More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1240 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  100 
 
 
296 aa  614  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  100 
 
 
296 aa  614  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  100 
 
 
296 aa  614  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1664  IS1203 transposase orfB  99.32 
 
 
296 aa  610  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0208  IS629 transposase orfB  99.66 
 
 
296 aa  611  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0102  IS629 transposase orfB  98.98 
 
 
295 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0471323  hitchhiker  0.000157883 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  98.31 
 
 
296 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4771  IS1203 transposase orfB  97.64 
 
 
296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220432  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2258  IS629 transposase orfB  97.64 
 
 
296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1657  IS629, transposase orfB  97.64 
 
 
296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000216946  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0988  IS629 transposase orfB  97.97 
 
 
296 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1592  IS629 transposase orfB  97.97 
 
 
296 aa  601  1.0000000000000001e-171  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1170  IS629, transposase orfB  97.64 
 
 
296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1178  IS629, transposase orfB  97.64 
 
 
296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2286  IS629, transposase orfB  97.64 
 
 
296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292769  hitchhiker  5.1383e-16 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0291  IS629, transposase orfB  97.64 
 
 
296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.638063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4591  IS629, transposase orfB  97.64 
 
 
296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987029  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2789  IS629, transposase orfB  97.64 
 
 
296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194228  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2932  IS629, transposase orfB  97.64 
 
 
296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.529947  hitchhiker  0.00000000000000217145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2843  IS629, transposase orfB  97.64 
 
 
296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.69714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3232  IS629, transposase orfB  97.64 
 
 
296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.312429  hitchhiker  0.000944743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3386  IS629, transposase orfB  97.64 
 
 
296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3516  IS629, transposase orfB  97.64 
 
 
296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3874  IS629, transposase orfB  97.64 
 
 
296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0247  IS629 transposase orfB  97.64 
 
 
296 aa  599  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45525  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4642  IS629 transposase orfB  97.64 
 
 
296 aa  600  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1924  IS629 transposase orfB  97.64 
 
 
296 aa  600  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.454462  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4763  IS1203 transposase orfB  97.64 
 
 
296 aa  600  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0134  IS629 transposase orfB  97.64 
 
 
296 aa  599  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0231  IS1203 transposase orfB  97.3 
 
 
296 aa  597  1e-169  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117658  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0041  IS629, transposase orfB  97.29 
 
 
295 aa  596  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0035  IS629, transposase orfB  95.93 
 
 
295 aa  589  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0102  IS629, transposase orfB  95.93 
 
 
295 aa  590  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147873  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1303  IS629, transposase orfB  95.93 
 
 
295 aa  590  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2680  IS629, transposase orfB  95.93 
 
 
295 aa  590  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00648038  normal  0.0200158 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1379  IS629, transposase orfB  95.93 
 
 
295 aa  590  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.822294  normal  0.0945096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2492  IS629, transposase orfB  95.59 
 
 
295 aa  585  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2665  transposase  95.18 
 
 
229 aa  456  1e-127  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236219 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6463  integrase catalytic region  63.12 
 
 
301 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.666389 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6426  integrase catalytic region  63.12 
 
 
301 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1572  integrase, catalytic region  61.79 
 
 
301 aa  365  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2120  integrase, catalytic region  61.79 
 
 
301 aa  365  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.824405  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3846  integrase catalytic subunit  60.47 
 
 
301 aa  364  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2709  integrase catalytic subunit  61.54 
 
 
299 aa  362  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2937  integrase catalytic subunit  61.54 
 
 
299 aa  362  3e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  0.799386 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9838  transposase  59.47 
 
 
301 aa  360  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9898  transposase  59.47 
 
 
301 aa  360  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4212  integrase catalytic subunit  59.47 
 
 
301 aa  358  6e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.955324  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1426  Integrase catalytic region  61.49 
 
 
304 aa  352  4e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0450418  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5725  integrase catalytic region  59.53 
 
 
303 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3162  integrase catalytic subunit  57.48 
 
 
301 aa  349  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.116464  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3705  integrase catalytic region  59.93 
 
 
301 aa  349  4e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3736  integrase catalytic region  59.93 
 
 
301 aa  349  4e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5122  integrase catalytic subunit  63.44 
 
