59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0081 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_1170  IS629, transposase orfB  95.67 
 
 
891 bp  1096    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0059    100 
 
 
669 bp  1326    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0134  IS629 transposase orfB  99.25 
 
 
891 bp  1287    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0208  IS629 transposase orfB  99.1 
 
 
891 bp  1279    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  99.1 
 
 
891 bp  1279    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0231  IS1203 transposase orfB  99.25 
 
 
891 bp  1287    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117658  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0247  IS629 transposase orfB  99.25 
 
 
891 bp  1287    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45525  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  99.25 
 
 
891 bp  1287    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3516  IS629, transposase orfB  95.67 
 
 
891 bp  1096    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0035  IS629, transposase orfB  94.02 
 
 
888 bp  1009    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0041  IS629, transposase orfB  95.52 
 
 
888 bp  1088    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0102  IS629, transposase orfB  94.17 
 
 
888 bp  1017    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0291  IS629, transposase orfB  95.67 
 
 
891 bp  1096    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.638063 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0081    100 
 
 
669 bp  1326    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000841675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1178  IS629, transposase orfB  95.67 
 
 
891 bp  1096    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1303  IS629, transposase orfB  94.02 
 
 
888 bp  1009    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1379  IS629, transposase orfB  94.02 
 
 
888 bp  1009    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.822294  normal  0.0945096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1657  IS629, transposase orfB  95.67 
 
 
891 bp  1096    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000216946  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2286  IS629, transposase orfB  95.67 
 
 
891 bp  1096    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292769  hitchhiker  5.1383e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2492  IS629, transposase orfB  94.02 
 
 
888 bp  1009    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2680  IS629, transposase orfB  94.02 
 
 
888 bp  1009    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00648038  normal  0.0200158 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2789  IS629, transposase orfB  95.67 
 
 
891 bp  1096    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194228  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2843  IS629, transposase orfB  95.67 
 
 
891 bp  1096    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.69714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2932  IS629, transposase orfB  95.67 
 
 
891 bp  1096    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.529947  hitchhiker  0.00000000000000217145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3232  IS629, transposase orfB  95.67 
 
 
891 bp  1096    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.312429  hitchhiker  0.000944743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3386  IS629, transposase orfB  95.67 
 
 
891 bp  1096    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  96.11 
 
 
891 bp  1120    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0016  IS629, transposase orfB, truncation  99.55 
 
 
447 bp  870    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0056    99.33 
 
 
447 bp  862    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0468813  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0017    94.63 
 
 
447 bp  696    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.473155  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0024    94.63 
 
 
447 bp  696    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.105629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4840    99.55 
 
 
447 bp  870    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0273512  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0102  IS629 transposase orfB  97.76 
 
 
888 bp  1207    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0471323  hitchhiker  0.000157883 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4771  IS1203 transposase orfB  95.67 
 
 
891 bp  1096    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220432  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  97.46 
 
 
891 bp  1191    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4591  IS629, transposase orfB  95.67 
 
 
891 bp  1096    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987029  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  99.25 
 
 
891 bp  1287    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4763  IS1203 transposase orfB  99.1 
 
 
891 bp  1279    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4642  IS629 transposase orfB  99.25 
 
 
891 bp  1287    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1924  IS629 transposase orfB  99.1 
 
 
891 bp  1279    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.454462  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  98.36 
 
 
891 bp  1239    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1592  IS629 transposase orfB  99.25 
 
 
891 bp  1287    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3874  IS629, transposase orfB  95.52 
 
 
891 bp  1088    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0988  IS629 transposase orfB  99.25 
 
 
891 bp  1287    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2665  transposase  92.36 
 
 
690 bp  630  1e-178  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236219 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1390  transposase  100 
 
 
249 bp  430  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.185969 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4842    99.49 
 
 
480 bp  381  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.553346  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0015    97.45 
 
 
480 bp  349  6e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0026    96.43 
 
 
480 bp  333  4e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.144429  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0054    96.43 
 
 
480 bp  333  4e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0481234  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0214    99.32 
 
 
564 bp  281  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4874  IS629, transposase orfB, truncation  96.4 
 
 
111 bp  188  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0007  hypothetical protein  93.26 
 
 
123 bp  129  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0019  hypothetical protein  100 
 
 
204 bp  115  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.692933  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0018  IS629, transposase orfB, truncation  97.83 
 
 
111 bp  83.8  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.483075  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1241    100 
 
 
435 bp  69.9  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.571069  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0033    97.14 
 
 
135 bp  61.9  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3103    86.89 
 
 
322 bp  58  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7300    90.24 
 
 
562 bp  50.1  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130484  hitchhiker  0.00884242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>