55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_D0056 on replicon NC_009788
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1657  IS629, transposase orfB  95.3 
 
 		 891 bp  720    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000216946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0231  IS1203 transposase orfB  99.33 
 
 		 891 bp  862    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117658  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  99.55 
 
 		 891 bp  870    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0016  IS629, transposase orfB, truncation  99.78 
 
 		 447 bp  878    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0035  IS629, transposase orfB  93.74 
 
 		 888 bp  664    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0041  IS629, transposase orfB  95.08 
 
 		 888 bp  712    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0102  IS629, transposase orfB  94.18 
 
 		 888 bp  680    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0291  IS629, transposase orfB  95.3 
 
 		 891 bp  720    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.638063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1170  IS629, transposase orfB  95.3 
 
 		 891 bp  720    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1178  IS629, transposase orfB  95.3 
 
 		 891 bp  720    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1303  IS629, transposase orfB  93.74 
 
 		 888 bp  664    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1379  IS629, transposase orfB  93.74 
 
 		 888 bp  664    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.822294  normal  0.0945096 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0247  IS629 transposase orfB  99.33 
 
 		 891 bp  862    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2286  IS629, transposase orfB  95.3 
 
 		 891 bp  720    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292769  hitchhiker  5.1383e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2492  IS629, transposase orfB  93.74 
 
 		 888 bp  664    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2680  IS629, transposase orfB  93.74 
 
 		 888 bp  664    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00648038  normal  0.0200158 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2789  IS629, transposase orfB  95.3 
 
 		 891 bp  720    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2843  IS629, transposase orfB  95.3 
 
 		 891 bp  720    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.69714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2932  IS629, transposase orfB  95.3 
 
 		 891 bp  720    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.529947  hitchhiker  0.00000000000000217145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3232  IS629, transposase orfB  95.3 
 
 		 891 bp  720    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.312429  hitchhiker  0.000944743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3386  IS629, transposase orfB  95.3 
 
 		 891 bp  720    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3516  IS629, transposase orfB  95.3 
 
 		 891 bp  720    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3874  IS629, transposase orfB  95.3 
 
 		 891 bp  720    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4591  IS629, transposase orfB  95.3 
 
 		 891 bp  720    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1924  IS629 transposase orfB  99.11 
 
 		 891 bp  854    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.454462  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  95.3 
 
 		 891 bp  720    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4771  IS1203 transposase orfB  95.3 
 
 		 891 bp  720    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  96.87 
 
 		 891 bp  775    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0102  IS629 transposase orfB  98.66 
 
 		 888 bp  839    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0471323  hitchhiker  0.000157883 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0988  IS629 transposase orfB  99.33 
 
 		 891 bp  862    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  99.55 
 
 		 891 bp  870    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4840    99.78 
 
 		 447 bp  878    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0273512  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  99.33 
 
 		 891 bp  862    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1592  IS629 transposase orfB  99.33 
 
 		 891 bp  862    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  98.43 
 
 		 891 bp  831    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4642  IS629 transposase orfB  99.33 
 
 		 891 bp  862    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4763  IS1203 transposase orfB  99.11 
 
 		 891 bp  854    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0024    95.3 
 
 		 447 bp  720    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.105629  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0059    99.33 
 
 		 669 bp  862    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0081    99.33 
 
 		 669 bp  862    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000841675  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0017    95.3 
 
 		 447 bp  720    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.473155  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0134  IS629 transposase orfB  99.33 
 
 		 891 bp  862    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0208  IS629 transposase orfB  99.33 
 
 		 891 bp  862    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0056    100 
 
 		 447 bp  886    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0468813  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1390  transposase  99.54 
 
 		 249 bp  422  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.185969 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2665  transposase  90.68 
 
 		 690 bp  293  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236219 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4874  IS629, transposase orfB, truncation  96.4 
 
 		 111 bp  188  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0007  hypothetical protein  93.26 
 
 		 123 bp  129  7e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1241    100 
 
 		 435 bp  69.9  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.571069  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0033    97.14 
 
 		 135 bp  61.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3103    86.89 
 
 		 322 bp  58  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1608    96.3 
 
 		 916 bp  46.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8478    96.3 
 
 		 102 bp  46.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.744353  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  96.3 
 
 		 915 bp  46.1  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  96.3 
 
 		 915 bp  46.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>