128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1241 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04146  IS911 orfA-like protein  99.44 
 
 		 840 bp  692    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0128    99.17 
 
 		 840 bp  684    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0251    99.17 
 
 		 840 bp  684    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.981409  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0689    99.44 
 
 		 840 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000564033  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0697    100 
 
 		 765 bp  710    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000144069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0717    99.44 
 
 		 840 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.194126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0907    99.44 
 
 		 840 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0188998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1019    99.44 
 
 		 840 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1241    100 
 
 		 435 bp  862    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.571069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1300    99.44 
 
 		 840 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1362    99.44 
 
 		 840 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1639    99.44 
 
 		 840 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04110  hypothetical protein  99.44 
 
 		 906 bp  692    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1686    99.42 
 
 		 417 bp  660    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00193131  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1694    99.44 
 
 		 840 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0579778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1925  IS911, transposase orfB  99.44 
 
 		 522 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741704  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2160    99.44 
 
 		 840 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0153197  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2275    99.44 
 
 		 840 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2308    99.44 
 
 		 840 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2429  IS911, transposase orfB  99.44 
 
 		 840 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2513    99.44 
 
 		 840 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2599    99.44 
 
 		 840 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2604    99.44 
 
 		 840 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2733    99.44 
 
 		 840 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2981    99.44 
 
 		 840 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0145761  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3018    99.17 
 
 		 840 bp  684    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3110    99.44 
 
 		 840 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3300    99.17 
 
 		 840 bp  684    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4080    99.44 
 
 		 840 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4617    99.44 
 
 		 840 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.418974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4639    99.44 
 
 		 840 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4756    99.44 
 
 		 840 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4926    99.44 
 
 		 819 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0069    99.44 
 
 		 822 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000143037  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0232    99.44 
 
 		 840 bp  692    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.135154  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3326    97.97 
 
 		 417 bp  620  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.783676  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0737    94.44 
 
 		 839 bp  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1563    100 
 
 		 726 bp  535  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1668    100 
 
 		 726 bp  535  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.712309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1769    100 
 
 		 726 bp  535  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.680483  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4762    100 
 
 		 726 bp  535  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0089    100 
 
 		 726 bp  535  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.927604  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0304    100 
 
 		 726 bp  535  1e-150  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0580008  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3715    94.17 
 
 		 836 bp  533  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4661  hypothetical protein  99.26 
 
 		 540 bp  511  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4859    94.19 
 
 		 440 bp  509  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0224    100 
 
 		 744 bp  464  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1593    100 
 
 		 609 bp  321  9e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04151    95.88 
 
 		 597 bp  313  2e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04114  hypothetical protein  95.88 
 
 		 597 bp  313  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0016    85.67 
 
 		 840 bp  295  5e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0881    84.82 
 
 		 1169 bp  256  5.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0033    97.4 
 
 		 135 bp  137  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0057  hypothetical protein  100 
 
 		 1773 bp  117  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0209487  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0135    100 
 
 		 288 bp  117  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0107  hypothetical protein  100 
 
 		 255 bp  83.8  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0092  integrase core subunit  92.86 
 
 		 747 bp  79.8  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.322057  hitchhiker  0.00000000362054 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5034  IS911 transposase orfB  91.53 
 
 		 747 bp  77.8  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1101  IS911 transposase orfB  91.53 
 
 		 747 bp  77.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3516  IS629, transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2843  IS629, transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.69714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2789  IS629, transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.194228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2932  IS629, transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.529947  hitchhiker  0.00000000000000217145 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3386  IS629, transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3232  IS629, transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.312429  hitchhiker  0.000944743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1657  IS629, transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000216946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1390  transposase  100 
 
 		 249 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.185969 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4591  IS629, transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0041  IS629, transposase orfB  100 
 
 		 888 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1170  IS629, transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.563398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0291  IS629, transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.638063 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3874  IS629, transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.816642 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0016  IS629, transposase orfB, truncation  100 
 
 		 447 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0056    100 
 
 		 447 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0468813  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0017    100 
 
 		 447 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.473155  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0024    100 
 
 		 447 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.105629  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4840    100 
 
 		 447 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0273512  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4874  IS629, transposase orfB, truncation  100 
 
 		 111 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0102  IS629 transposase orfB  100 
 
 		 888 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0471323  hitchhiker  0.000157883 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0305  IS911 transposase orfB  89.83 
 
 		 747 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0472068  hitchhiker  0.00100252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1889  IS911 transposase orfB  89.83 
 
 		 540 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394293 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4465  IS3 family transposase orfB  89.83 
 
 		 747 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0426441  normal  0.0135064 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4771  IS1203 transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4791  IS1203 transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.2388 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0988  IS629 transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1240  IS1203 transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.605  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1592  IS629 transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1924  IS629 transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.454462  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4642  IS629 transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.835933  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4763  IS1203 transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2286  IS629, transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.292769  hitchhiker  5.1383e-16 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0059    100 
 
 		 669 bp  69.9  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0081    100 
 
 		 669 bp  69.9  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000841675  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0134  IS629 transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0208  IS629 transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0221  IS629 transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0231  IS1203 transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0117658  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0247  IS629 transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45525  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0297  IS629 transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000478745  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1178  IS629, transposase orfB  100 
 
 		 891 bp  69.9  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>