68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8478 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8478    100 
 
 		 102 bp  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.744353  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3544    86.14 
 
 		 802 bp  89.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  90.57 
 
 		 849 bp  65.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  90.57 
 
 		 849 bp  65.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1608    91.49 
 
 		 916 bp  61.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  91.49 
 
 		 915 bp  61.9  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4953  integrase catalytic region  90 
 
 		 852 bp  60  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1141  integrase catalytic region  88.89 
 
 		 552 bp  60  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.555646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2492    88.46 
 
 		 565 bp  56  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.552533  normal  0.0258476 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2741  Integrase catalytic region  96.67 
 
 		 450 bp  52  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0894729  normal  0.05514 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  96.67 
 
 		 906 bp  52  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  96.67 
 
 		 906 bp  52  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  96.67 
 
 		 906 bp  52  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  96.67 
 
 		 906 bp  52  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  88 
 
 		 849 bp  52  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  88 
 
 		 849 bp  52  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  96.43 
 
 		 915 bp  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2932  IS629, transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.529947  hitchhiker  0.00000000000000217145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1170  IS629, transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1303  IS629, transposase orfB  96.3 
 
 		 888 bp  46.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1379  IS629, transposase orfB  96.3 
 
 		 888 bp  46.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.822294  normal  0.0945096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1657  IS629, transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000216946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2286  IS629, transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292769  hitchhiker  5.1383e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2492  IS629, transposase orfB  96.3 
 
 		 888 bp  46.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2665  transposase  96.3 
 
 		 690 bp  46.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236219 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2680  IS629, transposase orfB  96.3 
 
 		 888 bp  46.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00648038  normal  0.0200158 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2789  IS629, transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2843  IS629, transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.69714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1178  IS629, transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3232  IS629, transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.312429  hitchhiker  0.000944743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3386  IS629, transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3516  IS629, transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3874  IS629, transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4591  IS629, transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0024    96.3 
 
 		 447 bp  46.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.105629  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0017    96.3 
 
 		 447 bp  46.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.473155  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0056    96.3 
 
 		 447 bp  46.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0468813  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0016  IS629, transposase orfB, truncation  96.3 
 
 		 447 bp  46.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  96.3 
 
 		 915 bp  46.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6152    96.3 
 
 		 249 bp  46.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.897664 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0102  IS629, transposase orfB  96.3 
 
 		 888 bp  46.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4771  IS1203 transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0988  IS629 transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1592  IS629 transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1924  IS629 transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.454462  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4642  IS629 transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4763  IS1203 transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0059    96.3 
 
 		 669 bp  46.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0081    96.3 
 
 		 669 bp  46.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000841675  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0134  IS629 transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0208  IS629 transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0231  IS1203 transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117658  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0247  IS629 transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45525  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4840    96.3 
 
 		 447 bp  46.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0273512  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0035  IS629, transposase orfB  96.3 
 
 		 888 bp  46.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0041  IS629, transposase orfB  96.3 
 
 		 888 bp  46.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0291  IS629, transposase orfB  96.3 
 
 		 891 bp  46.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.638063 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1636    88.1 
 
 		 906 bp  44.1  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138484  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 900 bp  44.1  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  100 
 
 		 900 bp  44.1  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  86 
 
 		 852 bp  44.1  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1719    86 
 
 		 473 bp  44.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184214  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>