94 
 
 		 189 bp  50.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.868264  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3705  integrase catalytic region  84.62 
 
 		 906 bp  50.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3736  integrase catalytic region  84.62 
 
 		 906 bp  50.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2687    88.89 
 
 		 267 bp  50.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20940    85.96 
 
 		 243 bp  50.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.114124  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8255  transposase  88.64 
 
 		 369 bp  48.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0325797  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14010  transposase  85.71 
 
 		 660 bp  48.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1236  Integrase catalytic region  88.64 
 
 		 876 bp  48.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.305005 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>