44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2492 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2492    100 
 
 		 565 bp  1120    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  normal  0.0258476 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  79.81 
 
 		 849 bp  155  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  79.81 
 
 		 849 bp  155  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  87.5 
 
 		 852 bp  111  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  91.57 
 
 		 915 bp  109  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1141  integrase catalytic region  87.62 
 
 		 552 bp  105  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.555646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3906    86.61 
 
 		 912 bp  103  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414091  normal  0.612395 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1608    92.96 
 
 		 916 bp  101  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  88.76 
 
 		 849 bp  97.6  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  88.76 
 
 		 849 bp  97.6  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  80.68 
 
 		 858 bp  93.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  80.68 
 
 		 858 bp  93.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  80.68 
 
 		 858 bp  93.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  80.68 
 
 		 858 bp  93.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  80.68 
 
 		 858 bp  93.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3375    81.93 
 
 		 279 bp  91.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.292751 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1719    85.85 
 
 		 473 bp  91.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  81.94 
 
 		 912 bp  85.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5392    85.58 
 
 		 124 bp  79.8  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.619468  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  92.86 
 
 		 855 bp  79.8  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  92.86 
 
 		 855 bp  79.8  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  92.86 
 
 		 855 bp  79.8  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  92.86 
 
 		 855 bp  79.8  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  82.14 
 
 		 906 bp  79.8  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  82.14 
 
 		 906 bp  79.8  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6153    91.53 
 
 		 327 bp  77.8  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  86.05 
 
 		 915 bp  75.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4953  integrase catalytic region  93.75 
 
 		 852 bp  71.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  81.41 
 
 		 915 bp  71.9  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6152    81.29 
 
 		 249 bp  69.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  80.38 
 
 		 906 bp  67.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  86.3 
 
 		 900 bp  65.9  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  86.3 
 
 		 900 bp  65.9  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1748  integrase, catalytic region  90.2 
 
 		 240 bp  61.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32158 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  87.3 
 
 		 906 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  87.3 
 
 		 906 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02392  ISPsy21, transposase OrfB  81.36 
 
 		 774 bp  60  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8478    88.46 
 
 		 102 bp  56  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.744353  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  87.27 
 
 		 906 bp  54  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  87.27 
 
 		 906 bp  54  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  87.27 
 
 		 906 bp  54  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2043    87.27 
 
 		 2389 bp  54  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153153  hitchhiker  0.00767267 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1703    94.12 
 
 		 641 bp  52  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  93.94 
 
 		 936 bp  50.1  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>