 
282 aa  347  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5204  integrase catalytic subunit  63.44 
 
 
282 aa  347  1e-94  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.184454  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5064  integrase catalytic region  63.77 
 
 
284 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4441  integrase catalytic region  63.77 
 
 
284 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5344  integrase catalytic region  63.77 
 
 
284 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438366  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5555  integrase catalytic region  63.77 
 
 
284 aa  345  7e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4953  integrase catalytic region  64.21 
 
 
283 aa  343  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3255  Integrase catalytic region  62.95 
 
 
283 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2820  Integrase catalytic region  58 
 
 
304 aa  342  5.999999999999999e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0907  integrase catalytic subunit  58.19 
 
 
304 aa  342  5.999999999999999e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0735  ISMca3, transposase, OrfB  64.21 
 
 
282 aa  334  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990065  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1896  ISMca3, transposase, OrfB  64.21 
 
 
282 aa  334  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0008  Integrase catalytic region  61.45 
 
 
285 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.230626  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1826  Integrase catalytic region  61.45 
 
 
285 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.0211966 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6067  transposase catalytic site ISRme15  61.45 
 
 
285 aa  323  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.415785 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5541  transposase catalytic site ISRme15  61.45 
 
 
285 aa  323  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0740  Integrase catalytic region  61.45 
 
 
285 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0332591  normal  0.114218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2977  Tn4652, transposase subunit B  57.58 
 
 
301 aa  318  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1663  Integrase catalytic region  59.47 
 
 
301 aa  318  5e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1597  Integrase catalytic region  59.47 
 
 
301 aa  318  5e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.369801  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1753  Integrase catalytic region  59.47 
 
 
301 aa  318  6e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.289897  normal  0.869594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2513  Integrase catalytic region  59.47 
 
 
301 aa  318  7.999999999999999e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0760  integrase catalytic subunit  64.34 
 
 
244 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0016  IS629, transposase orfB, truncation  99.32 
 
 
148 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02392  ISPsy21, transposase OrfB  61.29 
 
 
257 aa  297  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1216  Integrase catalytic region  53.29 
 
 
311 aa  295  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13132  transposase  52.41 
 
 
294 aa  289  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000174572  normal  0.138383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13357  transposase  52.41 
 
 
294 aa  289  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.77516e-37  normal  0.294919 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13206  transposase  52.41 
 
 
294 aa  289  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.3114300000000003e-18  normal  0.570802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12828  transposase  52.41 
 
 
294 aa  289  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.44608e-31  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11773  transposase  52.41 
 
 
294 aa  289  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.63075e-23  hitchhiker  0.0000000024473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12416  transposase  52.41 
 
 
294 aa  289  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.46754e-28  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12381  transposase  52.41 
 
 
294 aa  289  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.55066e-37  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12048  transposase  52.41 
 
 
294 aa  289  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.2114e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12378  transposase  52.41 
 
 
294 aa  289  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.6977900000000003e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12114  hypothetical protein  52.41 
 
 
294 aa  289  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.76426e-46  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11806  transposase  52.41 
 
 
294 aa  289  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.55346e-33  hitchhiker  0.00499729 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11792  transposase  52.41 
 
 
294 aa  289  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.87208e-50  hitchhiker  0.00000308071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11785  transposase  52.41 
 
 
294 aa  289  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.8775e-79  hitchhiker  0.0000000184324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11780  transposase  52.41 
 
 
294 aa  289  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.89938e-72  hitchhiker  0.00000000193173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10852  transposase  52.41 
 
 
294 aa  289  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.901690000000001e-44  decreased coverage  0.0000000161998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11739  transposase  52.41 
 
 
294 aa  289  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.46568e-46  normal  0.519629 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3483  Integrase catalytic region  54.98 
 
 
301 aa  288  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00971742  hitchhiker  0.00375901 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2528  Integrase catalytic region  54.98 
 
 
301 aa  288  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000564647  hitchhiker  0.00383779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3608  Integrase catalytic region  54.98 
 
 
301 aa  288  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0251528  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2222  integrase catalytic subunit  54.55 
 
 
278 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21419  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11348  transposase  53.82 
 
 
278 aa  285  4e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  4.0645000000000005e-27  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>