29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3103 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3103    100 
 
 		 322 bp  638    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2665  transposase  84.71 
 
 		 690 bp  65.9  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236219 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2492  IS629, transposase orfB  84.71 
 
 		 888 bp  65.9  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0102  IS629, transposase orfB  84.71 
 
 		 888 bp  65.9  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0035  IS629, transposase orfB  84.71 
 
 		 888 bp  65.9  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  87.1 
 
 		 891 bp  60  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0081    86.89 
 
 		 669 bp  58  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000841675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2680  IS629, transposase orfB  83.53 
 
 		 888 bp  58  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00648038  normal  0.0200158 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1379  IS629, transposase orfB  83.53 
 
 		 888 bp  58  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.822294  normal  0.0945096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1303  IS629, transposase orfB  83.53 
 
 		 888 bp  58  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  86.89 
 
 		 891 bp  58  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0247  IS629 transposase orfB  86.89 
 
 		 891 bp  58  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45525  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0231  IS1203 transposase orfB  86.89 
 
 		 891 bp  58  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117658  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  86.89 
 
 		 891 bp  58  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0208  IS629 transposase orfB  86.89 
 
 		 891 bp  58  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0134  IS629 transposase orfB  86.89 
 
 		 891 bp  58  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0016  IS629, transposase orfB, truncation  86.89 
 
 		 447 bp  58  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0059    86.89 
 
 		 669 bp  58  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4763  IS1203 transposase orfB  86.89 
 
 		 891 bp  58  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4642  IS629 transposase orfB  86.89 
 
 		 891 bp  58  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1924  IS629 transposase orfB  86.89 
 
 		 891 bp  58  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.454462  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  86.89 
 
 		 891 bp  58  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1592  IS629 transposase orfB  86.89 
 
 		 891 bp  58  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  86.89 
 
 		 891 bp  58  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0988  IS629 transposase orfB  86.89 
 
 		 891 bp  58  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  86.89 
 
 		 891 bp  58  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0102  IS629 transposase orfB  86.89 
 
 		 888 bp  58  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0471323  hitchhiker  0.000157883 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4840    86.89 
 
 		 447 bp  58  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0273512  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0056    86.89 
 
 		 447 bp  58  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0468813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>