70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1593 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04146  IS911 orfA-like protein  99.47 
 
 		 840 bp  1104    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1238    100 
 
 		 459 bp  813    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4080    100 
 
 		 840 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1300    100 
 
 		 840 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1362    100 
 
 		 840 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1563    100 
 
 		 726 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1593    100 
 
 		 609 bp  1207    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1639    100 
 
 		 840 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1668    100 
 
 		 726 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.712309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3300    99.82 
 
 		 840 bp  1120    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1694    100 
 
 		 840 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0579778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1769    100 
 
 		 726 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.680483  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1019    100 
 
 		 840 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3110    100 
 
 		 840 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2160    100 
 
 		 840 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0153197  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2275    100 
 
 		 840 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2308    100 
 
 		 840 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2429  IS911, transposase orfB  100 
 
 		 840 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.275532  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2513    100 
 
 		 840 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2599    100 
 
 		 840 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2604    100 
 
 		 840 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2733    100 
 
 		 840 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2981    100 
 
 		 840 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0145761  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3018    100 
 
 		 840 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3328    97.78 
 
 		 429 bp  648    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04151    98.65 
 
 		 597 bp  961    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04114  hypothetical protein  98.65 
 
 		 597 bp  961    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3715    98.65 
 
 		 836 bp  961    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04110  hypothetical protein  99.47 
 
 		 906 bp  1104    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0304    100 
 
 		 726 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0580008  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0232    100 
 
 		 840 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.135154  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0089    100 
 
 		 726 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.927604  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0069    100 
 
 		 822 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000143037  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4926    100 
 
 		 819 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4762    100 
 
 		 726 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4756    100 
 
 		 840 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4639    99.82 
 
 		 840 bp  1120    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4617    100 
 
 		 840 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.418974  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0737    93.57 
 
 		 839 bp  817    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0128    99.82 
 
 		 840 bp  1120    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0224    100 
 
 		 744 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0251    99.82 
 
 		 840 bp  1120    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.981409  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0689    100 
 
 		 840 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000564033  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0697    100 
 
 		 765 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000144069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0717    100 
 
 		 840 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.194126  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0907    100 
 
 		 840 bp  1128    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0188998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1922    100 
 
 		 339 bp  615  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0016    88.22 
 
 		 840 bp  597  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0023    98.28 
 
 		 300 bp  535  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1925  IS911, transposase orfB  100 
 
 		 522 bp  498  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.741704  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4857    91.62 
 
 		 426 bp  472  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3349  IS911 orfA  91.62 
 
 		 426 bp  472  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0881    84.81 
 
 		 1169 bp  440  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1241    100 
 
 		 435 bp  321  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.571069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1686    100 
 
 		 417 bp  289  5e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00193131  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3326    98.63 
 
 		 417 bp  274  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.783676  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4859    95.89 
 
 		 440 bp  234  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4661  hypothetical protein  100 
 
 		 540 bp  141  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0209  transposase  100 
 
 		 228 bp  79.8  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3517  hypothetical protein  100 
 
 		 558 bp  79.8  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468021  hitchhiker  0.00928381 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3387  transporter, major facilitator family  100 
 
 		 558 bp  79.8  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0103  hypothetical protein  97.5 
 
 		 141 bp  71.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.17162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3830  integrase catalytic subunit  81.51 
 
 		 735 bp  61.9  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000883771 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0442  transposase OrfAB, subunit B  93.75 
 
 		 873 bp  48.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0732  transposase OrfAB, subunit B  93.75 
 
 		 873 bp  48.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0738  transposase OrfAB, subunit B  93.75 
 
 		 873 bp  48.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1386  transposase OrfAB, subunit B  93.75 
 
 		 873 bp  48.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2359  transposase OrfAB, subunit B  93.75 
 
 		 873 bp  48.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2665    91.67 
 
 		 7798 bp  48.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2667    91.67 
 
 		 5883 bp  48.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>