11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1749 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1749    100 
 
 		 198 bp  392  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.31896 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3906    86.09 
 
 		 912 bp  101  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414091  normal  0.612395 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  97.14 
 
 		 852 bp  61.9  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4953  integrase catalytic region  96.77 
 
 		 852 bp  54  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  88.64 
 
 		 849 bp  48.1  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  88.64 
 
 		 849 bp  48.1  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4227  hypothetical protein  89.74 
 
 		 324 bp  46.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  93.55 
 
 		 855 bp  46.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  93.55 
 
 		 855 bp  46.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  93.55 
 
 		 855 bp  46.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  93.55 
 
 		 855 bp  46.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>